RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592956.1

SYT5-211, Transcript of synaptotagmin 5, humanhuman

TSL 2

Gene SYT5, Length 512 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5-211ENST00000592956 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.06■■■■■ 6.08
SYT5-211ENST00000592956 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.61■■■■■ 5.21
SYT5-211ENST00000592956 ABCC9O60706 1549 aa47.43■■■■■ 5.18
SYT5-211ENST00000592956 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.24■■■■■ 4.83
SYT5-211ENST00000592956 NACADO15069 1562 aa44.95■■■■■ 4.79
SYT5-211ENST00000592956 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.75■■■■■ 4.75
SYT5-211ENST00000592956 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.35■■■■■ 4.69
SYT5-211ENST00000592956 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.28■■■■■ 4.68
SYT5-211ENST00000592956 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.24■■■■■ 4.67
SYT5-211ENST00000592956 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.15■■■■■ 4.66
SYT5-211ENST00000592956 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
SYT5-211ENST00000592956 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.86■■■■■ 4.61
SYT5-211ENST00000592956 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.84■■■■■ 4.61
SYT5-211ENST00000592956 SCRIBQ14160 1630 aa43.37■■■■■ 4.53
SYT5-211ENST00000592956 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.34■■■■■ 4.53
SYT5-211ENST00000592956 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.86■■■■■ 4.45
SYT5-211ENST00000592956 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
SYT5-211ENST00000592956 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.72■■■■■ 4.43
SYT5-211ENST00000592956 NCAPD3P42695 1498 aa41.46■■■■■ 4.23
SYT5-211ENST00000592956 SMARCA4P51532 1647 aa41.39■■■■■ 4.22
SYT5-211ENST00000592956 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.36■■■■■ 4.21
SYT5-211ENST00000592956 SMARCA2P51531 1590 aa41.3■■■■■ 4.2
SYT5-211ENST00000592956 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
SYT5-211ENST00000592956 HMGXB3Q12766 1538 aa41.21■■■■■ 4.19
SYT5-211ENST00000592956 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
SYT5-211ENST00000592956 ERCC6Q03468 1493 aa40.99■■■■■ 4.15
SYT5-211ENST00000592956 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.97■■■■■ 4.15
SYT5-211ENST00000592956 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.87■■■■■ 4.13
SYT5-211ENST00000592956 CUX2O14529 1486 aa40.83■■■■■ 4.13
SYT5-211ENST00000592956 NESP48681 1621 aa40.76■■■■■ 4.12
SYT5-211ENST00000592956 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.61■■■■■ 4.09
SYT5-211ENST00000592956 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.55■■■■■ 4.08
SYT5-211ENST00000592956 WIZO95785 1651 aa40.42■■■■■ 4.06
SYT5-211ENST00000592956 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
SYT5-211ENST00000592956 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.31■■■■■ 4.04
SYT5-211ENST00000592956 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.31■■■■■ 4.04
SYT5-211ENST00000592956 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.22■■■■■ 4.03
SYT5-211ENST00000592956 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4
SYT5-211ENST00000592956 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.94■■■■□ 3.98
SYT5-211ENST00000592956 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
SYT5-211ENST00000592956 WDR62O43379 1518 aa39.84■■■■□ 3.97
SYT5-211ENST00000592956 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.83■■■■□ 3.97
SYT5-211ENST00000592956 CFTRP13569 1480 aa39.79■■■■□ 3.96
SYT5-211ENST00000592956 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.78■■■■□ 3.96
SYT5-211ENST00000592956 PRDM2Q13029 1718 aa39.51■■■■□ 3.91
SYT5-211ENST00000592956 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.44■■■■□ 3.9
SYT5-211ENST00000592956 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
SYT5-211ENST00000592956 TOPBP1Q92547 1522 aa39.04■■■■□ 3.84
SYT5-211ENST00000592956 IFT140Q96RY7 1462 aa39.02■■■■□ 3.84
SYT5-211ENST00000592956 ABCC8Q09428 1581 aa38.99■■■■□ 3.83
SYT5-211ENST00000592956 OSCARQ8IYS5 282 aa38.98■■■■□ 3.83
SYT5-211ENST00000592956 TRIM41Q8WV44 630 aa38.94■■■■□ 3.82
SYT5-211ENST00000592956 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.93■■■■□ 3.82
SYT5-211ENST00000592956 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
SYT5-211ENST00000592956 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
SYT5-211ENST00000592956 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
SYT5-211ENST00000592956 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
SYT5-211ENST00000592956 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.58■■■■□ 3.77
SYT5-211ENST00000592956 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.49■■■■□ 3.75
SYT5-211ENST00000592956 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.49■■■■□ 3.75
SYT5-211ENST00000592956 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.49■■■■□ 3.75
SYT5-211ENST00000592956 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.48■■■■□ 3.75
SYT5-211ENST00000592956 SOGA1O94964 1423 aa38.47■■■■□ 3.75
SYT5-211ENST00000592956 CHD1O14646 1710 aa38.46■■■■□ 3.75
SYT5-211ENST00000592956 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
SYT5-211ENST00000592956 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.43■■■■□ 3.74
SYT5-211ENST00000592956 CUX1P39880 1505 aa38.4■■■■□ 3.74
SYT5-211ENST00000592956 ARHGEF11O15085 1522 aa38.37■■■■□ 3.73
SYT5-211ENST00000592956 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.36■■■■□ 3.73
SYT5-211ENST00000592956 FBLN2P98095 1184 aa38.34■■■■□ 3.73
SYT5-211ENST00000592956 WDR97A6NE52 1622 aa38.34■■■■□ 3.73
SYT5-211ENST00000592956 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.22■■■■□ 3.71
SYT5-211ENST00000592956 GRIN2BQ13224 1484 aa38.14■■■■□ 3.7
SYT5-211ENST00000592956 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.69
SYT5-211ENST00000592956 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.08■■■■□ 3.69
SYT5-211ENST00000592956 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.06■■■■□ 3.68
SYT5-211ENST00000592956 PBRM1Q86U86 1689 aa38.04■■■■□ 3.68
SYT5-211ENST00000592956 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.02■■■■□ 3.68
SYT5-211ENST00000592956 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.01■■■■□ 3.67
SYT5-211ENST00000592956 SYNJ1O43426 1573 aa38.01■■■■□ 3.67
SYT5-211ENST00000592956 SYNJ2O15056 1496 aa37.99■■■■□ 3.67
SYT5-211ENST00000592956 ARAP1Q96P48 1450 aa37.98■■■■□ 3.67
SYT5-211ENST00000592956 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.97■■■■□ 3.67
SYT5-211ENST00000592956 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.94■■■■□ 3.66
SYT5-211ENST00000592956 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.89■■■■□ 3.66
SYT5-211ENST00000592956 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.86■■■■□ 3.65
SYT5-211ENST00000592956 TOP2BQ02880 1626 aa37.85■■■■□ 3.65
SYT5-211ENST00000592956 ADAMTS12P58397 1594 aa37.65■■■■□ 3.62
SYT5-211ENST00000592956 GRIN2AQ12879 1464 aa37.64■■■■□ 3.62
SYT5-211ENST00000592956 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
SYT5-211ENST00000592956 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.54■■■■□ 3.6
SYT5-211ENST00000592956 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.54■■■■□ 3.6
SYT5-211ENST00000592956 CEP170Q5SW79 1584 aa37.5■■■■□ 3.59
SYT5-211ENST00000592956 NUP160Q12769 1436 aa37.49■■■■□ 3.59
SYT5-211ENST00000592956 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.37■■■■□ 3.57
SYT5-211ENST00000592956 SHROOM2Q13796 1616 aa37.33■■■■□ 3.57
SYT5-211ENST00000592956 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
SYT5-211ENST00000592956 KIF27Q86VH2 1401 aa37.12■■■■□ 3.53
SYT5-211ENST00000592956 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.12■■■■□ 3.53
SYT5-211ENST00000592956 JPH4Q96JJ6 628 aa37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms