RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.96■■■■□ 3.03
CTIF-211ENST00000592658 ABCC9O60706 1549 aa31.21■■■□□ 2.59
CTIF-211ENST00000592658 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.71■■■□□ 2.51
CTIF-211ENST00000592658 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.82■■■□□ 2.36
CTIF-211ENST00000592658 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.47■■■□□ 2.31
CTIF-211ENST00000592658 NACADO15069 1562 aa29.16■■■□□ 2.26
CTIF-211ENST00000592658 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.22
CTIF-211ENST00000592658 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.83■■■□□ 2.21
CTIF-211ENST00000592658 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.77■■■□□ 2.2
CTIF-211ENST00000592658 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.71■■■□□ 2.19
CTIF-211ENST00000592658 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.63■■■□□ 2.17
CTIF-211ENST00000592658 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.25■■■□□ 2.11
CTIF-211ENST00000592658 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.2■■■□□ 2.1
CTIF-211ENST00000592658 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.19■■■□□ 2.1
CTIF-211ENST00000592658 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.05■■■□□ 2.08
CTIF-211ENST00000592658 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CTIF-211ENST00000592658 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CTIF-211ENST00000592658 SCRIBQ14160 1630 aa27.92■■■□□ 2.06
CTIF-211ENST00000592658 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.76■■■□□ 2.03
CTIF-211ENST00000592658 CUX2O14529 1486 aa27.16■■□□□ 1.94
CTIF-211ENST00000592658 ERCC6Q03468 1493 aa26.96■■□□□ 1.91
CTIF-211ENST00000592658 NCAPD3P42695 1498 aa26.95■■□□□ 1.91
CTIF-211ENST00000592658 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.78■■□□□ 1.88
CTIF-211ENST00000592658 HMGXB3Q12766 1538 aa26.7■■□□□ 1.86
CTIF-211ENST00000592658 NESP48681 1621 aa26.68■■□□□ 1.86
CTIF-211ENST00000592658 SMARCA2P51531 1590 aa26.66■■□□□ 1.86
CTIF-211ENST00000592658 SMARCA4P51532 1647 aa26.61■■□□□ 1.85
CTIF-211ENST00000592658 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CTIF-211ENST00000592658 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CTIF-211ENST00000592658 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.41■■□□□ 1.82
CTIF-211ENST00000592658 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.38■■□□□ 1.81
CTIF-211ENST00000592658 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CTIF-211ENST00000592658 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.31■■□□□ 1.8
CTIF-211ENST00000592658 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.25■■□□□ 1.79
CTIF-211ENST00000592658 TRIM41Q8WV44 630 aa26.24■■□□□ 1.79
CTIF-211ENST00000592658 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.16■■□□□ 1.78
CTIF-211ENST00000592658 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.08■■□□□ 1.77
CTIF-211ENST00000592658 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.07■■□□□ 1.76
CTIF-211ENST00000592658 WDR62O43379 1518 aa26.05■■□□□ 1.76
CTIF-211ENST00000592658 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.85■■□□□ 1.73
CTIF-211ENST00000592658 WIZO95785 1651 aa25.8■■□□□ 1.72
CTIF-211ENST00000592658 OSCARQ8IYS5 282 aa25.78■■□□□ 1.72
CTIF-211ENST00000592658 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.78■■□□□ 1.72
CTIF-211ENST00000592658 CFTRP13569 1480 aa25.69■■□□□ 1.7
CTIF-211ENST00000592658 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CTIF-211ENST00000592658 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.55■■□□□ 1.68
CTIF-211ENST00000592658 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.55■■□□□ 1.68
CTIF-211ENST00000592658 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.55■■□□□ 1.68
CTIF-211ENST00000592658 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CTIF-211ENST00000592658 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CTIF-211ENST00000592658 ARHGEF11O15085 1522 aa25.41■■□□□ 1.66
CTIF-211ENST00000592658 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CTIF-211ENST00000592658 IFT140Q96RY7 1462 aa25.36■■□□□ 1.65
CTIF-211ENST00000592658 PRDM2Q13029 1718 aa25.35■■□□□ 1.65
CTIF-211ENST00000592658 TOPBP1Q92547 1522 aa25.24■■□□□ 1.63
CTIF-211ENST00000592658 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CTIF-211ENST00000592658 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.2■■□□□ 1.62
CTIF-211ENST00000592658 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.17■■□□□ 1.62
CTIF-211ENST00000592658 ARAP1Q96P48 1450 aa25.14■■□□□ 1.61
CTIF-211ENST00000592658 ABCC8Q09428 1581 aa25.13■■□□□ 1.61
CTIF-211ENST00000592658 CHD1O14646 1710 aa25.12■■□□□ 1.61
CTIF-211ENST00000592658 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.1■■□□□ 1.61
CTIF-211ENST00000592658 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CTIF-211ENST00000592658 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.6
CTIF-211ENST00000592658 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CTIF-211ENST00000592658 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
CTIF-211ENST00000592658 FBLN2P98095 1184 aa24.94■■□□□ 1.58
CTIF-211ENST00000592658 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.86■■□□□ 1.57
CTIF-211ENST00000592658 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.85■■□□□ 1.57
CTIF-211ENST00000592658 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CTIF-211ENST00000592658 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.81■■□□□ 1.56
CTIF-211ENST00000592658 SOGA1O94964 1423 aa24.79■■□□□ 1.56
CTIF-211ENST00000592658 WDR97A6NE52 1622 aa24.78■■□□□ 1.56
CTIF-211ENST00000592658 SYNJ1O43426 1573 aa24.74■■□□□ 1.55
CTIF-211ENST00000592658 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CTIF-211ENST00000592658 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CTIF-211ENST00000592658 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CTIF-211ENST00000592658 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.7■■□□□ 1.54
CTIF-211ENST00000592658 SYNJ2O15056 1496 aa24.65■■□□□ 1.54
CTIF-211ENST00000592658 GRIN2BQ13224 1484 aa24.65■■□□□ 1.54
CTIF-211ENST00000592658 CUX1P39880 1505 aa24.61■■□□□ 1.53
CTIF-211ENST00000592658 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.59■■□□□ 1.53
CTIF-211ENST00000592658 PBRM1Q86U86 1689 aa24.52■■□□□ 1.52
CTIF-211ENST00000592658 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.43■■□□□ 1.5
CTIF-211ENST00000592658 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.42■■□□□ 1.5
CTIF-211ENST00000592658 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.41■■□□□ 1.5
CTIF-211ENST00000592658 GRIN2AQ12879 1464 aa24.34■■□□□ 1.49
CTIF-211ENST00000592658 CEP170Q5SW79 1584 aa24.33■■□□□ 1.48
CTIF-211ENST00000592658 NUP160Q12769 1436 aa24.31■■□□□ 1.48
CTIF-211ENST00000592658 ADAMTS12P58397 1594 aa24.28■■□□□ 1.48
CTIF-211ENST00000592658 SHROOM2Q13796 1616 aa24.28■■□□□ 1.48
CTIF-211ENST00000592658 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.23■■□□□ 1.47
CTIF-211ENST00000592658 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.17■■□□□ 1.46
CTIF-211ENST00000592658 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
CTIF-211ENST00000592658 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.09■■□□□ 1.45
CTIF-211ENST00000592658 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
CTIF-211ENST00000592658 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.07■■□□□ 1.44
CTIF-211ENST00000592658 TOP2BQ02880 1626 aa24.06■■□□□ 1.44
CTIF-211ENST00000592658 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.04■■□□□ 1.44
CTIF-211ENST00000592658 JPH4Q96JJ6 628 aa24.01■■□□□ 1.43
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