RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592543.5

DENND1C-214, Transcript of DENN domain containing 1C, humanhuman

TSL 5

Gene DENND1C, Length 1,057 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1C-214ENST00000592543 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.45■■■■■ 7.43
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DENND1C-214ENST00000592543 ABCC9O60706 1549 aa54.7■■■■■ 6.35
DENND1C-214ENST00000592543 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.11■■■■■ 5.93
DENND1C-214ENST00000592543 NACADO15069 1562 aa51.85■■■■■ 5.89
DENND1C-214ENST00000592543 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.74■■■■■ 5.87
DENND1C-214ENST00000592543 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.25■■■■■ 5.79
DENND1C-214ENST00000592543 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.15■■■■■ 5.78
DENND1C-214ENST00000592543 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.04■■■■■ 5.76
DENND1C-214ENST00000592543 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.99■■■■■ 5.75
DENND1C-214ENST00000592543 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.96■■■■■ 5.75
DENND1C-214ENST00000592543 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.73■■■■■ 5.71
DENND1C-214ENST00000592543 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.69■■■■■ 5.71
DENND1C-214ENST00000592543 SCRIBQ14160 1630 aa50.12■■■■■ 5.61
DENND1C-214ENST00000592543 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.89■■■■■ 5.58
DENND1C-214ENST00000592543 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.39■■■■■ 5.5
DENND1C-214ENST00000592543 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.36■■■■■ 5.49
DENND1C-214ENST00000592543 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.2■■■■■ 5.47
DENND1C-214ENST00000592543 NCAPD3P42695 1498 aa47.92■■■■■ 5.26
DENND1C-214ENST00000592543 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.84■■■■■ 5.25
DENND1C-214ENST00000592543 SMARCA4P51532 1647 aa47.83■■■■■ 5.25
DENND1C-214ENST00000592543 SMARCA2P51531 1590 aa47.63■■■■■ 5.22
DENND1C-214ENST00000592543 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.62■■■■■ 5.21
DENND1C-214ENST00000592543 HMGXB3Q12766 1538 aa47.54■■■■■ 5.2
DENND1C-214ENST00000592543 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.4■■■■■ 5.18
DENND1C-214ENST00000592543 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.37■■■■■ 5.17
DENND1C-214ENST00000592543 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.33■■■■■ 5.17
DENND1C-214ENST00000592543 NESP48681 1621 aa47.12■■■■■ 5.13
DENND1C-214ENST00000592543 ERCC6Q03468 1493 aa47.11■■■■■ 5.13
DENND1C-214ENST00000592543 CUX2O14529 1486 aa46.91■■■■■ 5.1
DENND1C-214ENST00000592543 WIZO95785 1651 aa46.81■■■■■ 5.08
DENND1C-214ENST00000592543 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.73■■■■■ 5.07
DENND1C-214ENST00000592543 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.61■■■■■ 5.05
DENND1C-214ENST00000592543 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
DENND1C-214ENST00000592543 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.5■■■■■ 5.03
DENND1C-214ENST00000592543 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.48■■■■■ 5.03
DENND1C-214ENST00000592543 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.45■■■■■ 5.03
DENND1C-214ENST00000592543 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.43■■■■■ 5.02
DENND1C-214ENST00000592543 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
DENND1C-214ENST00000592543 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.05■■■■■ 4.96
DENND1C-214ENST00000592543 CFTRP13569 1480 aa46.03■■■■■ 4.96
DENND1C-214ENST00000592543 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.94■■■■■ 4.95
DENND1C-214ENST00000592543 WDR62O43379 1518 aa45.94■■■■■ 4.95
DENND1C-214ENST00000592543 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.92■■■■■ 4.94
DENND1C-214ENST00000592543 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.75■■■■■ 4.91
DENND1C-214ENST00000592543 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
DENND1C-214ENST00000592543 PRDM2Q13029 1718 aa45.45■■■■■ 4.87
DENND1C-214ENST00000592543 TOPBP1Q92547 1522 aa45.12■■■■■ 4.81
DENND1C-214ENST00000592543 IFT140Q96RY7 1462 aa45■■■■■ 4.79
DENND1C-214ENST00000592543 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.99■■■■■ 4.79
DENND1C-214ENST00000592543 ABCC8Q09428 1581 aa44.96■■■■■ 4.79
DENND1C-214ENST00000592543 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.94■■■■■ 4.78
DENND1C-214ENST00000592543 OSCARQ8IYS5 282 aa44.88■■■■■ 4.78
DENND1C-214ENST00000592543 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.73■■■■■ 4.75
DENND1C-214ENST00000592543 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
DENND1C-214ENST00000592543 TRIM41Q8WV44 630 aa44.69■■■■■ 4.74
DENND1C-214ENST00000592543 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
DENND1C-214ENST00000592543 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
DENND1C-214ENST00000592543 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.61■■■■■ 4.73
DENND1C-214ENST00000592543 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.56■■■■■ 4.72
DENND1C-214ENST00000592543 SOGA1O94964 1423 aa44.5■■■■■ 4.71
DENND1C-214ENST00000592543 CUX1P39880 1505 aa44.49■■■■■ 4.71
DENND1C-214ENST00000592543 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.45■■■■■ 4.71
DENND1C-214ENST00000592543 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
DENND1C-214ENST00000592543 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.25■■■■■ 4.67
DENND1C-214ENST00000592543 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.25■■■■■ 4.67
DENND1C-214ENST00000592543 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.25■■■■■ 4.67
DENND1C-214ENST00000592543 CHD1O14646 1710 aa44.25■■■■■ 4.67
DENND1C-214ENST00000592543 FBLN2P98095 1184 aa44.21■■■■■ 4.67
DENND1C-214ENST00000592543 ARHGEF11O15085 1522 aa44.15■■■■■ 4.66
DENND1C-214ENST00000592543 WDR97A6NE52 1622 aa44.15■■■■■ 4.66
DENND1C-214ENST00000592543 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.12■■■■■ 4.65
DENND1C-214ENST00000592543 GRIN2BQ13224 1484 aa44.03■■■■■ 4.64
DENND1C-214ENST00000592543 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
DENND1C-214ENST00000592543 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.95■■■■■ 4.63
DENND1C-214ENST00000592543 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.93■■■■■ 4.62
DENND1C-214ENST00000592543 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
DENND1C-214ENST00000592543 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.85■■■■■ 4.61
DENND1C-214ENST00000592543 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.85■■■■■ 4.61
DENND1C-214ENST00000592543 SYNJ2O15056 1496 aa43.84■■■■■ 4.61
DENND1C-214ENST00000592543 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.84■■■■■ 4.61
DENND1C-214ENST00000592543 PBRM1Q86U86 1689 aa43.84■■■■■ 4.61
DENND1C-214ENST00000592543 SYNJ1O43426 1573 aa43.83■■■■■ 4.61
DENND1C-214ENST00000592543 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.82■■■■■ 4.61
DENND1C-214ENST00000592543 TOP2BQ02880 1626 aa43.81■■■■■ 4.6
DENND1C-214ENST00000592543 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.81■■■■■ 4.6
DENND1C-214ENST00000592543 ARAP1Q96P48 1450 aa43.77■■■■■ 4.6
DENND1C-214ENST00000592543 GRIN2AQ12879 1464 aa43.48■■■■■ 4.55
DENND1C-214ENST00000592543 ADAMTS12P58397 1594 aa43.48■■■■■ 4.55
DENND1C-214ENST00000592543 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.39■■■■■ 4.54
DENND1C-214ENST00000592543 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.38■■■■■ 4.53
DENND1C-214ENST00000592543 CEP170Q5SW79 1584 aa43.33■■■■■ 4.53
DENND1C-214ENST00000592543 NUP160Q12769 1436 aa43.33■■■■■ 4.53
DENND1C-214ENST00000592543 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.23■■■■■ 4.51
DENND1C-214ENST00000592543 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
DENND1C-214ENST00000592543 SHROOM2Q13796 1616 aa43.08■■■■■ 4.49
DENND1C-214ENST00000592543 IGF1RP08069 1367 aa43.01■■■■■ 4.48
DENND1C-214ENST00000592543 KIF27Q86VH2 1401 aa42.96■■■■■ 4.47
DENND1C-214ENST00000592543 JPH4Q96JJ6 628 aa42.92■■■■■ 4.46
DENND1C-214ENST00000592543 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
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