RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592374.5

MUM1-215, Transcript of melanoma associated antigen (mutated) 1, humanhuman

TSL 2

Gene MUM1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUM1-215ENST00000592374 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.81■■■■■ 7.49
MUM1-215ENST00000592374 ABCC9O60706 1549 aa56.38■■■■■ 6.62
MUM1-215ENST00000592374 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.77■■■■■ 6.52
MUM1-215ENST00000592374 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.33■■■■■ 6.13
MUM1-215ENST00000592374 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.27■■■■■ 6.12
MUM1-215ENST00000592374 NACADO15069 1562 aa52.78■■■■■ 6.04
MUM1-215ENST00000592374 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.49■■■■■ 5.99
MUM1-215ENST00000592374 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.35■■■■■ 5.97
MUM1-215ENST00000592374 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.31■■■■■ 5.96
MUM1-215ENST00000592374 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.83■■■■■ 5.89
MUM1-215ENST00000592374 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.76■■■■■ 5.88
MUM1-215ENST00000592374 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.22■■■■■ 5.79
MUM1-215ENST00000592374 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.03■■■■■ 5.76
MUM1-215ENST00000592374 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.92■■■■■ 5.74
MUM1-215ENST00000592374 SCRIBQ14160 1630 aa50.91■■■■■ 5.74
MUM1-215ENST00000592374 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.89■■■■■ 5.74
MUM1-215ENST00000592374 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.78■■■■■ 5.72
MUM1-215ENST00000592374 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.61■■■■■ 5.69
MUM1-215ENST00000592374 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.24■■■■■ 5.47
MUM1-215ENST00000592374 ERCC6Q03468 1493 aa48.71■■■■■ 5.39
MUM1-215ENST00000592374 CUX2O14529 1486 aa48.7■■■■■ 5.39
MUM1-215ENST00000592374 NCAPD3P42695 1498 aa48.67■■■■■ 5.38
MUM1-215ENST00000592374 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.53■■■■■ 5.36
MUM1-215ENST00000592374 SMARCA4P51532 1647 aa48.43■■■■■ 5.34
MUM1-215ENST00000592374 SMARCA2P51531 1590 aa48.37■■■■■ 5.33
MUM1-215ENST00000592374 HMGXB3Q12766 1538 aa48.36■■■■■ 5.33
MUM1-215ENST00000592374 NESP48681 1621 aa48.28■■■■■ 5.32
MUM1-215ENST00000592374 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.09■■■■■ 5.29
MUM1-215ENST00000592374 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.03■■■■■ 5.28
MUM1-215ENST00000592374 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.91■■■■■ 5.26
MUM1-215ENST00000592374 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.85■■■■■ 5.25
MUM1-215ENST00000592374 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.76■■■■■ 5.24
MUM1-215ENST00000592374 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.72■■■■■ 5.23
MUM1-215ENST00000592374 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.68■■■■■ 5.22
MUM1-215ENST00000592374 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.45■■■■■ 5.19
MUM1-215ENST00000592374 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.19■■■■■ 5.14
MUM1-215ENST00000592374 WIZO95785 1651 aa47.16■■■■■ 5.14
MUM1-215ENST00000592374 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.15■■■■■ 5.14
MUM1-215ENST00000592374 WDR62O43379 1518 aa47.06■■■■■ 5.12
MUM1-215ENST00000592374 TRIM41Q8WV44 630 aa47.05■■■■■ 5.12
MUM1-215ENST00000592374 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.87■■■■■ 5.09
MUM1-215ENST00000592374 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.76■■■■■ 5.08
MUM1-215ENST00000592374 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.75■■■■■ 5.07
MUM1-215ENST00000592374 CFTRP13569 1480 aa46.56■■■■■ 5.04
MUM1-215ENST00000592374 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.03
MUM1-215ENST00000592374 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
MUM1-215ENST00000592374 OSCARQ8IYS5 282 aa46.33■■■■■ 5.01
MUM1-215ENST00000592374 PRDM2Q13029 1718 aa46.25■■■■■ 4.99
MUM1-215ENST00000592374 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.98■■■■■ 4.95
MUM1-215ENST00000592374 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.98■■■■■ 4.95
MUM1-215ENST00000592374 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.98■■■■■ 4.95
MUM1-215ENST00000592374 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.97■■■■■ 4.95
MUM1-215ENST00000592374 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.94■■■■■ 4.95
MUM1-215ENST00000592374 IFT140Q96RY7 1462 aa45.89■■■■■ 4.94
MUM1-215ENST00000592374 TOPBP1Q92547 1522 aa45.81■■■■■ 4.92
MUM1-215ENST00000592374 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
MUM1-215ENST00000592374 ARHGEF11O15085 1522 aa45.72■■■■■ 4.91
MUM1-215ENST00000592374 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.61■■■■■ 4.89
MUM1-215ENST00000592374 CHD1O14646 1710 aa45.57■■■■■ 4.89
MUM1-215ENST00000592374 ABCC8Q09428 1581 aa45.54■■■■■ 4.88
MUM1-215ENST00000592374 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
MUM1-215ENST00000592374 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.44■■■■■ 4.876e-16■■■■■ 45.6
MUM1-215ENST00000592374 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.37■■■■■ 4.85
MUM1-215ENST00000592374 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.3■■■■■ 4.84
MUM1-215ENST00000592374 FBLN2P98095 1184 aa45.28■■■■■ 4.84
MUM1-215ENST00000592374 ARAP1Q96P48 1450 aa45.24■■■■■ 4.83
MUM1-215ENST00000592374 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.19■■■■■ 4.82
MUM1-215ENST00000592374 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
MUM1-215ENST00000592374 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.08■■■■■ 4.81
MUM1-215ENST00000592374 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.8
MUM1-215ENST00000592374 SOGA1O94964 1423 aa45.03■■■■■ 4.8
MUM1-215ENST00000592374 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.01■■■■■ 4.8
MUM1-215ENST00000592374 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.98■■■■■ 4.79
MUM1-215ENST00000592374 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.89■■■■■ 4.78
MUM1-215ENST00000592374 WDR97A6NE52 1622 aa44.87■■■■■ 4.77
MUM1-215ENST00000592374 CUX1P39880 1505 aa44.84■■■■■ 4.77
MUM1-215ENST00000592374 SYNJ1O43426 1573 aa44.82■■■■■ 4.77
MUM1-215ENST00000592374 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.78■■■■■ 4.76
MUM1-215ENST00000592374 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.77■■■■■ 4.76
MUM1-215ENST00000592374 GRIN2BQ13224 1484 aa44.72■■■■■ 4.75
MUM1-215ENST00000592374 PBRM1Q86U86 1689 aa44.69■■■■■ 4.74
MUM1-215ENST00000592374 SYNJ2O15056 1496 aa44.66■■■■■ 4.74
MUM1-215ENST00000592374 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.51■■■■■ 4.72
MUM1-215ENST00000592374 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.42■■■■■ 4.7
MUM1-215ENST00000592374 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.35■■■■■ 4.69
MUM1-215ENST00000592374 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.23■■■■■ 4.67
MUM1-215ENST00000592374 GRIN2AQ12879 1464 aa44.18■■■■■ 4.66
MUM1-215ENST00000592374 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.17■■■■■ 4.66
MUM1-215ENST00000592374 ADAMTS12P58397 1594 aa44.16■■■■■ 4.66
MUM1-215ENST00000592374 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.12■■■■■ 4.65
MUM1-215ENST00000592374 CEP170Q5SW79 1584 aa44.11■■■■■ 4.65
MUM1-215ENST00000592374 TOP2BQ02880 1626 aa44.06■■■■■ 4.64
MUM1-215ENST00000592374 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.04■■■■■ 4.64
MUM1-215ENST00000592374 NUP160Q12769 1436 aa44.01■■■■■ 4.64
MUM1-215ENST00000592374 SHROOM2Q13796 1616 aa43.94■■■■■ 4.62
MUM1-215ENST00000592374 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.89■■■■■ 4.62
MUM1-215ENST00000592374 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.79■■■■■ 4.6
MUM1-215ENST00000592374 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.76■■■■■ 4.6
MUM1-215ENST00000592374 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
MUM1-215ENST00000592374 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.56■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms