RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592316.1

APLP1-211, Transcript of amyloid beta precursor like protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene APLP1, Length 1,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP1-211ENST00000592316 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.22■■■■■ 4.19
APLP1-211ENST00000592316 ABCC9O60706 1549 aa37.64■■■■□ 3.62
APLP1-211ENST00000592316 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.68■■■■□ 3.46
APLP1-211ENST00000592316 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.32■■■■□ 3.4
APLP1-211ENST00000592316 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.49■■■■□ 3.27
APLP1-211ENST00000592316 NACADO15069 1562 aa34.96■■■■□ 3.19
APLP1-211ENST00000592316 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.79■■■■□ 3.16
APLP1-211ENST00000592316 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.57■■■■□ 3.13
APLP1-211ENST00000592316 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
APLP1-211ENST00000592316 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.47■■■■□ 3.11
APLP1-211ENST00000592316 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.35■■■■□ 3.09
APLP1-211ENST00000592316 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.3■■■■□ 3.08
APLP1-211ENST00000592316 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.24■■■■□ 3.07
APLP1-211ENST00000592316 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.15■■■■□ 3.06
APLP1-211ENST00000592316 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.13■■■■□ 3.05
APLP1-211ENST00000592316 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.05■■■■□ 3.04
APLP1-211ENST00000592316 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.02■■■■□ 3.04
APLP1-211ENST00000592316 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
APLP1-211ENST00000592316 CUX2O14529 1486 aa33.16■■■□□ 2.9
APLP1-211ENST00000592316 SCRIBQ14160 1630 aa33.12■■■□□ 2.89
APLP1-211ENST00000592316 ERCC6Q03468 1493 aa32.71■■■□□ 2.83
APLP1-211ENST00000592316 TRIM41Q8WV44 630 aa32.3■■■□□ 2.76
APLP1-211ENST00000592316 NCAPD3P42695 1498 aa32.25■■■□□ 2.75
APLP1-211ENST00000592316 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
APLP1-211ENST00000592316 NESP48681 1621 aa31.94■■■□□ 2.7
APLP1-211ENST00000592316 HMGXB3Q12766 1538 aa31.92■■■□□ 2.7
APLP1-211ENST00000592316 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.91■■■□□ 2.7
APLP1-211ENST00000592316 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.9■■■□□ 2.7
APLP1-211ENST00000592316 SMARCA2P51531 1590 aa31.85■■■□□ 2.69
APLP1-211ENST00000592316 SMARCA4P51532 1647 aa31.79■■■□□ 2.68
APLP1-211ENST00000592316 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.76■■■□□ 2.67
APLP1-211ENST00000592316 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
APLP1-211ENST00000592316 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.74■■■□□ 2.67
APLP1-211ENST00000592316 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.62■■■□□ 2.65
APLP1-211ENST00000592316 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.58■■■□□ 2.65
APLP1-211ENST00000592316 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
APLP1-211ENST00000592316 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
APLP1-211ENST00000592316 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.52■■■□□ 2.64
APLP1-211ENST00000592316 WIZO95785 1651 aa31.44■■■□□ 2.62
APLP1-211ENST00000592316 OSCARQ8IYS5 282 aa31.41■■■□□ 2.62
APLP1-211ENST00000592316 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.34■■■□□ 2.61
APLP1-211ENST00000592316 WDR62O43379 1518 aa31.31■■■□□ 2.6
APLP1-211ENST00000592316 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
APLP1-211ENST00000592316 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.19■■■□□ 2.58
APLP1-211ENST00000592316 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.04■■■□□ 2.56
APLP1-211ENST00000592316 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.04■■■□□ 2.56
APLP1-211ENST00000592316 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.04■■■□□ 2.56
APLP1-211ENST00000592316 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.98■■■□□ 2.55
APLP1-211ENST00000592316 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
APLP1-211ENST00000592316 ARHGEF11O15085 1522 aa30.83■■■□□ 2.53
APLP1-211ENST00000592316 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.82■■■□□ 2.52
APLP1-211ENST00000592316 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.79■■■□□ 2.52
APLP1-211ENST00000592316 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
APLP1-211ENST00000592316 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.65■■■□□ 2.5
APLP1-211ENST00000592316 CFTRP13569 1480 aa30.57■■■□□ 2.48
APLP1-211ENST00000592316 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
APLP1-211ENST00000592316 IFT140Q96RY7 1462 aa30.44■■■□□ 2.46
APLP1-211ENST00000592316 ARAP1Q96P48 1450 aa30.39■■■□□ 2.45
APLP1-211ENST00000592316 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
APLP1-211ENST00000592316 PRDM2Q13029 1718 aa30.26■■■□□ 2.44
APLP1-211ENST00000592316 CHD1O14646 1710 aa30.21■■■□□ 2.43
APLP1-211ENST00000592316 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
APLP1-211ENST00000592316 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.13■■■□□ 2.41
APLP1-211ENST00000592316 ABCC8Q09428 1581 aa30.11■■■□□ 2.41
APLP1-211ENST00000592316 TOPBP1Q92547 1522 aa30.06■■■□□ 2.4
APLP1-211ENST00000592316 FBLN2P98095 1184 aa30.02■■■□□ 2.4
APLP1-211ENST00000592316 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
APLP1-211ENST00000592316 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.92■■■□□ 2.38
APLP1-211ENST00000592316 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
APLP1-211ENST00000592316 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.89■■■□□ 2.38
APLP1-211ENST00000592316 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.85■■■□□ 2.37
APLP1-211ENST00000592316 SYNJ1O43426 1573 aa29.8■■■□□ 2.36
APLP1-211ENST00000592316 TOP2BQ02880 1626 aa29.77■■■□□ 2.36
APLP1-211ENST00000592316 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.77■■■□□ 2.36
APLP1-211ENST00000592316 CUX1P39880 1505 aa29.74■■■□□ 2.35
APLP1-211ENST00000592316 WDR97A6NE52 1622 aa29.7■■■□□ 2.35
APLP1-211ENST00000592316 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
APLP1-211ENST00000592316 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
APLP1-211ENST00000592316 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.64■■■□□ 2.33
APLP1-211ENST00000592316 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
APLP1-211ENST00000592316 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.62■■■□□ 2.33
APLP1-211ENST00000592316 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
APLP1-211ENST00000592316 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
APLP1-211ENST00000592316 SOGA1O94964 1423 aa29.54■■■□□ 2.32
APLP1-211ENST00000592316 SYNJ2O15056 1496 aa29.51■■■□□ 2.31
APLP1-211ENST00000592316 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.5■■■□□ 2.31
APLP1-211ENST00000592316 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.5■■■□□ 2.31
APLP1-211ENST00000592316 GRIN2BQ13224 1484 aa29.46■■■□□ 2.31
APLP1-211ENST00000592316 EEA1Q15075 1411 aa29.37■■■□□ 2.29
APLP1-211ENST00000592316 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.33■■■□□ 2.29
APLP1-211ENST00000592316 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.3■■■□□ 2.28
APLP1-211ENST00000592316 KIF27Q86VH2 1401 aa29.24■■■□□ 2.27
APLP1-211ENST00000592316 PBRM1Q86U86 1689 aa29.23■■■□□ 2.27
APLP1-211ENST00000592316 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.17■■■□□ 2.26
APLP1-211ENST00000592316 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.16■■■□□ 2.26
APLP1-211ENST00000592316 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.14■■■□□ 2.26
APLP1-211ENST00000592316 CEP170Q5SW79 1584 aa29.12■■■□□ 2.25
APLP1-211ENST00000592316 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.09■■■□□ 2.25
APLP1-211ENST00000592316 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
APLP1-211ENST00000592316 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.08■■■□□ 2.25
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