RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592171.1

ZNF444-210, Transcript of zinc finger protein 444, humanhuman

TSL 3

Gene ZNF444, Length 688 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444-210ENST00000592171 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.41■■■■■ 6.46
ZNF444-210ENST00000592171 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.54■■■■■ 5.52
ZNF444-210ENST00000592171 ABCC9O60706 1549 aa49.12■■■■■ 5.45
ZNF444-210ENST00000592171 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.96■■■■■ 5.11
ZNF444-210ENST00000592171 NACADO15069 1562 aa46.77■■■■■ 5.08
ZNF444-210ENST00000592171 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.48■■■■■ 5.03
ZNF444-210ENST00000592171 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.33■■■■■ 5.01
ZNF444-210ENST00000592171 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.97■■■■■ 4.95
ZNF444-210ENST00000592171 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.91■■■■■ 4.94
ZNF444-210ENST00000592171 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.89■■■■■ 4.94
ZNF444-210ENST00000592171 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.85■■■■■ 4.93
ZNF444-210ENST00000592171 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.8■■■■■ 4.923e-6■■□□□ 14
ZNF444-210ENST00000592171 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.64■■■■■ 4.9
ZNF444-210ENST00000592171 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.08■■■■■ 4.81
ZNF444-210ENST00000592171 SCRIBQ14160 1630 aa45.05■■■■■ 4.8
ZNF444-210ENST00000592171 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
ZNF444-210ENST00000592171 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.42■■■■■ 4.7
ZNF444-210ENST00000592171 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.24■■■■■ 4.67
ZNF444-210ENST00000592171 NCAPD3P42695 1498 aa43.23■■■■■ 4.51
ZNF444-210ENST00000592171 SMARCA4P51532 1647 aa43.1■■■■■ 4.49
ZNF444-210ENST00000592171 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.09■■■■■ 4.49
ZNF444-210ENST00000592171 SMARCA2P51531 1590 aa42.97■■■■■ 4.47
ZNF444-210ENST00000592171 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
ZNF444-210ENST00000592171 HMGXB3Q12766 1538 aa42.87■■■■■ 4.45
ZNF444-210ENST00000592171 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.76■■■■■ 4.44
ZNF444-210ENST00000592171 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.67■■■■■ 4.42
ZNF444-210ENST00000592171 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
ZNF444-210ENST00000592171 ERCC6Q03468 1493 aa42.34■■■■■ 4.37
ZNF444-210ENST00000592171 NESP48681 1621 aa42.32■■■■■ 4.37
ZNF444-210ENST00000592171 CUX2O14529 1486 aa42.25■■■■■ 4.35
ZNF444-210ENST00000592171 WIZO95785 1651 aa42.14■■■■■ 4.34
ZNF444-210ENST00000592171 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.13■■■■■ 4.33
ZNF444-210ENST00000592171 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
ZNF444-210ENST00000592171 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.89■■■■■ 4.3
ZNF444-210ENST00000592171 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.89■■■■■ 4.3
ZNF444-210ENST00000592171 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.86■■■■■ 4.29
ZNF444-210ENST00000592171 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
ZNF444-210ENST00000592171 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.77■■■■■ 4.28
ZNF444-210ENST00000592171 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
ZNF444-210ENST00000592171 CFTRP13569 1480 aa41.5■■■■■ 4.23
ZNF444-210ENST00000592171 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.46■■■■■ 4.23
ZNF444-210ENST00000592171 WDR62O43379 1518 aa41.37■■■■■ 4.21
ZNF444-210ENST00000592171 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.35■■■■■ 4.21
ZNF444-210ENST00000592171 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.34■■■■■ 4.21
ZNF444-210ENST00000592171 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.21■■■■■ 4.19
ZNF444-210ENST00000592171 PRDM2Q13029 1718 aa41.04■■■■■ 4.16
ZNF444-210ENST00000592171 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
ZNF444-210ENST00000592171 TOPBP1Q92547 1522 aa40.63■■■■■ 4.1
ZNF444-210ENST00000592171 ABCC8Q09428 1581 aa40.61■■■■■ 4.09
ZNF444-210ENST00000592171 IFT140Q96RY7 1462 aa40.55■■■■■ 4.08
ZNF444-210ENST00000592171 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.5■■■■■ 4.07
ZNF444-210ENST00000592171 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
ZNF444-210ENST00000592171 OSCARQ8IYS5 282 aa40.41■■■■■ 4.06
ZNF444-210ENST00000592171 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
ZNF444-210ENST00000592171 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
ZNF444-210ENST00000592171 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
ZNF444-210ENST00000592171 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
ZNF444-210ENST00000592171 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.12■■■■■ 4.013e-9■■■■□ 20.2
ZNF444-210ENST00000592171 SOGA1O94964 1423 aa40.08■■■■■ 4.01
ZNF444-210ENST00000592171 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.06■■■■■ 4
ZNF444-210ENST00000592171 CUX1P39880 1505 aa40.06■■■■■ 4
ZNF444-210ENST00000592171 TRIM41Q8WV44 630 aa40.02■■■■■ 4
ZNF444-210ENST00000592171 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.01■■■■■ 4
ZNF444-210ENST00000592171 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
ZNF444-210ENST00000592171 WDR97A6NE52 1622 aa39.89■■■■□ 3.98
ZNF444-210ENST00000592171 CHD1O14646 1710 aa39.82■■■■□ 3.97
ZNF444-210ENST00000592171 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.77■■■■□ 3.96
ZNF444-210ENST00000592171 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.77■■■■□ 3.96
ZNF444-210ENST00000592171 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.77■■■■□ 3.96
ZNF444-210ENST00000592171 FBLN2P98095 1184 aa39.71■■■■□ 3.95
ZNF444-210ENST00000592171 ARHGEF11O15085 1522 aa39.7■■■■□ 3.95
ZNF444-210ENST00000592171 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.68■■■■□ 3.94
ZNF444-210ENST00000592171 GRIN2BQ13224 1484 aa39.67■■■■□ 3.94
ZNF444-210ENST00000592171 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.64■■■■□ 3.94
ZNF444-210ENST00000592171 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.63■■■■□ 3.93
ZNF444-210ENST00000592171 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.58■■■■□ 3.93
ZNF444-210ENST00000592171 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
ZNF444-210ENST00000592171 TOP2BQ02880 1626 aa39.52■■■■□ 3.92
ZNF444-210ENST00000592171 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.52■■■■□ 3.92
ZNF444-210ENST00000592171 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.52■■■■□ 3.92
ZNF444-210ENST00000592171 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.51■■■■□ 3.91
ZNF444-210ENST00000592171 SYNJ2O15056 1496 aa39.5■■■■□ 3.91
ZNF444-210ENST00000592171 PBRM1Q86U86 1689 aa39.48■■■■□ 3.91
ZNF444-210ENST00000592171 SYNJ1O43426 1573 aa39.45■■■■□ 3.91
ZNF444-210ENST00000592171 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.44■■■■□ 3.9
ZNF444-210ENST00000592171 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.39■■■■□ 3.9
ZNF444-210ENST00000592171 ARAP1Q96P48 1450 aa39.34■■■■□ 3.89
ZNF444-210ENST00000592171 GRIN2AQ12879 1464 aa39.16■■■■□ 3.86
ZNF444-210ENST00000592171 ADAMTS12P58397 1594 aa39.15■■■■□ 3.86
ZNF444-210ENST00000592171 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.14■■■■□ 3.86
ZNF444-210ENST00000592171 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.11■■■■□ 3.85
ZNF444-210ENST00000592171 NUP160Q12769 1436 aa39.06■■■■□ 3.84
ZNF444-210ENST00000592171 CEP170Q5SW79 1584 aa38.99■■■■□ 3.83
ZNF444-210ENST00000592171 SHROOM2Q13796 1616 aa38.84■■■■□ 3.81
ZNF444-210ENST00000592171 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.82■■■■□ 3.8
ZNF444-210ENST00000592171 IGF1RP08069 1367 aa38.77■■■■□ 3.8
ZNF444-210ENST00000592171 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
ZNF444-210ENST00000592171 KIF27Q86VH2 1401 aa38.75■■■■□ 3.79
ZNF444-210ENST00000592171 JPH4Q96JJ6 628 aa38.67■■■■□ 3.78
ZNF444-210ENST00000592171 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.5 ms