RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592132.1

NPHS1-205, Transcript of NPHS1, nephrin, humanhuman

TSL 3

Gene NPHS1, Length 561 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS1-205ENST00000592132 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.39■■■■□ 3.42
NPHS1-205ENST00000592132 ABCC9O60706 1549 aa33.65■■■□□ 2.98
NPHS1-205ENST00000592132 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.78■■■□□ 2.84
NPHS1-205ENST00000592132 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.31■■■□□ 2.76
NPHS1-205ENST00000592132 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.62■■■□□ 2.65
NPHS1-205ENST00000592132 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.34■■■□□ 2.61
NPHS1-205ENST00000592132 NACADO15069 1562 aa31.26■■■□□ 2.59
NPHS1-205ENST00000592132 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.21■■■□□ 2.59
NPHS1-205ENST00000592132 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.81■■■□□ 2.52
NPHS1-205ENST00000592132 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.76■■■□□ 2.52
NPHS1-205ENST00000592132 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.57■■■□□ 2.49
NPHS1-205ENST00000592132 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.38■■■□□ 2.45
NPHS1-205ENST00000592132 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.29■■■□□ 2.44
NPHS1-205ENST00000592132 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.19■■■□□ 2.42
NPHS1-205ENST00000592132 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.13■■■□□ 2.41
NPHS1-205ENST00000592132 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
NPHS1-205ENST00000592132 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
NPHS1-205ENST00000592132 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.95■■■□□ 2.38
NPHS1-205ENST00000592132 SCRIBQ14160 1630 aa29.93■■■□□ 2.38
NPHS1-205ENST00000592132 CUX2O14529 1486 aa29.21■■■□□ 2.27
NPHS1-205ENST00000592132 ERCC6Q03468 1493 aa29.07■■■□□ 2.24
NPHS1-205ENST00000592132 NCAPD3P42695 1498 aa28.93■■■□□ 2.22
NPHS1-205ENST00000592132 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.75■■■□□ 2.19
NPHS1-205ENST00000592132 NESP48681 1621 aa28.72■■■□□ 2.19
NPHS1-205ENST00000592132 SMARCA2P51531 1590 aa28.56■■■□□ 2.16
NPHS1-205ENST00000592132 HMGXB3Q12766 1538 aa28.55■■■□□ 2.16
NPHS1-205ENST00000592132 TRIM41Q8WV44 630 aa28.54■■■□□ 2.16
NPHS1-205ENST00000592132 SMARCA4P51532 1647 aa28.47■■■□□ 2.15
NPHS1-205ENST00000592132 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
NPHS1-205ENST00000592132 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
NPHS1-205ENST00000592132 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.29■■■□□ 2.12
NPHS1-205ENST00000592132 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.26■■■□□ 2.11
NPHS1-205ENST00000592132 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
NPHS1-205ENST00000592132 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.18■■■□□ 2.1
NPHS1-205ENST00000592132 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.17■■■□□ 2.1
NPHS1-205ENST00000592132 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.06■■■□□ 2.08
NPHS1-205ENST00000592132 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.05■■■□□ 2.08
NPHS1-205ENST00000592132 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.02■■■□□ 2.08
NPHS1-205ENST00000592132 WDR62O43379 1518 aa27.92■■■□□ 2.06
NPHS1-205ENST00000592132 OSCARQ8IYS5 282 aa27.91■■■□□ 2.06
NPHS1-205ENST00000592132 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.76■■■□□ 2.03
NPHS1-205ENST00000592132 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.7■■■□□ 2.02
NPHS1-205ENST00000592132 WIZO95785 1651 aa27.63■■■□□ 2.01
NPHS1-205ENST00000592132 CFTRP13569 1480 aa27.56■■■□□ 2
NPHS1-205ENST00000592132 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.51■■■□□ 2
NPHS1-205ENST00000592132 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.46■■□□□ 1.99
NPHS1-205ENST00000592132 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.46■■□□□ 1.99
NPHS1-205ENST00000592132 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.46■■□□□ 1.99
NPHS1-205ENST00000592132 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.34■■□□□ 1.97
NPHS1-205ENST00000592132 ARHGEF11O15085 1522 aa27.34■■□□□ 1.97
NPHS1-205ENST00000592132 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
NPHS1-205ENST00000592132 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
NPHS1-205ENST00000592132 IFT140Q96RY7 1462 aa27.25■■□□□ 1.95
NPHS1-205ENST00000592132 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
NPHS1-205ENST00000592132 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
NPHS1-205ENST00000592132 TOPBP1Q92547 1522 aa27.08■■□□□ 1.93
NPHS1-205ENST00000592132 ARAP1Q96P48 1450 aa27.05■■□□□ 1.92
NPHS1-205ENST00000592132 FBLN2P98095 1184 aa27.04■■□□□ 1.92
NPHS1-205ENST00000592132 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
NPHS1-205ENST00000592132 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
NPHS1-205ENST00000592132 CCDC88BA6NC98 1476 aa27■■□□□ 1.91
NPHS1-205ENST00000592132 PRDM2Q13029 1718 aa26.99■■□□□ 1.91
NPHS1-205ENST00000592132 ABCC8Q09428 1581 aa26.96■■□□□ 1.91
NPHS1-205ENST00000592132 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
NPHS1-205ENST00000592132 CHD1O14646 1710 aa26.91■■□□□ 1.9
NPHS1-205ENST00000592132 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.87■■□□□ 1.89
NPHS1-205ENST00000592132 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
NPHS1-205ENST00000592132 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
NPHS1-205ENST00000592132 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
NPHS1-205ENST00000592132 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.74■■□□□ 1.87
NPHS1-205ENST00000592132 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
NPHS1-205ENST00000592132 SOGA1O94964 1423 aa26.7■■□□□ 1.86
NPHS1-205ENST00000592132 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.65■■□□□ 1.86
NPHS1-205ENST00000592132 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.65■■□□□ 1.86
NPHS1-205ENST00000592132 SYNJ1O43426 1573 aa26.55■■□□□ 1.84
NPHS1-205ENST00000592132 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
NPHS1-205ENST00000592132 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.5■■□□□ 1.83
NPHS1-205ENST00000592132 GRIN2BQ13224 1484 aa26.49■■□□□ 1.83
NPHS1-205ENST00000592132 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.48■■□□□ 1.83
NPHS1-205ENST00000592132 SYNJ2O15056 1496 aa26.46■■□□□ 1.83
NPHS1-205ENST00000592132 WDR97A6NE52 1622 aa26.45■■□□□ 1.82
NPHS1-205ENST00000592132 CUX1P39880 1505 aa26.38■■□□□ 1.81
NPHS1-205ENST00000592132 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.24■■□□□ 1.79
NPHS1-205ENST00000592132 PBRM1Q86U86 1689 aa26.19■■□□□ 1.78
NPHS1-205ENST00000592132 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.15■■□□□ 1.78
NPHS1-205ENST00000592132 GRIN2AQ12879 1464 aa26.13■■□□□ 1.77
NPHS1-205ENST00000592132 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.1■■□□□ 1.77
NPHS1-205ENST00000592132 CEP170Q5SW79 1584 aa26.1■■□□□ 1.77
NPHS1-205ENST00000592132 NUP160Q12769 1436 aa26.08■■□□□ 1.77
NPHS1-205ENST00000592132 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.98■■□□□ 1.75
NPHS1-205ENST00000592132 ADAMTS12P58397 1594 aa25.96■■□□□ 1.75
NPHS1-205ENST00000592132 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.96■■□□□ 1.75
NPHS1-205ENST00000592132 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.96■■□□□ 1.75
NPHS1-205ENST00000592132 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
NPHS1-205ENST00000592132 SHROOM2Q13796 1616 aa25.96■■□□□ 1.75
NPHS1-205ENST00000592132 JPH4Q96JJ6 628 aa25.94■■□□□ 1.74
NPHS1-205ENST00000592132 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
NPHS1-205ENST00000592132 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.91■■□□□ 1.74
NPHS1-205ENST00000592132 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.88■■□□□ 1.73
NPHS1-205ENST00000592132 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.86■■□□□ 1.73
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