RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592119.2

C18orf8-211, Transcript of Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

TSL 4

Gene C18orf8, Length 565 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8-211ENST00000592119 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.46■■■■■ 4.87
C18orf8-211ENST00000592119 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.91■■■■□ 3.98
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C18orf8-211ENST00000592119 ABCC9O60706 1549 aa38.03■■■■□ 3.68
C18orf8-211ENST00000592119 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.67■■■■□ 3.62
C18orf8-211ENST00000592119 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.44■■■■□ 3.58
C18orf8-211ENST00000592119 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.39■■■■□ 3.58
C18orf8-211ENST00000592119 NACADO15069 1562 aa37.26■■■■□ 3.56
C18orf8-211ENST00000592119 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.02■■■■□ 3.52
C18orf8-211ENST00000592119 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.54■■■■□ 3.44
C18orf8-211ENST00000592119 SCRIBQ14160 1630 aa36.52■■■■□ 3.44
C18orf8-211ENST00000592119 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.18■■■■□ 3.38
C18orf8-211ENST00000592119 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.95■■■■□ 3.35
C18orf8-211ENST00000592119 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.71■■■■□ 3.31
C18orf8-211ENST00000592119 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.32■■■■□ 3.24
C18orf8-211ENST00000592119 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
C18orf8-211ENST00000592119 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.08■■■■□ 3.21
C18orf8-211ENST00000592119 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
C18orf8-211ENST00000592119 SMARCA4P51532 1647 aa35.04■■■■□ 3.2
C18orf8-211ENST00000592119 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
C18orf8-211ENST00000592119 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
C18orf8-211ENST00000592119 WIZO95785 1651 aa34.71■■■■□ 3.15
C18orf8-211ENST00000592119 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.7■■■■□ 3.15
C18orf8-211ENST00000592119 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.58■■■■□ 3.13
C18orf8-211ENST00000592119 SMARCA2P51531 1590 aa34.56■■■■□ 3.12
C18orf8-211ENST00000592119 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.44■■■■□ 3.1
C18orf8-211ENST00000592119 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
C18orf8-211ENST00000592119 NCAPD3P42695 1498 aa34.4■■■■□ 3.1
C18orf8-211ENST00000592119 HMGXB3Q12766 1538 aa34.34■■■■□ 3.09
C18orf8-211ENST00000592119 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
C18orf8-211ENST00000592119 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.01■■■■□ 3.04
C18orf8-211ENST00000592119 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.96■■■■□ 3.03
C18orf8-211ENST00000592119 CFTRP13569 1480 aa33.5■■■□□ 2.95
C18orf8-211ENST00000592119 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.44■■■□□ 2.94
C18orf8-211ENST00000592119 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.29■■■□□ 2.92
C18orf8-211ENST00000592119 NESP48681 1621 aa33.25■■■□□ 2.91
C18orf8-211ENST00000592119 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.24■■■□□ 2.91
C18orf8-211ENST00000592119 PRDM2Q13029 1718 aa33.24■■■□□ 2.91
C18orf8-211ENST00000592119 ABCC8Q09428 1581 aa33.09■■■□□ 2.89
C18orf8-211ENST00000592119 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.05■■■□□ 2.88
C18orf8-211ENST00000592119 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.01■■■□□ 2.87
C18orf8-211ENST00000592119 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33■■■□□ 2.87
C18orf8-211ENST00000592119 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.91■■■□□ 2.86
C18orf8-211ENST00000592119 SYNJ1O43426 1573 aa32.89■■■□□ 2.86
C18orf8-211ENST00000592119 TRIM41Q8WV44 630 aa32.87■■■□□ 2.85
C18orf8-211ENST00000592119 CUX1P39880 1505 aa32.84■■■□□ 2.85
C18orf8-211ENST00000592119 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.84■■■□□ 2.85
C18orf8-211ENST00000592119 TOP2BQ02880 1626 aa32.81■■■□□ 2.84
C18orf8-211ENST00000592119 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.8■■■□□ 2.84
C18orf8-211ENST00000592119 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.71■■■□□ 2.83
C18orf8-211ENST00000592119 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
C18orf8-211ENST00000592119 TOPBP1Q92547 1522 aa32.67■■■□□ 2.82
C18orf8-211ENST00000592119 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.66■■■□□ 2.82
C18orf8-211ENST00000592119 ERCC6Q03468 1493 aa32.65■■■□□ 2.82
C18orf8-211ENST00000592119 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.54■■■□□ 2.8
C18orf8-211ENST00000592119 WDR62O43379 1518 aa32.53■■■□□ 2.8
C18orf8-211ENST00000592119 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
C18orf8-211ENST00000592119 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
C18orf8-211ENST00000592119 SOGA1O94964 1423 aa32.39■■■□□ 2.78
C18orf8-211ENST00000592119 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.31■■■□□ 2.76
C18orf8-211ENST00000592119 EEA1Q15075 1411 aa32.31■■■□□ 2.76
C18orf8-211ENST00000592119 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.29■■■□□ 2.76
C18orf8-211ENST00000592119 CUX2O14529 1486 aa32.29■■■□□ 2.76
C18orf8-211ENST00000592119 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.28■■■□□ 2.76
C18orf8-211ENST00000592119 WDR97A6NE52 1622 aa32.22■■■□□ 2.75
C18orf8-211ENST00000592119 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
C18orf8-211ENST00000592119 KIF27Q86VH2 1401 aa32.2■■■□□ 2.75
C18orf8-211ENST00000592119 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
C18orf8-211ENST00000592119 IFT140Q96RY7 1462 aa32.18■■■□□ 2.74
C18orf8-211ENST00000592119 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.07■■■□□ 2.72
C18orf8-211ENST00000592119 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.07■■■□□ 2.72
C18orf8-211ENST00000592119 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
C18orf8-211ENST00000592119 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
C18orf8-211ENST00000592119 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.97■■■□□ 2.71
C18orf8-211ENST00000592119 IGF1RP08069 1367 aa31.96■■■□□ 2.71
C18orf8-211ENST00000592119 PRXQ9BXM0 1461 aa31.92■■■□□ 2.7
C18orf8-211ENST00000592119 KIF21BO75037 1637 aa31.91■■■□□ 2.7
C18orf8-211ENST00000592119 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.9■■■□□ 2.7
C18orf8-211ENST00000592119 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.9■■■□□ 2.7
C18orf8-211ENST00000592119 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
C18orf8-211ENST00000592119 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.86■■■□□ 2.69
C18orf8-211ENST00000592119 GRIN2BQ13224 1484 aa31.82■■■□□ 2.68
C18orf8-211ENST00000592119 GOLGA3Q08378 1498 aa31.81■■■□□ 2.68
C18orf8-211ENST00000592119 PBRM1Q86U86 1689 aa31.8■■■□□ 2.68
C18orf8-211ENST00000592119 CUL7Q14999 1698 aa31.79■■■□□ 2.68
C18orf8-211ENST00000592119 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.78■■■□□ 2.68
C18orf8-211ENST00000592119 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.78■■■□□ 2.68
C18orf8-211ENST00000592119 ADAMTS12P58397 1594 aa31.68■■■□□ 2.66
C18orf8-211ENST00000592119 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.67■■■□□ 2.66
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C18orf8-211ENST00000592119 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.65■■■□□ 2.66
C18orf8-211ENST00000592119 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
C18orf8-211ENST00000592119 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.61■■■□□ 2.65
C18orf8-211ENST00000592119 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
C18orf8-211ENST00000592119 SYNJ2O15056 1496 aa31.49■■■□□ 2.63
C18orf8-211ENST00000592119 GRIN2AQ12879 1464 aa31.43■■■□□ 2.62
C18orf8-211ENST00000592119 CEP162Q5TB80 1403 aa31.38■■■□□ 2.61
C18orf8-211ENST00000592119 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
C18orf8-211ENST00000592119 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.31■■■□□ 2.6
C18orf8-211ENST00000592119 NUP160Q12769 1436 aa31.27■■■□□ 2.6
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