RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591848.1

AFG3L2-204, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene AFG3L2, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2-204ENST00000591848 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.62■■■■■ 4.41
AFG3L2-204ENST00000591848 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.09■■■■□ 3.69
AFG3L2-204ENST00000591848 ABCC9O60706 1549 aa37.9■■■■□ 3.66
AFG3L2-204ENST00000591848 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.19■■■■□ 3.38
AFG3L2-204ENST00000591848 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.07■■■■□ 3.36
AFG3L2-204ENST00000591848 NACADO15069 1562 aa36■■■■□ 3.35
AFG3L2-204ENST00000591848 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.56■■■■□ 3.28
AFG3L2-204ENST00000591848 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.39■■■■□ 3.26
AFG3L2-204ENST00000591848 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
AFG3L2-204ENST00000591848 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.31■■■■□ 3.24
AFG3L2-204ENST00000591848 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.29■■■■□ 3.24
AFG3L2-204ENST00000591848 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.21■■■■□ 3.23
AFG3L2-204ENST00000591848 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.04■■■■□ 3.2
AFG3L2-204ENST00000591848 SCRIBQ14160 1630 aa34.75■■■■□ 3.15
AFG3L2-204ENST00000591848 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.64■■■■□ 3.14
AFG3L2-204ENST00000591848 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.22■■■■□ 3.07
AFG3L2-204ENST00000591848 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
AFG3L2-204ENST00000591848 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.12■■■■□ 3.05
AFG3L2-204ENST00000591848 NCAPD3P42695 1498 aa33.24■■■□□ 2.91
AFG3L2-204ENST00000591848 SMARCA4P51532 1647 aa33.17■■■□□ 2.9
AFG3L2-204ENST00000591848 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.16■■■□□ 2.9
AFG3L2-204ENST00000591848 SMARCA2P51531 1590 aa33.11■■■□□ 2.89
AFG3L2-204ENST00000591848 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
AFG3L2-204ENST00000591848 HMGXB3Q12766 1538 aa32.97■■■□□ 2.87
AFG3L2-204ENST00000591848 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
AFG3L2-204ENST00000591848 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.83■■■□□ 2.85
AFG3L2-204ENST00000591848 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.82■■■□□ 2.84
AFG3L2-204ENST00000591848 ERCC6Q03468 1493 aa32.74■■■□□ 2.83
AFG3L2-204ENST00000591848 NESP48681 1621 aa32.6■■■□□ 2.81
AFG3L2-204ENST00000591848 CUX2O14529 1486 aa32.54■■■□□ 2.8
AFG3L2-204ENST00000591848 WIZO95785 1651 aa32.46■■■□□ 2.79
AFG3L2-204ENST00000591848 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.43■■■□□ 2.78
AFG3L2-204ENST00000591848 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.31■■■□□ 2.76
AFG3L2-204ENST00000591848 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.29■■■□□ 2.76
AFG3L2-204ENST00000591848 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
AFG3L2-204ENST00000591848 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.28■■■□□ 2.76
AFG3L2-204ENST00000591848 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.17■■■□□ 2.74
AFG3L2-204ENST00000591848 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
AFG3L2-204ENST00000591848 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
AFG3L2-204ENST00000591848 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.95■■■□□ 2.7
AFG3L2-204ENST00000591848 CFTRP13569 1480 aa31.92■■■□□ 2.7
AFG3L2-204ENST00000591848 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.9■■■□□ 2.7
AFG3L2-204ENST00000591848 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.88■■■□□ 2.69
AFG3L2-204ENST00000591848 WDR62O43379 1518 aa31.82■■■□□ 2.68
AFG3L2-204ENST00000591848 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.73■■■□□ 2.67
AFG3L2-204ENST00000591848 PRDM2Q13029 1718 aa31.58■■■□□ 2.65
AFG3L2-204ENST00000591848 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
AFG3L2-204ENST00000591848 ABCC8Q09428 1581 aa31.31■■■□□ 2.6
AFG3L2-204ENST00000591848 TOPBP1Q92547 1522 aa31.29■■■□□ 2.6
AFG3L2-204ENST00000591848 IFT140Q96RY7 1462 aa31.25■■■□□ 2.59
AFG3L2-204ENST00000591848 OSCARQ8IYS5 282 aa31.23■■■□□ 2.59
AFG3L2-204ENST00000591848 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
AFG3L2-204ENST00000591848 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.19■■■□□ 2.58
AFG3L2-204ENST00000591848 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.57
AFG3L2-204ENST00000591848 TRIM41Q8WV44 630 aa31.03■■■□□ 2.56
AFG3L2-204ENST00000591848 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
AFG3L2-204ENST00000591848 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
AFG3L2-204ENST00000591848 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
AFG3L2-204ENST00000591848 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.94■■■□□ 2.545e-6■■■■□ 22
AFG3L2-204ENST00000591848 SOGA1O94964 1423 aa30.92■■■□□ 2.54
AFG3L2-204ENST00000591848 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.89■■■□□ 2.53
AFG3L2-204ENST00000591848 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.83■■■□□ 2.53
AFG3L2-204ENST00000591848 CUX1P39880 1505 aa30.83■■■□□ 2.53
AFG3L2-204ENST00000591848 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
AFG3L2-204ENST00000591848 FBLN2P98095 1184 aa30.8■■■□□ 2.52
AFG3L2-204ENST00000591848 CHD1O14646 1710 aa30.68■■■□□ 2.5
AFG3L2-204ENST00000591848 WDR97A6NE52 1622 aa30.68■■■□□ 2.5
AFG3L2-204ENST00000591848 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.65■■■□□ 2.5
AFG3L2-204ENST00000591848 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.65■■■□□ 2.5
AFG3L2-204ENST00000591848 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.65■■■□□ 2.5
AFG3L2-204ENST00000591848 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.6■■■□□ 2.49
AFG3L2-204ENST00000591848 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
AFG3L2-204ENST00000591848 GRIN2BQ13224 1484 aa30.59■■■□□ 2.49
AFG3L2-204ENST00000591848 ARHGEF11O15085 1522 aa30.58■■■□□ 2.49
AFG3L2-204ENST00000591848 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
AFG3L2-204ENST00000591848 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.52■■■□□ 2.48
AFG3L2-204ENST00000591848 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.5■■■□□ 2.47
AFG3L2-204ENST00000591848 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.49■■■□□ 2.47
AFG3L2-204ENST00000591848 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.48■■■□□ 2.47
AFG3L2-204ENST00000591848 SYNJ2O15056 1496 aa30.44■■■□□ 2.46
AFG3L2-204ENST00000591848 PBRM1Q86U86 1689 aa30.42■■■□□ 2.46
AFG3L2-204ENST00000591848 TOP2BQ02880 1626 aa30.42■■■□□ 2.46
AFG3L2-204ENST00000591848 SYNJ1O43426 1573 aa30.4■■■□□ 2.46
AFG3L2-204ENST00000591848 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.4■■■□□ 2.46
AFG3L2-204ENST00000591848 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.38■■■□□ 2.45
AFG3L2-204ENST00000591848 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.32■■■□□ 2.44
AFG3L2-204ENST00000591848 ARAP1Q96P48 1450 aa30.28■■■□□ 2.44
AFG3L2-204ENST00000591848 GRIN2AQ12879 1464 aa30.17■■■□□ 2.42
AFG3L2-204ENST00000591848 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.15■■■□□ 2.42
AFG3L2-204ENST00000591848 ADAMTS12P58397 1594 aa30.14■■■□□ 2.42
AFG3L2-204ENST00000591848 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.13■■■□□ 2.41
AFG3L2-204ENST00000591848 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
AFG3L2-204ENST00000591848 NUP160Q12769 1436 aa30.04■■■□□ 2.4
AFG3L2-204ENST00000591848 CEP170Q5SW79 1584 aa30.01■■■□□ 2.39
AFG3L2-204ENST00000591848 KIF27Q86VH2 1401 aa29.91■■■□□ 2.38
AFG3L2-204ENST00000591848 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.87■■■□□ 2.37
AFG3L2-204ENST00000591848 JPH4Q96JJ6 628 aa29.86■■■□□ 2.37
AFG3L2-204ENST00000591848 IGF1RP08069 1367 aa29.85■■■□□ 2.37
AFG3L2-204ENST00000591848 SHROOM2Q13796 1616 aa29.84■■■□□ 2.37
AFG3L2-204ENST00000591848 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.4 ms