RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591817.1

NPHS1-204, Transcript of NPHS1, nephrin, humanhuman

TSL 5

Gene NPHS1, Length 581 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS1-204ENST00000591817 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.6■■■■□ 3.77
NPHS1-204ENST00000591817 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.39■■■■□ 3.1
NPHS1-204ENST00000591817 ABCC9O60706 1549 aa33.63■■■□□ 2.97
NPHS1-204ENST00000591817 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.39■■■□□ 2.78
NPHS1-204ENST00000591817 NACADO15069 1562 aa32.36■■■□□ 2.77
NPHS1-204ENST00000591817 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.23■■■□□ 2.75
NPHS1-204ENST00000591817 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
NPHS1-204ENST00000591817 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.08■■■□□ 2.73
NPHS1-204ENST00000591817 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.02■■■□□ 2.72
NPHS1-204ENST00000591817 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.61■■■□□ 2.65
NPHS1-204ENST00000591817 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.43■■■□□ 2.62
NPHS1-204ENST00000591817 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.37■■■□□ 2.61
NPHS1-204ENST00000591817 SCRIBQ14160 1630 aa31.25■■■□□ 2.59
NPHS1-204ENST00000591817 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.2■■■□□ 2.58
NPHS1-204ENST00000591817 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.99■■■□□ 2.55
NPHS1-204ENST00000591817 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
NPHS1-204ENST00000591817 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.47■■■□□ 2.47
NPHS1-204ENST00000591817 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.28■■■□□ 2.44
NPHS1-204ENST00000591817 SMARCA4P51532 1647 aa29.96■■■□□ 2.39
NPHS1-204ENST00000591817 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
NPHS1-204ENST00000591817 NCAPD3P42695 1498 aa29.88■■■□□ 2.37
NPHS1-204ENST00000591817 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.84■■■□□ 2.37
NPHS1-204ENST00000591817 SMARCA2P51531 1590 aa29.81■■■□□ 2.36
NPHS1-204ENST00000591817 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.75■■■□□ 2.35
NPHS1-204ENST00000591817 HMGXB3Q12766 1538 aa29.72■■■□□ 2.35
NPHS1-204ENST00000591817 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.71■■■□□ 2.35
NPHS1-204ENST00000591817 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
NPHS1-204ENST00000591817 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
NPHS1-204ENST00000591817 WIZO95785 1651 aa29.34■■■□□ 2.29
NPHS1-204ENST00000591817 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
NPHS1-204ENST00000591817 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.09■■■□□ 2.25
NPHS1-204ENST00000591817 NESP48681 1621 aa29.09■■■□□ 2.25
NPHS1-204ENST00000591817 ERCC6Q03468 1493 aa29■■■□□ 2.23
NPHS1-204ENST00000591817 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.96■■■□□ 2.23
NPHS1-204ENST00000591817 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.87■■■□□ 2.21
NPHS1-204ENST00000591817 CUX2O14529 1486 aa28.85■■■□□ 2.21
NPHS1-204ENST00000591817 CFTRP13569 1480 aa28.8■■■□□ 2.2
NPHS1-204ENST00000591817 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
NPHS1-204ENST00000591817 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.74■■■□□ 2.19
NPHS1-204ENST00000591817 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.72■■■□□ 2.19
NPHS1-204ENST00000591817 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.6■■■□□ 2.17
NPHS1-204ENST00000591817 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.58■■■□□ 2.17
NPHS1-204ENST00000591817 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.58■■■□□ 2.17
NPHS1-204ENST00000591817 WDR62O43379 1518 aa28.52■■■□□ 2.16
NPHS1-204ENST00000591817 PRDM2Q13029 1718 aa28.51■■■□□ 2.15
NPHS1-204ENST00000591817 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
NPHS1-204ENST00000591817 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
NPHS1-204ENST00000591817 ABCC8Q09428 1581 aa28.17■■■□□ 2.1
NPHS1-204ENST00000591817 TOPBP1Q92547 1522 aa28.14■■■□□ 2.1
NPHS1-204ENST00000591817 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.11■■■□□ 2.09
NPHS1-204ENST00000591817 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.05■■■□□ 2.08
NPHS1-204ENST00000591817 IFT140Q96RY7 1462 aa28.01■■■□□ 2.07
NPHS1-204ENST00000591817 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
NPHS1-204ENST00000591817 CUX1P39880 1505 aa27.88■■■□□ 2.05
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NPHS1-204ENST00000591817 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.79■■■□□ 2.04
NPHS1-204ENST00000591817 SOGA1O94964 1423 aa27.75■■■□□ 2.03
NPHS1-204ENST00000591817 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
NPHS1-204ENST00000591817 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.72■■■□□ 2.03
NPHS1-204ENST00000591817 WDR97A6NE52 1622 aa27.7■■■□□ 2.03
NPHS1-204ENST00000591817 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.66■■■□□ 2.02
NPHS1-204ENST00000591817 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.66■■■□□ 2.02
NPHS1-204ENST00000591817 TOP2BQ02880 1626 aa27.63■■■□□ 2.01
NPHS1-204ENST00000591817 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.63■■■□□ 2.01
NPHS1-204ENST00000591817 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
NPHS1-204ENST00000591817 SYNJ1O43426 1573 aa27.58■■■□□ 2.01
NPHS1-204ENST00000591817 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.57■■■□□ 2
NPHS1-204ENST00000591817 OSCARQ8IYS5 282 aa27.56■■■□□ 2
NPHS1-204ENST00000591817 GRIN2BQ13224 1484 aa27.47■■□□□ 1.99
NPHS1-204ENST00000591817 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.45■■□□□ 1.99
NPHS1-204ENST00000591817 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.44■■□□□ 1.98
NPHS1-204ENST00000591817 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
NPHS1-204ENST00000591817 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.42■■□□□ 1.98
NPHS1-204ENST00000591817 CHD1O14646 1710 aa27.37■■□□□ 1.97
NPHS1-204ENST00000591817 PBRM1Q86U86 1689 aa27.36■■□□□ 1.97
NPHS1-204ENST00000591817 SYNJ2O15056 1496 aa27.32■■□□□ 1.96
NPHS1-204ENST00000591817 FBLN2P98095 1184 aa27.26■■□□□ 1.95
NPHS1-204ENST00000591817 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.24■■□□□ 1.95
NPHS1-204ENST00000591817 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
NPHS1-204ENST00000591817 ADAMTS12P58397 1594 aa27.18■■□□□ 1.94
NPHS1-204ENST00000591817 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.16■■□□□ 1.94
NPHS1-204ENST00000591817 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.15■■□□□ 1.94
NPHS1-204ENST00000591817 ARHGEF11O15085 1522 aa27.14■■□□□ 1.94
NPHS1-204ENST00000591817 GRIN2AQ12879 1464 aa27.13■■□□□ 1.93
NPHS1-204ENST00000591817 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.12■■□□□ 1.93
NPHS1-204ENST00000591817 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.12■■□□□ 1.93
NPHS1-204ENST00000591817 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.12■■□□□ 1.93
NPHS1-204ENST00000591817 KIF27Q86VH2 1401 aa27.09■■□□□ 1.93
NPHS1-204ENST00000591817 NUP160Q12769 1436 aa27.05■■□□□ 1.92
NPHS1-204ENST00000591817 IGF1RP08069 1367 aa27.01■■□□□ 1.91
NPHS1-204ENST00000591817 CEP170Q5SW79 1584 aa26.97■■□□□ 1.91
NPHS1-204ENST00000591817 CUL7Q14999 1698 aa26.94■■□□□ 1.9
NPHS1-204ENST00000591817 TRIM41Q8WV44 630 aa26.93■■□□□ 1.9
NPHS1-204ENST00000591817 ARAP1Q96P48 1450 aa26.91■■□□□ 1.9
NPHS1-204ENST00000591817 SHROOM2Q13796 1616 aa26.85■■□□□ 1.89
NPHS1-204ENST00000591817 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.82■■□□□ 1.88
NPHS1-204ENST00000591817 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.81■■□□□ 1.88
NPHS1-204ENST00000591817 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.8■■□□□ 1.88
NPHS1-204ENST00000591817 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.74■■□□□ 1.87
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