RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591709.1

POLR2E-208, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 685 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-208ENST00000591709 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.34■■■■■ 4.53
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POLR2E-208ENST00000591709 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.32■■■■□ 3.88
POLR2E-208ENST00000591709 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.76■■■■□ 3.64
POLR2E-208ENST00000591709 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.63■■■■□ 3.62
POLR2E-208ENST00000591709 NACADO15069 1562 aa37.19■■■■□ 3.54
POLR2E-208ENST00000591709 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.03■■■■□ 3.52
POLR2E-208ENST00000591709 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.86■■■■□ 3.49
POLR2E-208ENST00000591709 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.76■■■■□ 3.48
POLR2E-208ENST00000591709 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.59■■■■□ 3.45
POLR2E-208ENST00000591709 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.4■■■■□ 3.42
POLR2E-208ENST00000591709 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.98■■■■□ 3.35
POLR2E-208ENST00000591709 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.93■■■■□ 3.34
POLR2E-208ENST00000591709 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.88■■■■□ 3.33
POLR2E-208ENST00000591709 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
POLR2E-208ENST00000591709 SCRIBQ14160 1630 aa35.78■■■■□ 3.32
POLR2E-208ENST00000591709 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.73■■■■□ 3.31
POLR2E-208ENST00000591709 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
POLR2E-208ENST00000591709 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.08■■■■□ 3.21
POLR2E-208ENST00000591709 CUX2O14529 1486 aa34.52■■■■□ 3.12
POLR2E-208ENST00000591709 ERCC6Q03468 1493 aa34.39■■■■□ 3.1
POLR2E-208ENST00000591709 NCAPD3P42695 1498 aa34.26■■■■□ 3.07
POLR2E-208ENST00000591709 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.11■■■■□ 3.05
POLR2E-208ENST00000591709 HMGXB3Q12766 1538 aa34.06■■■■□ 3.04
POLR2E-208ENST00000591709 SMARCA4P51532 1647 aa34.04■■■■□ 3.04
POLR2E-208ENST00000591709 NESP48681 1621 aa34.04■■■■□ 3.04
POLR2E-208ENST00000591709 SMARCA2P51531 1590 aa34.03■■■■□ 3.04
POLR2E-208ENST00000591709 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
POLR2E-208ENST00000591709 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
POLR2E-208ENST00000591709 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.74■■■□□ 2.99
POLR2E-208ENST00000591709 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
POLR2E-208ENST00000591709 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.7■■■□□ 2.99
POLR2E-208ENST00000591709 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.65■■■□□ 2.98
POLR2E-208ENST00000591709 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.43■■■□□ 2.94
POLR2E-208ENST00000591709 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.41■■■□□ 2.94
POLR2E-208ENST00000591709 TRIM41Q8WV44 630 aa33.38■■■□□ 2.93
POLR2E-208ENST00000591709 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.25■■■□□ 2.91
POLR2E-208ENST00000591709 WDR62O43379 1518 aa33.22■■■□□ 2.91
POLR2E-208ENST00000591709 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.17■■■□□ 2.9
POLR2E-208ENST00000591709 WIZO95785 1651 aa33.09■■■□□ 2.89
POLR2E-208ENST00000591709 CEP164Q9UPV0 1460 aa33■■■□□ 2.87
POLR2E-208ENST00000591709 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.88■■■□□ 2.85
POLR2E-208ENST00000591709 OSCARQ8IYS5 282 aa32.72■■■□□ 2.83
POLR2E-208ENST00000591709 CFTRP13569 1480 aa32.71■■■□□ 2.83
POLR2E-208ENST00000591709 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
POLR2E-208ENST00000591709 PRDM2Q13029 1718 aa32.65■■■□□ 2.82
POLR2E-208ENST00000591709 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.61■■■□□ 2.81
POLR2E-208ENST00000591709 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.61■■■□□ 2.81
POLR2E-208ENST00000591709 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.61■■■□□ 2.81
POLR2E-208ENST00000591709 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
POLR2E-208ENST00000591709 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
POLR2E-208ENST00000591709 ARHGEF11O15085 1522 aa32.37■■■□□ 2.77
POLR2E-208ENST00000591709 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
POLR2E-208ENST00000591709 IFT140Q96RY7 1462 aa32.31■■■□□ 2.76
POLR2E-208ENST00000591709 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
POLR2E-208ENST00000591709 CHD1O14646 1710 aa32.24■■■□□ 2.75
POLR2E-208ENST00000591709 TOPBP1Q92547 1522 aa32.21■■■□□ 2.75
POLR2E-208ENST00000591709 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.12■■■□□ 2.73
POLR2E-208ENST00000591709 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.07■■■□□ 2.72
POLR2E-208ENST00000591709 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.04■■■□□ 2.72
POLR2E-208ENST00000591709 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
POLR2E-208ENST00000591709 ABCC8Q09428 1581 aa32.02■■■□□ 2.72
POLR2E-208ENST00000591709 ARAP1Q96P48 1450 aa32■■■□□ 2.71
POLR2E-208ENST00000591709 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.96■■■□□ 2.712e-7■■■■■ 31.8
POLR2E-208ENST00000591709 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
POLR2E-208ENST00000591709 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
POLR2E-208ENST00000591709 FBLN2P98095 1184 aa31.83■■■□□ 2.69
POLR2E-208ENST00000591709 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.72■■■□□ 2.67
POLR2E-208ENST00000591709 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.7■■■□□ 2.66
POLR2E-208ENST00000591709 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.67■■■□□ 2.66
POLR2E-208ENST00000591709 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
POLR2E-208ENST00000591709 WDR97A6NE52 1622 aa31.63■■■□□ 2.65
POLR2E-208ENST00000591709 SYNJ1O43426 1573 aa31.62■■■□□ 2.65
POLR2E-208ENST00000591709 SOGA1O94964 1423 aa31.6■■■□□ 2.65
POLR2E-208ENST00000591709 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.57■■■□□ 2.64
POLR2E-208ENST00000591709 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
POLR2E-208ENST00000591709 PBRM1Q86U86 1689 aa31.51■■■□□ 2.64
POLR2E-208ENST00000591709 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
POLR2E-208ENST00000591709 CUX1P39880 1505 aa31.45■■■□□ 2.63
POLR2E-208ENST00000591709 GRIN2BQ13224 1484 aa31.44■■■□□ 2.62
POLR2E-208ENST00000591709 SYNJ2O15056 1496 aa31.42■■■□□ 2.62
POLR2E-208ENST00000591709 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
POLR2E-208ENST00000591709 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.33■■■□□ 2.61
POLR2E-208ENST00000591709 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.26■■■□□ 2.59
POLR2E-208ENST00000591709 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.19■■■□□ 2.58
POLR2E-208ENST00000591709 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.14■■■□□ 2.57
POLR2E-208ENST00000591709 GRIN2AQ12879 1464 aa31.08■■■□□ 2.57
POLR2E-208ENST00000591709 ADAMTS12P58397 1594 aa31.07■■■□□ 2.56
POLR2E-208ENST00000591709 CEP170Q5SW79 1584 aa31.06■■■□□ 2.56
POLR2E-208ENST00000591709 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.05■■■□□ 2.56
POLR2E-208ENST00000591709 SHROOM2Q13796 1616 aa31.01■■■□□ 2.55
POLR2E-208ENST00000591709 NUP160Q12769 1436 aa30.96■■■□□ 2.55
POLR2E-208ENST00000591709 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.87■■■□□ 2.53
POLR2E-208ENST00000591709 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.83■■■□□ 2.53
POLR2E-208ENST00000591709 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.81■■■□□ 2.52
POLR2E-208ENST00000591709 TOP2BQ02880 1626 aa30.8■■■□□ 2.52
POLR2E-208ENST00000591709 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.75■■■□□ 2.51
POLR2E-208ENST00000591709 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.5
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POLR2E-208ENST00000591709 DIP2BQ9P265 1576 aa30.61■■■□□ 2.49
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