RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591392.5

ROGDI-214, Transcript of rogdi homolog, humanhuman

TSL 3

Gene ROGDI, Length 811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROGDI-214ENST00000591392 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.6■■■■■ 6.49
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ROGDI-214ENST00000591392 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.07■■■■■ 5.61
ROGDI-214ENST00000591392 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.89■■■■■ 5.26
ROGDI-214ENST00000591392 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.64■■■■■ 5.22
ROGDI-214ENST00000591392 NACADO15069 1562 aa47.47■■■■■ 5.19
ROGDI-214ENST00000591392 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.14■■■■■ 5.14
ROGDI-214ENST00000591392 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.91■■■■■ 5.1
ROGDI-214ENST00000591392 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.69■■■■■ 5.07
ROGDI-214ENST00000591392 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.67■■■■■ 5.06
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ROGDI-214ENST00000591392 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.93■■■■■ 4.94
ROGDI-214ENST00000591392 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.9■■■■■ 4.94
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ROGDI-214ENST00000591392 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.55■■■■■ 4.88
ROGDI-214ENST00000591392 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.53■■■■■ 4.88
ROGDI-214ENST00000591392 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
ROGDI-214ENST00000591392 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.14■■■■■ 4.66
ROGDI-214ENST00000591392 NCAPD3P42695 1498 aa43.83■■■■■ 4.61
ROGDI-214ENST00000591392 CUX2O14529 1486 aa43.72■■■■■ 4.59
ROGDI-214ENST00000591392 ERCC6Q03468 1493 aa43.65■■■■■ 4.58
ROGDI-214ENST00000591392 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.61■■■■■ 4.57
ROGDI-214ENST00000591392 SMARCA2P51531 1590 aa43.5■■■■■ 4.55
ROGDI-214ENST00000591392 HMGXB3Q12766 1538 aa43.45■■■■■ 4.55
ROGDI-214ENST00000591392 SMARCA4P51532 1647 aa43.44■■■■■ 4.54
ROGDI-214ENST00000591392 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
ROGDI-214ENST00000591392 NESP48681 1621 aa43.19■■■■■ 4.51
ROGDI-214ENST00000591392 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
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ROGDI-214ENST00000591392 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.9■■■■■ 4.46
ROGDI-214ENST00000591392 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.85■■■■■ 4.45
ROGDI-214ENST00000591392 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.79■■■■■ 4.44
ROGDI-214ENST00000591392 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.71■■■■■ 4.43
ROGDI-214ENST00000591392 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.6■■■■■ 4.41
ROGDI-214ENST00000591392 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.48■■■■■ 4.39
ROGDI-214ENST00000591392 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.32■■■■■ 4.37
ROGDI-214ENST00000591392 WIZO95785 1651 aa42.24■■■■■ 4.35
ROGDI-214ENST00000591392 WDR62O43379 1518 aa42.21■■■■■ 4.35
ROGDI-214ENST00000591392 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.09■■■■■ 4.33
ROGDI-214ENST00000591392 TRIM41Q8WV44 630 aa42.04■■■■■ 4.32
ROGDI-214ENST00000591392 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.98■■■■■ 4.31
ROGDI-214ENST00000591392 CFTRP13569 1480 aa41.9■■■■■ 4.3
ROGDI-214ENST00000591392 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
ROGDI-214ENST00000591392 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
ROGDI-214ENST00000591392 OSCARQ8IYS5 282 aa41.67■■■■■ 4.26
ROGDI-214ENST00000591392 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
ROGDI-214ENST00000591392 PRDM2Q13029 1718 aa41.37■■■■■ 4.21
ROGDI-214ENST00000591392 IFT140Q96RY7 1462 aa41.27■■■■■ 4.2
ROGDI-214ENST00000591392 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.26■■■■■ 4.2
ROGDI-214ENST00000591392 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
ROGDI-214ENST00000591392 TOPBP1Q92547 1522 aa41.13■■■■■ 4.17
ROGDI-214ENST00000591392 ABCC8Q09428 1581 aa41.09■■■■■ 4.17
ROGDI-214ENST00000591392 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
ROGDI-214ENST00000591392 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
ROGDI-214ENST00000591392 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
ROGDI-214ENST00000591392 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.95■■■■■ 4.15
ROGDI-214ENST00000591392 ARHGEF11O15085 1522 aa40.94■■■■■ 4.14
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ROGDI-214ENST00000591392 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
ROGDI-214ENST00000591392 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.69■■■■■ 4.1
ROGDI-214ENST00000591392 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
ROGDI-214ENST00000591392 CHD1O14646 1710 aa40.67■■■■■ 4.1
ROGDI-214ENST00000591392 FBLN2P98095 1184 aa40.64■■■■■ 4.1
ROGDI-214ENST00000591392 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.51■■■■■ 4.08
ROGDI-214ENST00000591392 SOGA1O94964 1423 aa40.51■■■■■ 4.08
ROGDI-214ENST00000591392 ARAP1Q96P48 1450 aa40.5■■■■■ 4.07
ROGDI-214ENST00000591392 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
ROGDI-214ENST00000591392 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
ROGDI-214ENST00000591392 WDR97A6NE52 1622 aa40.41■■■■■ 4.06
ROGDI-214ENST00000591392 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.36■■■■■ 4.05
ROGDI-214ENST00000591392 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.35■■■■■ 4.05
ROGDI-214ENST00000591392 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
ROGDI-214ENST00000591392 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
ROGDI-214ENST00000591392 CUX1P39880 1505 aa40.25■■■■■ 4.03
ROGDI-214ENST00000591392 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.24■■■■■ 4.03
ROGDI-214ENST00000591392 SYNJ1O43426 1573 aa40.23■■■■■ 4.03
ROGDI-214ENST00000591392 GRIN2BQ13224 1484 aa40.22■■■■■ 4.03
ROGDI-214ENST00000591392 SYNJ2O15056 1496 aa40.13■■■■■ 4.02
ROGDI-214ENST00000591392 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.01■■■■■ 4
ROGDI-214ENST00000591392 PBRM1Q86U86 1689 aa39.96■■■■□ 3.99
ROGDI-214ENST00000591392 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.91■■■■□ 3.98
ROGDI-214ENST00000591392 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.84■■■■□ 3.97
ROGDI-214ENST00000591392 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.69■■■■□ 3.94
ROGDI-214ENST00000591392 GRIN2AQ12879 1464 aa39.68■■■■□ 3.94
ROGDI-214ENST00000591392 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
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ROGDI-214ENST00000591392 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.53■■■■□ 3.92
ROGDI-214ENST00000591392 CEP170Q5SW79 1584 aa39.51■■■■□ 3.92
ROGDI-214ENST00000591392 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.51■■■■□ 3.92
ROGDI-214ENST00000591392 TOP2BQ02880 1626 aa39.51■■■■□ 3.91
ROGDI-214ENST00000591392 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.5■■■■□ 3.91
ROGDI-214ENST00000591392 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.41■■■■□ 3.9
ROGDI-214ENST00000591392 SHROOM2Q13796 1616 aa39.4■■■■□ 3.9
ROGDI-214ENST00000591392 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
ROGDI-214ENST00000591392 JPH4Q96JJ6 628 aa39.18■■■■□ 3.86
ROGDI-214ENST00000591392 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.05■■■■□ 3.84
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