RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590466.2

UBXN6-206, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-206ENST00000590466 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.54■■■■■ 5.52
UBXN6-206ENST00000590466 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.03■■■■■ 4.64
UBXN6-206ENST00000590466 ABCC9O60706 1549 aa43.29■■■■■ 4.52
UBXN6-206ENST00000590466 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.54■■■■■ 4.24
UBXN6-206ENST00000590466 NACADO15069 1562 aa41.49■■■■■ 4.23
UBXN6-206ENST00000590466 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.4■■■■■ 4.22
UBXN6-206ENST00000590466 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.23■■■■■ 4.19
UBXN6-206ENST00000590466 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
UBXN6-206ENST00000590466 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.99■■■■■ 4.15
UBXN6-206ENST00000590466 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.56■■■■■ 4.08
UBXN6-206ENST00000590466 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.47■■■■■ 4.07
UBXN6-206ENST00000590466 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.36■■■■■ 4.05
UBXN6-206ENST00000590466 SCRIBQ14160 1630 aa40.16■■■■■ 4.02
UBXN6-206ENST00000590466 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40■■■■□ 3.99
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UBXN6-206ENST00000590466 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.14■■■■□ 3.86
UBXN6-206ENST00000590466 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.92■■■■□ 3.82
UBXN6-206ENST00000590466 SMARCA4P51532 1647 aa38.43■■■■□ 3.74
UBXN6-206ENST00000590466 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
UBXN6-206ENST00000590466 NCAPD3P42695 1498 aa38.34■■■■□ 3.73
UBXN6-206ENST00000590466 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.32■■■■□ 3.72
UBXN6-206ENST00000590466 SMARCA2P51531 1590 aa38.21■■■■□ 3.71
UBXN6-206ENST00000590466 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.19■■■■□ 3.7
UBXN6-206ENST00000590466 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.1■■■■□ 3.69
UBXN6-206ENST00000590466 HMGXB3Q12766 1538 aa38.07■■■■□ 3.69
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UBXN6-206ENST00000590466 WIZO95785 1651 aa37.71■■■■□ 3.63
UBXN6-206ENST00000590466 NESP48681 1621 aa37.44■■■■□ 3.58
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UBXN6-206ENST00000590466 ERCC6Q03468 1493 aa37.28■■■■□ 3.56
UBXN6-206ENST00000590466 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.28■■■■□ 3.56
UBXN6-206ENST00000590466 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.2■■■■□ 3.55
UBXN6-206ENST00000590466 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.05■■■■□ 3.52
UBXN6-206ENST00000590466 CUX2O14529 1486 aa36.99■■■■□ 3.51
UBXN6-206ENST00000590466 CFTRP13569 1480 aa36.94■■■■□ 3.5
UBXN6-206ENST00000590466 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.92■■■■□ 3.5
UBXN6-206ENST00000590466 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.9■■■■□ 3.5
UBXN6-206ENST00000590466 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
UBXN6-206ENST00000590466 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.74■■■■□ 3.47
UBXN6-206ENST00000590466 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.69■■■■□ 3.46
UBXN6-206ENST00000590466 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.69■■■■□ 3.46
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UBXN6-206ENST00000590466 WDR62O43379 1518 aa36.57■■■■□ 3.44
UBXN6-206ENST00000590466 PRDM2Q13029 1718 aa36.5■■■■□ 3.43
UBXN6-206ENST00000590466 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
UBXN6-206ENST00000590466 TOPBP1Q92547 1522 aa36.14■■■■□ 3.38
UBXN6-206ENST00000590466 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.12■■■■□ 3.37
UBXN6-206ENST00000590466 ABCC8Q09428 1581 aa36.1■■■■□ 3.37
UBXN6-206ENST00000590466 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.06■■■■□ 3.36
UBXN6-206ENST00000590466 IFT140Q96RY7 1462 aa35.95■■■■□ 3.35
UBXN6-206ENST00000590466 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
UBXN6-206ENST00000590466 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
UBXN6-206ENST00000590466 CUX1P39880 1505 aa35.82■■■■□ 3.32
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UBXN6-206ENST00000590466 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.7■■■■□ 3.31
UBXN6-206ENST00000590466 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.68■■■■□ 3.3
UBXN6-206ENST00000590466 SOGA1O94964 1423 aa35.68■■■■□ 3.3
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UBXN6-206ENST00000590466 OSCARQ8IYS5 282 aa35.46■■■■□ 3.27
UBXN6-206ENST00000590466 TOP2BQ02880 1626 aa35.43■■■■□ 3.26
UBXN6-206ENST00000590466 WDR97A6NE52 1622 aa35.43■■■■□ 3.26
UBXN6-206ENST00000590466 SYNJ1O43426 1573 aa35.42■■■■□ 3.26
UBXN6-206ENST00000590466 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.42■■■■□ 3.26
UBXN6-206ENST00000590466 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.37■■■■□ 3.25
UBXN6-206ENST00000590466 GRIN2BQ13224 1484 aa35.27■■■■□ 3.24
UBXN6-206ENST00000590466 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.25■■■■□ 3.23
UBXN6-206ENST00000590466 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.24■■■■□ 3.23
UBXN6-206ENST00000590466 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.21■■■■□ 3.23
UBXN6-206ENST00000590466 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
UBXN6-206ENST00000590466 CHD1O14646 1710 aa35.16■■■■□ 3.22
UBXN6-206ENST00000590466 FBLN2P98095 1184 aa35.15■■■■□ 3.22
UBXN6-206ENST00000590466 PBRM1Q86U86 1689 aa35.1■■■■□ 3.21
UBXN6-206ENST00000590466 SYNJ2O15056 1496 aa35.06■■■■□ 3.2
UBXN6-206ENST00000590466 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
UBXN6-206ENST00000590466 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.92■■■■□ 3.18
UBXN6-206ENST00000590466 ADAMTS12P58397 1594 aa34.87■■■■□ 3.17
UBXN6-206ENST00000590466 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.86■■■■□ 3.17
UBXN6-206ENST00000590466 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.86■■■■□ 3.17
UBXN6-206ENST00000590466 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.86■■■■□ 3.17
UBXN6-206ENST00000590466 ARHGEF11O15085 1522 aa34.86■■■■□ 3.17
UBXN6-206ENST00000590466 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.86■■■■□ 3.17
UBXN6-206ENST00000590466 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.85■■■■□ 3.17
UBXN6-206ENST00000590466 GRIN2AQ12879 1464 aa34.82■■■■□ 3.16
UBXN6-206ENST00000590466 KIF27Q86VH2 1401 aa34.78■■■■□ 3.16
UBXN6-206ENST00000590466 TRIM41Q8WV44 630 aa34.77■■■■□ 3.16
UBXN6-206ENST00000590466 IGF1RP08069 1367 aa34.73■■■■□ 3.15
UBXN6-206ENST00000590466 NUP160Q12769 1436 aa34.71■■■■□ 3.15
UBXN6-206ENST00000590466 CEP170Q5SW79 1584 aa34.65■■■■□ 3.14
UBXN6-206ENST00000590466 ARAP1Q96P48 1450 aa34.59■■■■□ 3.13
UBXN6-206ENST00000590466 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.57■■■■□ 3.12
UBXN6-206ENST00000590466 CUL7Q14999 1698 aa34.52■■■■□ 3.12
UBXN6-206ENST00000590466 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.48■■■■□ 3.11
UBXN6-206ENST00000590466 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.46■■■■□ 3.11
UBXN6-206ENST00000590466 SHROOM2Q13796 1616 aa34.42■■■■□ 3.1
UBXN6-206ENST00000590466 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.37■■■■□ 3.09
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