RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589649.1

TOMM40-205, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

TSL 2

Gene TOMM40, Length 731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-205ENST00000589649 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.86■■■■■ 7.33
TOMM40-205ENST00000589649 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.3■■■■■ 6.28
TOMM40-205ENST00000589649 ABCC9O60706 1549 aa54.13■■■■■ 6.26
TOMM40-205ENST00000589649 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.55■■■■■ 5.84
TOMM40-205ENST00000589649 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.4■■■■■ 5.82
TOMM40-205ENST00000589649 NACADO15069 1562 aa51.29■■■■■ 5.8
TOMM40-205ENST00000589649 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.67■■■■■ 5.7
TOMM40-205ENST00000589649 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.56■■■■■ 5.68
TOMM40-205ENST00000589649 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.51■■■■■ 5.68
TOMM40-205ENST00000589649 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.51■■■■■ 5.68
TOMM40-205ENST00000589649 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.39■■■■■ 5.66
TOMM40-205ENST00000589649 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.2■■■■■ 5.63
TOMM40-205ENST00000589649 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.1■■■■■ 5.61
TOMM40-205ENST00000589649 SCRIBQ14160 1630 aa49.67■■■■■ 5.54
TOMM40-205ENST00000589649 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.3■■■■■ 5.48
TOMM40-205ENST00000589649 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.83■■■■■ 5.41
TOMM40-205ENST00000589649 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.82■■■■■ 5.41
TOMM40-205ENST00000589649 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.67■■■■■ 5.38
TOMM40-205ENST00000589649 NCAPD3P42695 1498 aa47.4■■■■■ 5.18
TOMM40-205ENST00000589649 SMARCA4P51532 1647 aa47.37■■■■■ 5.17
TOMM40-205ENST00000589649 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.35■■■■■ 5.17
TOMM40-205ENST00000589649 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.17■■■■■ 5.14
TOMM40-205ENST00000589649 SMARCA2P51531 1590 aa47.15■■■■■ 5.14
TOMM40-205ENST00000589649 HMGXB3Q12766 1538 aa47.02■■■■■ 5.12
TOMM40-205ENST00000589649 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.96■■■■■ 5.11
TOMM40-205ENST00000589649 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.9■■■■■ 5.1
TOMM40-205ENST00000589649 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.85■■■■■ 5.09
TOMM40-205ENST00000589649 ERCC6Q03468 1493 aa46.64■■■■■ 5.06
TOMM40-205ENST00000589649 NESP48681 1621 aa46.64■■■■■ 5.06
TOMM40-205ENST00000589649 WIZO95785 1651 aa46.39■■■■■ 5.02
TOMM40-205ENST00000589649 CUX2O14529 1486 aa46.34■■■■■ 5.01
TOMM40-205ENST00000589649 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.21■■■■■ 4.99
TOMM40-205ENST00000589649 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.14■■■■■ 4.98
TOMM40-205ENST00000589649 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.02■■■■■ 4.96
TOMM40-205ENST00000589649 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.98■■■■■ 4.95
TOMM40-205ENST00000589649 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.97■■■■■ 4.95
TOMM40-205ENST00000589649 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
TOMM40-205ENST00000589649 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.94■■■■■ 4.94
TOMM40-205ENST00000589649 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.78■■■■■ 4.92
TOMM40-205ENST00000589649 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.57■■■■■ 4.89
TOMM40-205ENST00000589649 CFTRP13569 1480 aa45.55■■■■■ 4.88
TOMM40-205ENST00000589649 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.49■■■■■ 4.87
TOMM40-205ENST00000589649 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.47■■■■■ 4.87
TOMM40-205ENST00000589649 WDR62O43379 1518 aa45.42■■■■■ 4.86
TOMM40-205ENST00000589649 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.34■■■■■ 4.85
TOMM40-205ENST00000589649 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
TOMM40-205ENST00000589649 PRDM2Q13029 1718 aa44.98■■■■■ 4.79
TOMM40-205ENST00000589649 TOPBP1Q92547 1522 aa44.67■■■■■ 4.74
TOMM40-205ENST00000589649 IFT140Q96RY7 1462 aa44.54■■■■■ 4.72
TOMM40-205ENST00000589649 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.54■■■■■ 4.72
TOMM40-205ENST00000589649 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.52■■■■■ 4.72
TOMM40-205ENST00000589649 ABCC8Q09428 1581 aa44.51■■■■■ 4.72
TOMM40-205ENST00000589649 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.5■■■■■ 4.71
TOMM40-205ENST00000589649 OSCARQ8IYS5 282 aa44.41■■■■■ 4.7
TOMM40-205ENST00000589649 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
TOMM40-205ENST00000589649 TRIM41Q8WV44 630 aa44.23■■■■■ 4.67
TOMM40-205ENST00000589649 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.21■■■■■ 4.67
TOMM40-205ENST00000589649 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
TOMM40-205ENST00000589649 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.19■■■■■ 4.665e-7■■■■■ 31.3
TOMM40-205ENST00000589649 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.16■■■■■ 4.66
TOMM40-205ENST00000589649 SOGA1O94964 1423 aa44.08■■■■■ 4.65
TOMM40-205ENST00000589649 CUX1P39880 1505 aa44.08■■■■■ 4.65
TOMM40-205ENST00000589649 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.05■■■■■ 4.64
TOMM40-205ENST00000589649 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
TOMM40-205ENST00000589649 FBLN2P98095 1184 aa43.86■■■■■ 4.61
TOMM40-205ENST00000589649 CHD1O14646 1710 aa43.79■■■■■ 4.6
TOMM40-205ENST00000589649 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.73■■■■■ 4.59
TOMM40-205ENST00000589649 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.73■■■■■ 4.59
TOMM40-205ENST00000589649 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.73■■■■■ 4.59
TOMM40-205ENST00000589649 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.7■■■■■ 4.59
TOMM40-205ENST00000589649 WDR97A6NE52 1622 aa43.66■■■■■ 4.58
TOMM40-205ENST00000589649 ARHGEF11O15085 1522 aa43.64■■■■■ 4.58
TOMM40-205ENST00000589649 GRIN2BQ13224 1484 aa43.6■■■■■ 4.57
TOMM40-205ENST00000589649 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
TOMM40-205ENST00000589649 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.52■■■■■ 4.56
TOMM40-205ENST00000589649 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
TOMM40-205ENST00000589649 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.52■■■■■ 4.56
TOMM40-205ENST00000589649 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.49■■■■■ 4.55
TOMM40-205ENST00000589649 SYNJ1O43426 1573 aa43.44■■■■■ 4.54
TOMM40-205ENST00000589649 TOP2BQ02880 1626 aa43.41■■■■■ 4.54
TOMM40-205ENST00000589649 PBRM1Q86U86 1689 aa43.41■■■■■ 4.54
TOMM40-205ENST00000589649 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.41■■■■■ 4.54
TOMM40-205ENST00000589649 SYNJ2O15056 1496 aa43.4■■■■■ 4.54
TOMM40-205ENST00000589649 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.4■■■■■ 4.54
TOMM40-205ENST00000589649 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.4■■■■■ 4.54
TOMM40-205ENST00000589649 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.31■■■■■ 4.52
TOMM40-205ENST00000589649 ARAP1Q96P48 1450 aa43.27■■■■■ 4.52
TOMM40-205ENST00000589649 ADAMTS12P58397 1594 aa43.05■■■■■ 4.48
TOMM40-205ENST00000589649 GRIN2AQ12879 1464 aa43.05■■■■■ 4.48
TOMM40-205ENST00000589649 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.98■■■■■ 4.47
TOMM40-205ENST00000589649 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.95■■■■■ 4.47
TOMM40-205ENST00000589649 CEP170Q5SW79 1584 aa42.9■■■■■ 4.46
TOMM40-205ENST00000589649 NUP160Q12769 1436 aa42.88■■■■■ 4.46
TOMM40-205ENST00000589649 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
TOMM40-205ENST00000589649 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.77■■■■■ 4.44
TOMM40-205ENST00000589649 KIF27Q86VH2 1401 aa42.63■■■■■ 4.41
TOMM40-205ENST00000589649 IGF1RP08069 1367 aa42.62■■■■■ 4.41
TOMM40-205ENST00000589649 SHROOM2Q13796 1616 aa42.6■■■■■ 4.41
TOMM40-205ENST00000589649 JPH4Q96JJ6 628 aa42.52■■■■■ 4.4
TOMM40-205ENST00000589649 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.5■■■■■ 4.39
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