RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589172.5

SYT5-206, Transcript of synaptotagmin 5, humanhuman

TSL 4

Gene SYT5, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5-206ENST00000589172 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.12■■■□□ 2.09
SYT5-206ENST00000589172 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.82■■□□□ 1.56
SYT5-206ENST00000589172 ABCC9O60706 1549 aa23.89■■□□□ 1.41
SYT5-206ENST00000589172 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SYT5-206ENST00000589172 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.48■■□□□ 1.35
SYT5-206ENST00000589172 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.43■■□□□ 1.34
SYT5-206ENST00000589172 NACADO15069 1562 aa23.27■■□□□ 1.32
SYT5-206ENST00000589172 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.17■■□□□ 1.3
SYT5-206ENST00000589172 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.11■■□□□ 1.29
SYT5-206ENST00000589172 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.51■■□□□ 1.19
SYT5-206ENST00000589172 SCRIBQ14160 1630 aa22.46■■□□□ 1.19
SYT5-206ENST00000589172 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.42■■□□□ 1.18
SYT5-206ENST00000589172 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
SYT5-206ENST00000589172 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.29■■□□□ 1.16
SYT5-206ENST00000589172 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.94■■□□□ 1.1
SYT5-206ENST00000589172 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SYT5-206ENST00000589172 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SYT5-206ENST00000589172 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.65■■□□□ 1.06
SYT5-206ENST00000589172 SMARCA4P51532 1647 aa21.64■■□□□ 1.05
SYT5-206ENST00000589172 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.61■■□□□ 1.05
SYT5-206ENST00000589172 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SYT5-206ENST00000589172 SMARCA2P51531 1590 aa21.56■■□□□ 1.04
SYT5-206ENST00000589172 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.55■■□□□ 1.04
SYT5-206ENST00000589172 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT5-206ENST00000589172 NCAPD3P42695 1498 aa21.44■■□□□ 1.02
SYT5-206ENST00000589172 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.44■■□□□ 1.02
SYT5-206ENST00000589172 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
SYT5-206ENST00000589172 HMGXB3Q12766 1538 aa21.37■■□□□ 1.01
SYT5-206ENST00000589172 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SYT5-206ENST00000589172 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SYT5-206ENST00000589172 WIZO95785 1651 aa21.28■■□□□ 1
SYT5-206ENST00000589172 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.96■□□□□ 0.95
SYT5-206ENST00000589172 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.83■□□□□ 0.92
SYT5-206ENST00000589172 CFTRP13569 1480 aa20.8■□□□□ 0.92
SYT5-206ENST00000589172 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.77■□□□□ 0.92
SYT5-206ENST00000589172 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.69■□□□□ 0.9
SYT5-206ENST00000589172 NESP48681 1621 aa20.68■□□□□ 0.9
SYT5-206ENST00000589172 PRDM2Q13029 1718 aa20.6■□□□□ 0.89
SYT5-206ENST00000589172 ERCC6Q03468 1493 aa20.56■□□□□ 0.88
SYT5-206ENST00000589172 ABCC8Q09428 1581 aa20.52■□□□□ 0.88
SYT5-206ENST00000589172 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.51■□□□□ 0.87
SYT5-206ENST00000589172 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.48■□□□□ 0.87
SYT5-206ENST00000589172 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.45■□□□□ 0.86
SYT5-206ENST00000589172 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
SYT5-206ENST00000589172 TRIM41Q8WV44 630 aa20.35■□□□□ 0.85
SYT5-206ENST00000589172 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.34■□□□□ 0.85
SYT5-206ENST00000589172 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SYT5-206ENST00000589172 CUX2O14529 1486 aa20.32■□□□□ 0.84
SYT5-206ENST00000589172 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.32■□□□□ 0.84
SYT5-206ENST00000589172 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.29■□□□□ 0.84
SYT5-206ENST00000589172 TOP2BQ02880 1626 aa20.27■□□□□ 0.84
SYT5-206ENST00000589172 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.24■□□□□ 0.83
SYT5-206ENST00000589172 TOPBP1Q92547 1522 aa20.22■□□□□ 0.83
SYT5-206ENST00000589172 WDR62O43379 1518 aa20.21■□□□□ 0.83
SYT5-206ENST00000589172 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.2■□□□□ 0.82
SYT5-206ENST00000589172 CUX1P39880 1505 aa20.2■□□□□ 0.82
SYT5-206ENST00000589172 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SYT5-206ENST00000589172 EEA1Q15075 1411 aa20.15■□□□□ 0.82
SYT5-206ENST00000589172 SYNJ1O43426 1573 aa20.15■□□□□ 0.82
SYT5-206ENST00000589172 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.09■□□□□ 0.81
SYT5-206ENST00000589172 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SYT5-206ENST00000589172 IFT140Q96RY7 1462 aa20.08■□□□□ 0.81
SYT5-206ENST00000589172 WDR97A6NE52 1622 aa20.07■□□□□ 0.8
SYT5-206ENST00000589172 SOGA1O94964 1423 aa20.07■□□□□ 0.8
SYT5-206ENST00000589172 KIF27Q86VH2 1401 aa20.03■□□□□ 0.8
SYT5-206ENST00000589172 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.03■□□□□ 0.8
SYT5-206ENST00000589172 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
SYT5-206ENST00000589172 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.87■□□□□ 0.77
SYT5-206ENST00000589172 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.87■□□□□ 0.77
SYT5-206ENST00000589172 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.85■□□□□ 0.77
SYT5-206ENST00000589172 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.85■□□□□ 0.77
SYT5-206ENST00000589172 GRIN2BQ13224 1484 aa19.81■□□□□ 0.76
SYT5-206ENST00000589172 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.8■□□□□ 0.76
SYT5-206ENST00000589172 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
SYT5-206ENST00000589172 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
SYT5-206ENST00000589172 IGF1RP08069 1367 aa19.77■□□□□ 0.76
SYT5-206ENST00000589172 CUL7Q14999 1698 aa19.75■□□□□ 0.75
SYT5-206ENST00000589172 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
SYT5-206ENST00000589172 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.7■□□□□ 0.74
SYT5-206ENST00000589172 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
SYT5-206ENST00000589172 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.7■□□□□ 0.74
SYT5-206ENST00000589172 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.7■□□□□ 0.74
SYT5-206ENST00000589172 PRXQ9BXM0 1461 aa19.7■□□□□ 0.74
SYT5-206ENST00000589172 KIF21BO75037 1637 aa19.68■□□□□ 0.74
SYT5-206ENST00000589172 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.67■□□□□ 0.74
SYT5-206ENST00000589172 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.66■□□□□ 0.74
SYT5-206ENST00000589172 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
SYT5-206ENST00000589172 GOLGA3Q08378 1498 aa19.66■□□□□ 0.74
SYT5-206ENST00000589172 PBRM1Q86U86 1689 aa19.63■□□□□ 0.73
SYT5-206ENST00000589172 SYNJ2O15056 1496 aa19.6■□□□□ 0.73
SYT5-206ENST00000589172 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
SYT5-206ENST00000589172 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.58■□□□□ 0.72
SYT5-206ENST00000589172 ADAMTS12P58397 1594 aa19.57■□□□□ 0.72
SYT5-206ENST00000589172 OSCARQ8IYS5 282 aa19.54■□□□□ 0.72
SYT5-206ENST00000589172 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.54■□□□□ 0.72
SYT5-206ENST00000589172 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SYT5-206ENST00000589172 GRIN2AQ12879 1464 aa19.5■□□□□ 0.71
SYT5-206ENST00000589172 CHD1O14646 1710 aa19.49■□□□□ 0.71
SYT5-206ENST00000589172 FBLN2P98095 1184 aa19.47■□□□□ 0.71
SYT5-206ENST00000589172 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms