RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589034.5

PLIN3-204, Transcript of perilipin 3, humanhuman

TSL 5

Gene PLIN3, Length 574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3-204ENST00000589034 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.35■■■■■ 4.69
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PLIN3-204ENST00000589034 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.38■■■■□ 3.58
PLIN3-204ENST00000589034 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.3■■■■□ 3.56
PLIN3-204ENST00000589034 NACADO15069 1562 aa37.26■■■■□ 3.56
PLIN3-204ENST00000589034 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.92■■■■□ 3.5
PLIN3-204ENST00000589034 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
PLIN3-204ENST00000589034 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.67■■■■□ 3.46
PLIN3-204ENST00000589034 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.48■■■■□ 3.43
PLIN3-204ENST00000589034 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.42■■■■□ 3.42
PLIN3-204ENST00000589034 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.2■■■■□ 3.39
PLIN3-204ENST00000589034 SCRIBQ14160 1630 aa36.07■■■■□ 3.36
PLIN3-204ENST00000589034 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.02■■■■□ 3.36
PLIN3-204ENST00000589034 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.83■■■■□ 3.33
PLIN3-204ENST00000589034 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
PLIN3-204ENST00000589034 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.24■■■■□ 3.23
PLIN3-204ENST00000589034 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.07■■■■□ 3.2
PLIN3-204ENST00000589034 SMARCA4P51532 1647 aa34.46■■■■□ 3.11
PLIN3-204ENST00000589034 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
PLIN3-204ENST00000589034 NCAPD3P42695 1498 aa34.39■■■■□ 3.1
PLIN3-204ENST00000589034 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.36■■■■□ 3.09
PLIN3-204ENST00000589034 SMARCA2P51531 1590 aa34.32■■■■□ 3.09
PLIN3-204ENST00000589034 HMGXB3Q12766 1538 aa34.17■■■■□ 3.06
PLIN3-204ENST00000589034 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.17■■■■□ 3.06
PLIN3-204ENST00000589034 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.11■■■■□ 3.05
PLIN3-204ENST00000589034 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
PLIN3-204ENST00000589034 WIZO95785 1651 aa33.79■■■■□ 3
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PLIN3-204ENST00000589034 ERCC6Q03468 1493 aa33.66■■■□□ 2.98
PLIN3-204ENST00000589034 NESP48681 1621 aa33.64■■■□□ 2.98
PLIN3-204ENST00000589034 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.52■■■□□ 2.96
PLIN3-204ENST00000589034 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
PLIN3-204ENST00000589034 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.39■■■□□ 2.94
PLIN3-204ENST00000589034 CUX2O14529 1486 aa33.37■■■□□ 2.93
PLIN3-204ENST00000589034 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.35■■■□□ 2.93
PLIN3-204ENST00000589034 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.22■■■□□ 2.91
PLIN3-204ENST00000589034 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
PLIN3-204ENST00000589034 CFTRP13569 1480 aa33.11■■■□□ 2.89
PLIN3-204ENST00000589034 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.05■■■□□ 2.88
PLIN3-204ENST00000589034 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.99■■■□□ 2.87
PLIN3-204ENST00000589034 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.99■■■□□ 2.87
PLIN3-204ENST00000589034 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.99■■■□□ 2.87
PLIN3-204ENST00000589034 WDR62O43379 1518 aa32.86■■■□□ 2.85
PLIN3-204ENST00000589034 PRDM2Q13029 1718 aa32.82■■■□□ 2.84
PLIN3-204ENST00000589034 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
PLIN3-204ENST00000589034 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.71■■■□□ 2.83
PLIN3-204ENST00000589034 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
PLIN3-204ENST00000589034 ABCC8Q09428 1581 aa32.45■■■□□ 2.79
PLIN3-204ENST00000589034 TOPBP1Q92547 1522 aa32.43■■■□□ 2.78
PLIN3-204ENST00000589034 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.36■■■□□ 2.77
PLIN3-204ENST00000589034 IFT140Q96RY7 1462 aa32.31■■■□□ 2.76
PLIN3-204ENST00000589034 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
PLIN3-204ENST00000589034 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
PLIN3-204ENST00000589034 CUX1P39880 1505 aa32.07■■■□□ 2.72
PLIN3-204ENST00000589034 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
PLIN3-204ENST00000589034 SOGA1O94964 1423 aa32.04■■■□□ 2.72
PLIN3-204ENST00000589034 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.02■■■□□ 2.72
PLIN3-204ENST00000589034 OSCARQ8IYS5 282 aa32.01■■■□□ 2.71
PLIN3-204ENST00000589034 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.01■■■□□ 2.71
PLIN3-204ENST00000589034 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
PLIN3-204ENST00000589034 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.97■■■□□ 2.716e-8■■■■□ 26.4
PLIN3-204ENST00000589034 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
PLIN3-204ENST00000589034 WDR97A6NE52 1622 aa31.82■■■□□ 2.69
PLIN3-204ENST00000589034 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.8■■■□□ 2.68
PLIN3-204ENST00000589034 FBLN2P98095 1184 aa31.73■■■□□ 2.67
PLIN3-204ENST00000589034 TOP2BQ02880 1626 aa31.72■■■□□ 2.67
PLIN3-204ENST00000589034 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.71■■■□□ 2.67
PLIN3-204ENST00000589034 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.7■■■□□ 2.66
PLIN3-204ENST00000589034 SYNJ1O43426 1573 aa31.68■■■□□ 2.66
PLIN3-204ENST00000589034 GRIN2BQ13224 1484 aa31.68■■■□□ 2.66
PLIN3-204ENST00000589034 CHD1O14646 1710 aa31.67■■■□□ 2.66
PLIN3-204ENST00000589034 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.66■■■□□ 2.66
PLIN3-204ENST00000589034 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.65■■■□□ 2.66
PLIN3-204ENST00000589034 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
PLIN3-204ENST00000589034 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
PLIN3-204ENST00000589034 PBRM1Q86U86 1689 aa31.57■■■□□ 2.64
PLIN3-204ENST00000589034 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.57■■■□□ 2.64
PLIN3-204ENST00000589034 TRIM41Q8WV44 630 aa31.55■■■□□ 2.64
PLIN3-204ENST00000589034 SYNJ2O15056 1496 aa31.5■■■□□ 2.63
PLIN3-204ENST00000589034 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.44■■■□□ 2.62
PLIN3-204ENST00000589034 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.44■■■□□ 2.62
PLIN3-204ENST00000589034 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.44■■■□□ 2.62
PLIN3-204ENST00000589034 ARHGEF11O15085 1522 aa31.41■■■□□ 2.62
PLIN3-204ENST00000589034 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.32■■■□□ 2.6
PLIN3-204ENST00000589034 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.31■■■□□ 2.6
PLIN3-204ENST00000589034 ADAMTS12P58397 1594 aa31.3■■■□□ 2.6
PLIN3-204ENST00000589034 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.28■■■□□ 2.6
PLIN3-204ENST00000589034 GRIN2AQ12879 1464 aa31.25■■■□□ 2.59
PLIN3-204ENST00000589034 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.21■■■□□ 2.59
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PLIN3-204ENST00000589034 ARAP1Q96P48 1450 aa31.14■■■□□ 2.57
PLIN3-204ENST00000589034 NUP160Q12769 1436 aa31.11■■■□□ 2.57
PLIN3-204ENST00000589034 CEP170Q5SW79 1584 aa31.09■■■□□ 2.57
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PLIN3-204ENST00000589034 CUL7Q14999 1698 aa30.98■■■□□ 2.55
PLIN3-204ENST00000589034 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.9■■■□□ 2.54
PLIN3-204ENST00000589034 SHROOM2Q13796 1616 aa30.89■■■□□ 2.54
PLIN3-204ENST00000589034 JPH4Q96JJ6 628 aa30.87■■■□□ 2.53
PLIN3-204ENST00000589034 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.85■■■□□ 2.53
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