RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589016.5

CCDC159-211, Transcript of coiled-coil domain containing 159, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC159, Length 954 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159-211ENST00000589016 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.78■■■■■ 4.12
CCDC159-211ENST00000589016 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.42■■■■□ 3.42
CCDC159-211ENST00000589016 ABCC9O60706 1549 aa36.09■■■■□ 3.37
CCDC159-211ENST00000589016 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.56■■■■□ 3.12
CCDC159-211ENST00000589016 NACADO15069 1562 aa34.42■■■■□ 3.1
CCDC159-211ENST00000589016 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.34■■■■□ 3.09
CCDC159-211ENST00000589016 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.1■■■■□ 3.05
CCDC159-211ENST00000589016 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
CCDC159-211ENST00000589016 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.76■■■■□ 3
CCDC159-211ENST00000589016 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.69■■■□□ 2.98
CCDC159-211ENST00000589016 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.61■■■□□ 2.97
CCDC159-211ENST00000589016 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.57■■■□□ 2.96
CCDC159-211ENST00000589016 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.45■■■□□ 2.95
CCDC159-211ENST00000589016 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.18■■■□□ 2.9
CCDC159-211ENST00000589016 SCRIBQ14160 1630 aa33.15■■■□□ 2.9
CCDC159-211ENST00000589016 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
CCDC159-211ENST00000589016 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.61■■■□□ 2.81
CCDC159-211ENST00000589016 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.52■■■□□ 2.8
CCDC159-211ENST00000589016 NCAPD3P42695 1498 aa31.78■■■□□ 2.68
CCDC159-211ENST00000589016 SMARCA4P51532 1647 aa31.7■■■□□ 2.66
CCDC159-211ENST00000589016 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.7■■■□□ 2.66
CCDC159-211ENST00000589016 SMARCA2P51531 1590 aa31.65■■■□□ 2.66
CCDC159-211ENST00000589016 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
CCDC159-211ENST00000589016 HMGXB3Q12766 1538 aa31.54■■■□□ 2.64
CCDC159-211ENST00000589016 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.43■■■□□ 2.62
CCDC159-211ENST00000589016 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
CCDC159-211ENST00000589016 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.38■■■□□ 2.61
CCDC159-211ENST00000589016 ERCC6Q03468 1493 aa31.19■■■□□ 2.58
CCDC159-211ENST00000589016 NESP48681 1621 aa31.06■■■□□ 2.56
CCDC159-211ENST00000589016 CUX2O14529 1486 aa31.05■■■□□ 2.56
CCDC159-211ENST00000589016 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.99■■■□□ 2.55
CCDC159-211ENST00000589016 WIZO95785 1651 aa30.98■■■□□ 2.55
CCDC159-211ENST00000589016 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CCDC159-211ENST00000589016 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.87■■■□□ 2.53
CCDC159-211ENST00000589016 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.85■■■□□ 2.53
CCDC159-211ENST00000589016 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.69■■■□□ 2.5
CCDC159-211ENST00000589016 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
CCDC159-211ENST00000589016 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
CCDC159-211ENST00000589016 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.63■■■□□ 2.49
CCDC159-211ENST00000589016 CFTRP13569 1480 aa30.53■■■□□ 2.48
CCDC159-211ENST00000589016 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.5■■■□□ 2.47
CCDC159-211ENST00000589016 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.45■■■□□ 2.47
CCDC159-211ENST00000589016 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.44■■■□□ 2.46
CCDC159-211ENST00000589016 WDR62O43379 1518 aa30.39■■■□□ 2.46
CCDC159-211ENST00000589016 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.35■■■□□ 2.45
CCDC159-211ENST00000589016 PRDM2Q13029 1718 aa30.14■■■□□ 2.42
CCDC159-211ENST00000589016 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
CCDC159-211ENST00000589016 ABCC8Q09428 1581 aa29.97■■■□□ 2.39
CCDC159-211ENST00000589016 TOPBP1Q92547 1522 aa29.89■■■□□ 2.38
CCDC159-211ENST00000589016 IFT140Q96RY7 1462 aa29.87■■■□□ 2.37
CCDC159-211ENST00000589016 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.81■■■□□ 2.36
CCDC159-211ENST00000589016 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
CCDC159-211ENST00000589016 OSCARQ8IYS5 282 aa29.76■■■□□ 2.35
CCDC159-211ENST00000589016 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
CCDC159-211ENST00000589016 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
CCDC159-211ENST00000589016 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
CCDC159-211ENST00000589016 SOGA1O94964 1423 aa29.54■■■□□ 2.32
CCDC159-211ENST00000589016 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
CCDC159-211ENST00000589016 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.51■■■□□ 2.31
CCDC159-211ENST00000589016 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.47■■■□□ 2.31
CCDC159-211ENST00000589016 CUX1P39880 1505 aa29.46■■■□□ 2.31
CCDC159-211ENST00000589016 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.46■■■□□ 2.31
CCDC159-211ENST00000589016 TRIM41Q8WV44 630 aa29.42■■■□□ 2.3
CCDC159-211ENST00000589016 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CCDC159-211ENST00000589016 WDR97A6NE52 1622 aa29.38■■■□□ 2.29
CCDC159-211ENST00000589016 FBLN2P98095 1184 aa29.31■■■□□ 2.28
CCDC159-211ENST00000589016 GRIN2BQ13224 1484 aa29.23■■■□□ 2.27
CCDC159-211ENST00000589016 CHD1O14646 1710 aa29.21■■■□□ 2.27
CCDC159-211ENST00000589016 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.2■■■□□ 2.26
CCDC159-211ENST00000589016 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
CCDC159-211ENST00000589016 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
CCDC159-211ENST00000589016 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.19■■■□□ 2.26
CCDC159-211ENST00000589016 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.18■■■□□ 2.26
CCDC159-211ENST00000589016 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.17■■■□□ 2.26
CCDC159-211ENST00000589016 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.16■■■□□ 2.26
CCDC159-211ENST00000589016 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.16■■■□□ 2.26
CCDC159-211ENST00000589016 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.16■■■□□ 2.26
CCDC159-211ENST00000589016 ARHGEF11O15085 1522 aa29.15■■■□□ 2.26
CCDC159-211ENST00000589016 TOP2BQ02880 1626 aa29.1■■■□□ 2.25
CCDC159-211ENST00000589016 SYNJ2O15056 1496 aa29.09■■■□□ 2.25
CCDC159-211ENST00000589016 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.08■■■□□ 2.25
CCDC159-211ENST00000589016 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.03■■■□□ 2.24
CCDC159-211ENST00000589016 SYNJ1O43426 1573 aa29.02■■■□□ 2.24
CCDC159-211ENST00000589016 PBRM1Q86U86 1689 aa29.02■■■□□ 2.24
CCDC159-211ENST00000589016 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.98■■■□□ 2.23
CCDC159-211ENST00000589016 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.95■■■□□ 2.23
CCDC159-211ENST00000589016 ARAP1Q96P48 1450 aa28.86■■■□□ 2.21
CCDC159-211ENST00000589016 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.84■■■□□ 2.21
CCDC159-211ENST00000589016 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.83■■■□□ 2.21
CCDC159-211ENST00000589016 GRIN2AQ12879 1464 aa28.82■■■□□ 2.2
CCDC159-211ENST00000589016 ADAMTS12P58397 1594 aa28.79■■■□□ 2.2
CCDC159-211ENST00000589016 NUP160Q12769 1436 aa28.73■■■□□ 2.19
CCDC159-211ENST00000589016 CEP170Q5SW79 1584 aa28.64■■■□□ 2.18
CCDC159-211ENST00000589016 KIF27Q86VH2 1401 aa28.63■■■□□ 2.17
CCDC159-211ENST00000589016 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
CCDC159-211ENST00000589016 IGF1RP08069 1367 aa28.56■■■□□ 2.16
CCDC159-211ENST00000589016 JPH4Q96JJ6 628 aa28.51■■■□□ 2.15
CCDC159-211ENST00000589016 SHROOM2Q13796 1616 aa28.51■■■□□ 2.15
CCDC159-211ENST00000589016 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.46■■■□□ 2.15
CCDC159-211ENST00000589016 CUL7Q14999 1698 aa28.45■■■□□ 2.14
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