RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588979.5

ZFP30-208, Transcript of ZFP30 zinc finger protein, humanhuman

TSL 3

Gene ZFP30, Length 583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP30-208ENST00000588979 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.29■■■■■ 6.44
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ZFP30-208ENST00000588979 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.98■■■■■ 5.11
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ZFP30-208ENST00000588979 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.23■■■■■ 4.99
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ZFP30-208ENST00000588979 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.1■■■■■ 4.97
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ZFP30-208ENST00000588979 SCRIBQ14160 1630 aa45.13■■■■■ 4.82
ZFP30-208ENST00000588979 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.08■■■■■ 4.81
ZFP30-208ENST00000588979 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.44■■■■■ 4.7
ZFP30-208ENST00000588979 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
ZFP30-208ENST00000588979 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.17■■■■■ 4.66
ZFP30-208ENST00000588979 SMARCA4P51532 1647 aa43.14■■■■■ 4.5
ZFP30-208ENST00000588979 NCAPD3P42695 1498 aa43.06■■■■■ 4.48
ZFP30-208ENST00000588979 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.98■■■■■ 4.47
ZFP30-208ENST00000588979 SMARCA2P51531 1590 aa42.95■■■■■ 4.47
ZFP30-208ENST00000588979 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
ZFP30-208ENST00000588979 HMGXB3Q12766 1538 aa42.89■■■■■ 4.46
ZFP30-208ENST00000588979 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.73■■■■■ 4.43
ZFP30-208ENST00000588979 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.6■■■■■ 4.41
ZFP30-208ENST00000588979 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.6■■■■■ 4.41
ZFP30-208ENST00000588979 ERCC6Q03468 1493 aa42.34■■■■■ 4.37
ZFP30-208ENST00000588979 NESP48681 1621 aa42.27■■■■■ 4.36
ZFP30-208ENST00000588979 CUX2O14529 1486 aa42.22■■■■■ 4.35
ZFP30-208ENST00000588979 WIZO95785 1651 aa42.16■■■■■ 4.34
ZFP30-208ENST00000588979 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.14■■■■■ 4.34
ZFP30-208ENST00000588979 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
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ZFP30-208ENST00000588979 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
ZFP30-208ENST00000588979 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.75■■■■■ 4.27
ZFP30-208ENST00000588979 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.71■■■■■ 4.27
ZFP30-208ENST00000588979 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
ZFP30-208ENST00000588979 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.63■■■■■ 4.25
ZFP30-208ENST00000588979 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.43■■■■■ 4.22
ZFP30-208ENST00000588979 CFTRP13569 1480 aa41.38■■■■■ 4.21
ZFP30-208ENST00000588979 WDR62O43379 1518 aa41.38■■■■■ 4.21
ZFP30-208ENST00000588979 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.34■■■■■ 4.21
ZFP30-208ENST00000588979 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.29■■■■■ 4.2
ZFP30-208ENST00000588979 PRDM2Q13029 1718 aa41.29■■■■■ 4.2
ZFP30-208ENST00000588979 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.08■■■■■ 4.17
ZFP30-208ENST00000588979 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
ZFP30-208ENST00000588979 TOPBP1Q92547 1522 aa40.58■■■■■ 4.09
ZFP30-208ENST00000588979 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.52■■■■■ 4.08
ZFP30-208ENST00000588979 ABCC8Q09428 1581 aa40.52■■■■■ 4.08
ZFP30-208ENST00000588979 IFT140Q96RY7 1462 aa40.48■■■■■ 4.07
ZFP30-208ENST00000588979 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
ZFP30-208ENST00000588979 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
ZFP30-208ENST00000588979 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
ZFP30-208ENST00000588979 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
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ZFP30-208ENST00000588979 SOGA1O94964 1423 aa39.91■■■■□ 3.98
ZFP30-208ENST00000588979 TRIM41Q8WV44 630 aa39.88■■■■□ 3.97
ZFP30-208ENST00000588979 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.83■■■■□ 3.97
ZFP30-208ENST00000588979 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.83■■■■□ 3.97
ZFP30-208ENST00000588979 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.83■■■■□ 3.97
ZFP30-208ENST00000588979 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.76■■■■□ 3.96
ZFP30-208ENST00000588979 ARHGEF11O15085 1522 aa39.69■■■■□ 3.94
ZFP30-208ENST00000588979 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.67■■■■□ 3.94
ZFP30-208ENST00000588979 PBRM1Q86U86 1689 aa39.66■■■■□ 3.94
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ZFP30-208ENST00000588979 GRIN2BQ13224 1484 aa39.6■■■■□ 3.93
ZFP30-208ENST00000588979 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.59■■■■□ 3.93
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ZFP30-208ENST00000588979 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.1■■■■□ 3.85
ZFP30-208ENST00000588979 CEP170Q5SW79 1584 aa39.01■■■■□ 3.84
ZFP30-208ENST00000588979 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39■■■■□ 3.83
ZFP30-208ENST00000588979 NUP160Q12769 1436 aa38.97■■■■□ 3.83
ZFP30-208ENST00000588979 SHROOM2Q13796 1616 aa38.88■■■■□ 3.81
ZFP30-208ENST00000588979 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.81■■■■□ 3.8
ZFP30-208ENST00000588979 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.68■■■■□ 3.78
ZFP30-208ENST00000588979 CUL7Q14999 1698 aa38.68■■■■□ 3.78
ZFP30-208ENST00000588979 KIF27Q86VH2 1401 aa38.63■■■■□ 3.78
ZFP30-208ENST00000588979 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
ZFP30-208ENST00000588979 IGF1RP08069 1367 aa38.53■■■■□ 3.76
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