RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588778.1

NAGPA-AS1-201, NAGPA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene NAGPA-AS1, Length 521 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.69■■■■□ 3.3
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.93■■■□□ 2.7
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 ABCC9O60706 1549 aa31.92■■■□□ 2.7
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.36■■■□□ 2.45
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 NACADO15069 1562 aa30.19■■■□□ 2.42
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.03■■■□□ 2.4
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.03■■■□□ 2.4
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.82■■■□□ 2.36
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.77■■■□□ 2.36
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.76■■■□□ 2.35
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.6■■■□□ 2.33
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.47■■■□□ 2.31
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 SCRIBQ14160 1630 aa29.12■■■□□ 2.25
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.07■■■□□ 2.24
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.85■■■□□ 2.21
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.73■■■□□ 2.19
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 NCAPD3P42695 1498 aa27.92■■■□□ 2.06
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.84■■■□□ 2.05
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 SMARCA4P51532 1647 aa27.81■■■□□ 2.04
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 SMARCA2P51531 1590 aa27.7■■■□□ 2.03
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 HMGXB3Q12766 1538 aa27.67■■■□□ 2.02
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.56■■■□□ 2
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.53■■■□□ 2
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.51■■■□□ 2
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 NESP48681 1621 aa27.49■■□□□ 1.99
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 ERCC6Q03468 1493 aa27.47■■□□□ 1.99
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 CUX2O14529 1486 aa27.44■■□□□ 1.98
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.44■■□□□ 1.98
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.22■■□□□ 1.95
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 WIZO95785 1651 aa27.19■■□□□ 1.94
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.09■■□□□ 1.93
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.06■■□□□ 1.92
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.05■■□□□ 1.92
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.83■■□□□ 1.89
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 WDR62O43379 1518 aa26.79■■□□□ 1.88
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 CFTRP13569 1480 aa26.77■■□□□ 1.88
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.73■■□□□ 1.87
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.72■■□□□ 1.87
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.55■■□□□ 1.84
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 PRDM2Q13029 1718 aa26.46■■□□□ 1.83
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 TOPBP1Q92547 1522 aa26.25■■□□□ 1.79
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 OSCARQ8IYS5 282 aa26.22■■□□□ 1.79
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 IFT140Q96RY7 1462 aa26.2■■□□□ 1.78
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 TRIM41Q8WV44 630 aa26.19■■□□□ 1.78
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 ABCC8Q09428 1581 aa26.13■■□□□ 1.77
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.13■■□□□ 1.77
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.92■■□□□ 1.74
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.9■■□□□ 1.74
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.9■■□□□ 1.74
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.9■■□□□ 1.74
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 SOGA1O94964 1423 aa25.86■■□□□ 1.73
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 CUX1P39880 1505 aa25.85■■□□□ 1.73
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 CHD1O14646 1710 aa25.83■■□□□ 1.73
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.82■■□□□ 1.72
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 ARHGEF11O15085 1522 aa25.82■■□□□ 1.72
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 FBLN2P98095 1184 aa25.71■■□□□ 1.71
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 WDR97A6NE52 1622 aa25.69■■□□□ 1.7
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.68■■□□□ 1.7
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.62■■□□□ 1.69
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 GRIN2BQ13224 1484 aa25.6■■□□□ 1.69
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 ARAP1Q96P48 1450 aa25.6■■□□□ 1.69
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.56■■□□□ 1.68
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.54■■□□□ 1.68
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.53■■□□□ 1.68
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 SYNJ2O15056 1496 aa25.52■■□□□ 1.68
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 PBRM1Q86U86 1689 aa25.51■■□□□ 1.67
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.5■■□□□ 1.67
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 SYNJ1O43426 1573 aa25.47■■□□□ 1.67
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 TOP2BQ02880 1626 aa25.41■■□□□ 1.66
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.41■■□□□ 1.66
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 GRIN2AQ12879 1464 aa25.28■■□□□ 1.64
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 ADAMTS12P58397 1594 aa25.28■■□□□ 1.64
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 NUP160Q12769 1436 aa25.23■■□□□ 1.63
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 CEP170Q5SW79 1584 aa25.22■■□□□ 1.63
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.22■■□□□ 1.63
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.2■■□□□ 1.63
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.2■■□□□ 1.62
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 SHROOM2Q13796 1616 aa25.12■■□□□ 1.61
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 JPH4Q96JJ6 628 aa24.97■■□□□ 1.59
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 IGF1RP08069 1367 aa24.96■■□□□ 1.59
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
NAGPA-AS1-201ENST00000588778 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.92■■□□□ 1.58
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