RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588767.5

SLC25A39-211, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 5

Gene SLC25A39, Length 807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-211ENST00000588767 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.78■■■■□ 3.48
SLC25A39-211ENST00000588767 ABCC9O60706 1549 aa33.58■■■□□ 2.97
SLC25A39-211ENST00000588767 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.21■■■□□ 2.91
SLC25A39-211ENST00000588767 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.95■■■□□ 2.71
SLC25A39-211ENST00000588767 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.81■■■□□ 2.68
SLC25A39-211ENST00000588767 NACADO15069 1562 aa31.51■■■□□ 2.63
SLC25A39-211ENST00000588767 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.16■■■□□ 2.581e-7■■■□□ 17.8
SLC25A39-211ENST00000588767 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.05■■■□□ 2.56
SLC25A39-211ENST00000588767 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.04■■■□□ 2.56
SLC25A39-211ENST00000588767 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.99■■■□□ 2.55
SLC25A39-211ENST00000588767 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.94■■■□□ 2.54
SLC25A39-211ENST00000588767 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.54■■■□□ 2.48
SLC25A39-211ENST00000588767 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.41■■■□□ 2.46
SLC25A39-211ENST00000588767 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
SLC25A39-211ENST00000588767 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.34■■■□□ 2.45
SLC25A39-211ENST00000588767 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.34■■■□□ 2.45
SLC25A39-211ENST00000588767 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
SLC25A39-211ENST00000588767 SCRIBQ14160 1630 aa30.15■■■□□ 2.42
SLC25A39-211ENST00000588767 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.7■■■□□ 2.35
SLC25A39-211ENST00000588767 CUX2O14529 1486 aa29.21■■■□□ 2.27
SLC25A39-211ENST00000588767 NCAPD3P42695 1498 aa29.12■■■□□ 2.25
SLC25A39-211ENST00000588767 ERCC6Q03468 1493 aa29.02■■■□□ 2.24
SLC25A39-211ENST00000588767 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.93■■■□□ 2.22
SLC25A39-211ENST00000588767 HMGXB3Q12766 1538 aa28.85■■■□□ 2.21
SLC25A39-211ENST00000588767 SMARCA2P51531 1590 aa28.82■■■□□ 2.2
SLC25A39-211ENST00000588767 SMARCA4P51532 1647 aa28.77■■■□□ 2.2
SLC25A39-211ENST00000588767 NESP48681 1621 aa28.73■■■□□ 2.19
SLC25A39-211ENST00000588767 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SLC25A39-211ENST00000588767 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
SLC25A39-211ENST00000588767 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
SLC25A39-211ENST00000588767 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.56■■■□□ 2.16
SLC25A39-211ENST00000588767 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.5■■■□□ 2.15
SLC25A39-211ENST00000588767 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.34■■■□□ 2.13
SLC25A39-211ENST00000588767 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.33■■■□□ 2.13
SLC25A39-211ENST00000588767 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.31■■■□□ 2.12
SLC25A39-211ENST00000588767 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.17■■■□□ 2.1
SLC25A39-211ENST00000588767 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.13■■■□□ 2.09
SLC25A39-211ENST00000588767 WDR62O43379 1518 aa28.11■■■□□ 2.09
SLC25A39-211ENST00000588767 TRIM41Q8WV44 630 aa28.08■■■□□ 2.09
SLC25A39-211ENST00000588767 WIZO95785 1651 aa27.91■■■□□ 2.06
SLC25A39-211ENST00000588767 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.9■■■□□ 2.06
SLC25A39-211ENST00000588767 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.83■■■□□ 2.05
SLC25A39-211ENST00000588767 CFTRP13569 1480 aa27.78■■■□□ 2.04
SLC25A39-211ENST00000588767 OSCARQ8IYS5 282 aa27.73■■■□□ 2.03
SLC25A39-211ENST00000588767 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
SLC25A39-211ENST00000588767 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
SLC25A39-211ENST00000588767 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
SLC25A39-211ENST00000588767 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC25A39-211ENST00000588767 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC25A39-211ENST00000588767 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.44■■□□□ 1.98
SLC25A39-211ENST00000588767 PRDM2Q13029 1718 aa27.4■■□□□ 1.98
SLC25A39-211ENST00000588767 IFT140Q96RY7 1462 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC25A39-211ENST00000588767 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
SLC25A39-211ENST00000588767 ARHGEF11O15085 1522 aa27.33■■□□□ 1.97
SLC25A39-211ENST00000588767 TOPBP1Q92547 1522 aa27.26■■□□□ 1.96
SLC25A39-211ENST00000588767 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.25■■□□□ 1.95
SLC25A39-211ENST00000588767 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
SLC25A39-211ENST00000588767 ABCC8Q09428 1581 aa27.18■■□□□ 1.94
SLC25A39-211ENST00000588767 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.14■■□□□ 1.93
SLC25A39-211ENST00000588767 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.08■■□□□ 1.93
SLC25A39-211ENST00000588767 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
SLC25A39-211ENST00000588767 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.05■■□□□ 1.923e-7■■■■■ 33.9
SLC25A39-211ENST00000588767 CHD1O14646 1710 aa27.04■■□□□ 1.92
SLC25A39-211ENST00000588767 ARAP1Q96P48 1450 aa27.04■■□□□ 1.92
SLC25A39-211ENST00000588767 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SLC25A39-211ENST00000588767 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SLC25A39-211ENST00000588767 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SLC25A39-211ENST00000588767 FBLN2P98095 1184 aa26.86■■□□□ 1.89
SLC25A39-211ENST00000588767 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC25A39-211ENST00000588767 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC25A39-211ENST00000588767 WDR97A6NE52 1622 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC25A39-211ENST00000588767 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SLC25A39-211ENST00000588767 SOGA1O94964 1423 aa26.8■■□□□ 1.88
SLC25A39-211ENST00000588767 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.77■■□□□ 1.88
SLC25A39-211ENST00000588767 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SLC25A39-211ENST00000588767 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC25A39-211ENST00000588767 SYNJ1O43426 1573 aa26.7■■□□□ 1.86
SLC25A39-211ENST00000588767 GRIN2BQ13224 1484 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC25A39-211ENST00000588767 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
SLC25A39-211ENST00000588767 SYNJ2O15056 1496 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC25A39-211ENST00000588767 CUX1P39880 1505 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC25A39-211ENST00000588767 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC25A39-211ENST00000588767 PBRM1Q86U86 1689 aa26.47■■□□□ 1.83
SLC25A39-211ENST00000588767 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SLC25A39-211ENST00000588767 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC25A39-211ENST00000588767 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.42■■□□□ 1.82
SLC25A39-211ENST00000588767 GRIN2AQ12879 1464 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC25A39-211ENST00000588767 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC25A39-211ENST00000588767 NUP160Q12769 1436 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC25A39-211ENST00000588767 ADAMTS12P58397 1594 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-211ENST00000588767 CEP170Q5SW79 1584 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-211ENST00000588767 SHROOM2Q13796 1616 aa26.21■■□□□ 1.79
SLC25A39-211ENST00000588767 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
SLC25A39-211ENST00000588767 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.14■■□□□ 1.78
SLC25A39-211ENST00000588767 TOP2BQ02880 1626 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC25A39-211ENST00000588767 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC25A39-211ENST00000588767 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC25A39-211ENST00000588767 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.04■■□□□ 1.76
SLC25A39-211ENST00000588767 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SLC25A39-211ENST00000588767 JPH4Q96JJ6 628 aa25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms