RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588764.5

PODNL1-211, Transcript of podocan like 1, humanhuman

TSL 3

Gene PODNL1, Length 545 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODNL1-211ENST00000588764 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.46■■■■■ 5.51
PODNL1-211ENST00000588764 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.26■■■■■ 4.68
PODNL1-211ENST00000588764 ABCC9O60706 1549 aa43.89■■■■■ 4.62
PODNL1-211ENST00000588764 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.98■■■■■ 4.31
PODNL1-211ENST00000588764 NACADO15069 1562 aa41.78■■■■■ 4.28
PODNL1-211ENST00000588764 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.64■■■■■ 4.26
PODNL1-211ENST00000588764 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.33■■■■■ 4.21
PODNL1-211ENST00000588764 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
PODNL1-211ENST00000588764 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.93■■■■■ 4.14
PODNL1-211ENST00000588764 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.91■■■■■ 4.14
PODNL1-211ENST00000588764 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.91■■■■■ 4.14
PODNL1-211ENST00000588764 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.8■■■■■ 4.12
PODNL1-211ENST00000588764 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.65■■■■■ 4.1
PODNL1-211ENST00000588764 SCRIBQ14160 1630 aa40.31■■■■■ 4.04
PODNL1-211ENST00000588764 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.26■■■■■ 4.04
PODNL1-211ENST00000588764 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
PODNL1-211ENST00000588764 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.66■■■■□ 3.94
PODNL1-211ENST00000588764 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.52■■■■□ 3.92
PODNL1-211ENST00000588764 NCAPD3P42695 1498 aa38.54■■■■□ 3.76
PODNL1-211ENST00000588764 SMARCA4P51532 1647 aa38.51■■■■□ 3.76
PODNL1-211ENST00000588764 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.46■■■■□ 3.75
PODNL1-211ENST00000588764 SMARCA2P51531 1590 aa38.42■■■■□ 3.74
PODNL1-211ENST00000588764 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
PODNL1-211ENST00000588764 HMGXB3Q12766 1538 aa38.3■■■■□ 3.72
PODNL1-211ENST00000588764 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
PODNL1-211ENST00000588764 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.14■■■■□ 3.7
PODNL1-211ENST00000588764 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.09■■■■□ 3.69
PODNL1-211ENST00000588764 ERCC6Q03468 1493 aa37.93■■■■□ 3.66
PODNL1-211ENST00000588764 NESP48681 1621 aa37.77■■■■□ 3.64
PODNL1-211ENST00000588764 CUX2O14529 1486 aa37.74■■■■□ 3.63
PODNL1-211ENST00000588764 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.64■■■■□ 3.62
PODNL1-211ENST00000588764 WIZO95785 1651 aa37.64■■■■□ 3.62
PODNL1-211ENST00000588764 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
PODNL1-211ENST00000588764 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.44■■■■□ 3.58
PODNL1-211ENST00000588764 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.41■■■■□ 3.58
PODNL1-211ENST00000588764 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
PODNL1-211ENST00000588764 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.31■■■■□ 3.56
PODNL1-211ENST00000588764 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.29■■■■□ 3.56
PODNL1-211ENST00000588764 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
PODNL1-211ENST00000588764 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.06■■■■□ 3.52
PODNL1-211ENST00000588764 CFTRP13569 1480 aa37.03■■■■□ 3.52
PODNL1-211ENST00000588764 CEP164Q9UPV0 1460 aa37■■■■□ 3.51
PODNL1-211ENST00000588764 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.96■■■■□ 3.51
PODNL1-211ENST00000588764 WDR62O43379 1518 aa36.94■■■■□ 3.5
PODNL1-211ENST00000588764 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.79■■■■□ 3.48
PODNL1-211ENST00000588764 PRDM2Q13029 1718 aa36.69■■■■□ 3.46
PODNL1-211ENST00000588764 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
PODNL1-211ENST00000588764 ABCC8Q09428 1581 aa36.32■■■■□ 3.4
PODNL1-211ENST00000588764 TOPBP1Q92547 1522 aa36.29■■■■□ 3.4
PODNL1-211ENST00000588764 IFT140Q96RY7 1462 aa36.24■■■■□ 3.39
PODNL1-211ENST00000588764 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.21■■■■□ 3.39
PODNL1-211ENST00000588764 OSCARQ8IYS5 282 aa36.09■■■■□ 3.37
PODNL1-211ENST00000588764 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
PODNL1-211ENST00000588764 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
PODNL1-211ENST00000588764 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
PODNL1-211ENST00000588764 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
PODNL1-211ENST00000588764 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
PODNL1-211ENST00000588764 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.82■■■■□ 3.32
PODNL1-211ENST00000588764 SOGA1O94964 1423 aa35.82■■■■□ 3.32
PODNL1-211ENST00000588764 TRIM41Q8WV44 630 aa35.81■■■■□ 3.32
PODNL1-211ENST00000588764 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.78■■■■□ 3.32
PODNL1-211ENST00000588764 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.77■■■■□ 3.32
PODNL1-211ENST00000588764 CUX1P39880 1505 aa35.77■■■■□ 3.32
PODNL1-211ENST00000588764 WDR97A6NE52 1622 aa35.67■■■■□ 3.3
PODNL1-211ENST00000588764 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
PODNL1-211ENST00000588764 CHD1O14646 1710 aa35.58■■■■□ 3.29
PODNL1-211ENST00000588764 FBLN2P98095 1184 aa35.58■■■■□ 3.29
PODNL1-211ENST00000588764 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.52■■■■□ 3.28
PODNL1-211ENST00000588764 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.52■■■■□ 3.28
PODNL1-211ENST00000588764 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.52■■■■□ 3.28
PODNL1-211ENST00000588764 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.48■■■■□ 3.27
PODNL1-211ENST00000588764 GRIN2BQ13224 1484 aa35.48■■■■□ 3.27
PODNL1-211ENST00000588764 ARHGEF11O15085 1522 aa35.46■■■■□ 3.27
PODNL1-211ENST00000588764 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
PODNL1-211ENST00000588764 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.4■■■■□ 3.26
PODNL1-211ENST00000588764 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
PODNL1-211ENST00000588764 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.38■■■■□ 3.25
PODNL1-211ENST00000588764 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.36■■■■□ 3.25
PODNL1-211ENST00000588764 PBRM1Q86U86 1689 aa35.32■■■■□ 3.24
PODNL1-211ENST00000588764 TOP2BQ02880 1626 aa35.32■■■■□ 3.24
PODNL1-211ENST00000588764 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.32■■■■□ 3.24
PODNL1-211ENST00000588764 SYNJ2O15056 1496 aa35.31■■■■□ 3.24
PODNL1-211ENST00000588764 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.28■■■■□ 3.24
PODNL1-211ENST00000588764 SYNJ1O43426 1573 aa35.27■■■■□ 3.24
PODNL1-211ENST00000588764 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.19■■■■□ 3.22
PODNL1-211ENST00000588764 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.19■■■■□ 3.22
PODNL1-211ENST00000588764 ARAP1Q96P48 1450 aa35.11■■■■□ 3.21
PODNL1-211ENST00000588764 ADAMTS12P58397 1594 aa35■■■■□ 3.19
PODNL1-211ENST00000588764 GRIN2AQ12879 1464 aa35■■■■□ 3.19
PODNL1-211ENST00000588764 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.98■■■■□ 3.19
PODNL1-211ENST00000588764 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.97■■■■□ 3.19
PODNL1-211ENST00000588764 NUP160Q12769 1436 aa34.86■■■■□ 3.17
PODNL1-211ENST00000588764 CEP170Q5SW79 1584 aa34.82■■■■□ 3.16
PODNL1-211ENST00000588764 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
PODNL1-211ENST00000588764 KIF27Q86VH2 1401 aa34.69■■■■□ 3.14
PODNL1-211ENST00000588764 SHROOM2Q13796 1616 aa34.65■■■■□ 3.14
PODNL1-211ENST00000588764 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.62■■■■□ 3.13
PODNL1-211ENST00000588764 IGF1RP08069 1367 aa34.58■■■■□ 3.13
PODNL1-211ENST00000588764 CUL7Q14999 1698 aa34.54■■■■□ 3.12
PODNL1-211ENST00000588764 JPH4Q96JJ6 628 aa34.53■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms