RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588700.5

ANKRD27-206, Transcript of ankyrin repeat domain 27, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD27, Length 773 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27-206ENST00000588700 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.25■■■■■ 4.35
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ANKRD27-206ENST00000588700 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.83■■■■□ 3.33
ANKRD27-206ENST00000588700 NACADO15069 1562 aa35.66■■■■□ 3.3
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ANKRD27-206ENST00000588700 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.27■■■■□ 3.24
ANKRD27-206ENST00000588700 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.16■■■■□ 3.22
ANKRD27-206ENST00000588700 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
ANKRD27-206ENST00000588700 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.93■■■■□ 3.18
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ANKRD27-206ENST00000588700 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.89■■■■□ 3.18
ANKRD27-206ENST00000588700 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.85■■■■□ 3.17
ANKRD27-206ENST00000588700 SCRIBQ14160 1630 aa34.48■■■■□ 3.11
ANKRD27-206ENST00000588700 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.36■■■■□ 3.09
ANKRD27-206ENST00000588700 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
ANKRD27-206ENST00000588700 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.93■■■■□ 3.02
ANKRD27-206ENST00000588700 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.74■■■□□ 2.99
ANKRD27-206ENST00000588700 SMARCA4P51532 1647 aa32.94■■■□□ 2.86
ANKRD27-206ENST00000588700 NCAPD3P42695 1498 aa32.89■■■□□ 2.86
ANKRD27-206ENST00000588700 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.85■■■□□ 2.85
ANKRD27-206ENST00000588700 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
ANKRD27-206ENST00000588700 SMARCA2P51531 1590 aa32.76■■■□□ 2.84
ANKRD27-206ENST00000588700 HMGXB3Q12766 1538 aa32.72■■■□□ 2.83
ANKRD27-206ENST00000588700 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.62■■■□□ 2.81
ANKRD27-206ENST00000588700 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.57■■■□□ 2.8
ANKRD27-206ENST00000588700 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
ANKRD27-206ENST00000588700 NESP48681 1621 aa32.33■■■□□ 2.77
ANKRD27-206ENST00000588700 ERCC6Q03468 1493 aa32.31■■■□□ 2.76
ANKRD27-206ENST00000588700 WIZO95785 1651 aa32.21■■■□□ 2.75
ANKRD27-206ENST00000588700 CUX2O14529 1486 aa32.21■■■□□ 2.75
ANKRD27-206ENST00000588700 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.13■■■□□ 2.73
ANKRD27-206ENST00000588700 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
ANKRD27-206ENST00000588700 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.98■■■□□ 2.71
ANKRD27-206ENST00000588700 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
ANKRD27-206ENST00000588700 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.88■■■□□ 2.69
ANKRD27-206ENST00000588700 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.86■■■□□ 2.69
ANKRD27-206ENST00000588700 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
ANKRD27-206ENST00000588700 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.8■■■□□ 2.68
ANKRD27-206ENST00000588700 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.64■■■□□ 2.66
ANKRD27-206ENST00000588700 CFTRP13569 1480 aa31.62■■■□□ 2.65
ANKRD27-206ENST00000588700 WDR62O43379 1518 aa31.59■■■□□ 2.65
ANKRD27-206ENST00000588700 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.55■■■□□ 2.64
ANKRD27-206ENST00000588700 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.54■■■□□ 2.64
ANKRD27-206ENST00000588700 PRDM2Q13029 1718 aa31.44■■■□□ 2.62
ANKRD27-206ENST00000588700 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.4■■■□□ 2.62
ANKRD27-206ENST00000588700 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
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ANKRD27-206ENST00000588700 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.93■■■□□ 2.54
ANKRD27-206ENST00000588700 IFT140Q96RY7 1462 aa30.9■■■□□ 2.54
ANKRD27-206ENST00000588700 ABCC8Q09428 1581 aa30.89■■■□□ 2.54
ANKRD27-206ENST00000588700 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
ANKRD27-206ENST00000588700 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
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ANKRD27-206ENST00000588700 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
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ANKRD27-206ENST00000588700 CUX1P39880 1505 aa30.59■■■□□ 2.49
ANKRD27-206ENST00000588700 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.57■■■□□ 2.48
ANKRD27-206ENST00000588700 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.57■■■□□ 2.48
ANKRD27-206ENST00000588700 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.55■■■□□ 2.48
ANKRD27-206ENST00000588700 CHD1O14646 1710 aa30.5■■■□□ 2.47
ANKRD27-206ENST00000588700 SOGA1O94964 1423 aa30.49■■■□□ 2.47
ANKRD27-206ENST00000588700 TRIM41Q8WV44 630 aa30.48■■■□□ 2.47
ANKRD27-206ENST00000588700 WDR97A6NE52 1622 aa30.44■■■□□ 2.46
ANKRD27-206ENST00000588700 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
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ANKRD27-206ENST00000588700 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.4■■■□□ 2.46
ANKRD27-206ENST00000588700 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.4■■■□□ 2.46
ANKRD27-206ENST00000588700 ARHGEF11O15085 1522 aa30.31■■■□□ 2.44
ANKRD27-206ENST00000588700 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.31■■■□□ 2.44
ANKRD27-206ENST00000588700 PBRM1Q86U86 1689 aa30.24■■■□□ 2.43
ANKRD27-206ENST00000588700 GRIN2BQ13224 1484 aa30.23■■■□□ 2.43
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ANKRD27-206ENST00000588700 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.22■■■□□ 2.43
ANKRD27-206ENST00000588700 FBLN2P98095 1184 aa30.21■■■□□ 2.43
ANKRD27-206ENST00000588700 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.21■■■□□ 2.43
ANKRD27-206ENST00000588700 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.21■■■□□ 2.43
ANKRD27-206ENST00000588700 TOP2BQ02880 1626 aa30.18■■■□□ 2.42
ANKRD27-206ENST00000588700 SYNJ1O43426 1573 aa30.17■■■□□ 2.42
ANKRD27-206ENST00000588700 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.17■■■□□ 2.42
ANKRD27-206ENST00000588700 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.13■■■□□ 2.41
ANKRD27-206ENST00000588700 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.12■■■□□ 2.41
ANKRD27-206ENST00000588700 SYNJ2O15056 1496 aa30.12■■■□□ 2.41
ANKRD27-206ENST00000588700 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
ANKRD27-206ENST00000588700 ARAP1Q96P48 1450 aa30.04■■■□□ 2.4
ANKRD27-206ENST00000588700 ADAMTS12P58397 1594 aa29.95■■■□□ 2.39
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ANKRD27-206ENST00000588700 GRIN2AQ12879 1464 aa29.87■■■□□ 2.37
ANKRD27-206ENST00000588700 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD27-206ENST00000588700 CEP170Q5SW79 1584 aa29.8■■■□□ 2.36
ANKRD27-206ENST00000588700 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.79■■■□□ 2.36
ANKRD27-206ENST00000588700 NUP160Q12769 1436 aa29.78■■■□□ 2.36
ANKRD27-206ENST00000588700 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.68■■■□□ 2.34
ANKRD27-206ENST00000588700 SHROOM2Q13796 1616 aa29.67■■■□□ 2.34
ANKRD27-206ENST00000588700 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.53■■■□□ 2.32
ANKRD27-206ENST00000588700 KIF27Q86VH2 1401 aa29.51■■■□□ 2.31
ANKRD27-206ENST00000588700 CUL7Q14999 1698 aa29.49■■■□□ 2.31
ANKRD27-206ENST00000588700 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
ANKRD27-206ENST00000588700 IGF1RP08069 1367 aa29.48■■■□□ 2.31
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