RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588398.1

ANKS3-210, Transcript of ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene ANKS3, Length 853 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKS3-210ENST00000588398 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.98■■■■■ 4.95
ANKS3-210ENST00000588398 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.07■■■■■ 4.16
ANKS3-210ENST00000588398 ABCC9O60706 1549 aa40.91■■■■■ 4.14
ANKS3-210ENST00000588398 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.89■■■■□ 3.82
ANKS3-210ENST00000588398 NACADO15069 1562 aa38.74■■■■□ 3.79
ANKS3-210ENST00000588398 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.71■■■■□ 3.79
ANKS3-210ENST00000588398 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.62■■■■□ 3.77
ANKS3-210ENST00000588398 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.4■■■■□ 3.74
ANKS3-210ENST00000588398 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
ANKS3-210ENST00000588398 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.11■■■■□ 3.69
ANKS3-210ENST00000588398 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.07■■■■□ 3.68
ANKS3-210ENST00000588398 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.93■■■■□ 3.66
ANKS3-210ENST00000588398 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.72■■■■□ 3.63
ANKS3-210ENST00000588398 SCRIBQ14160 1630 aa37.39■■■■□ 3.58
ANKS3-210ENST00000588398 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.35■■■■□ 3.57
ANKS3-210ENST00000588398 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.9■■■■□ 3.5
ANKS3-210ENST00000588398 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.82■■■■□ 3.48
ANKS3-210ENST00000588398 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
ANKS3-210ENST00000588398 SMARCA4P51532 1647 aa35.75■■■■□ 3.31
ANKS3-210ENST00000588398 NCAPD3P42695 1498 aa35.74■■■■□ 3.31
ANKS3-210ENST00000588398 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
ANKS3-210ENST00000588398 SMARCA2P51531 1590 aa35.67■■■■□ 3.3
ANKS3-210ENST00000588398 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.67■■■■□ 3.3
ANKS3-210ENST00000588398 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.55■■■■□ 3.28
ANKS3-210ENST00000588398 HMGXB3Q12766 1538 aa35.52■■■■□ 3.28
ANKS3-210ENST00000588398 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.42■■■■□ 3.26
ANKS3-210ENST00000588398 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
ANKS3-210ENST00000588398 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.38■■■■□ 3.25
ANKS3-210ENST00000588398 ERCC6Q03468 1493 aa35.22■■■■□ 3.23
ANKS3-210ENST00000588398 CUX2O14529 1486 aa35.21■■■■□ 3.23
ANKS3-210ENST00000588398 NESP48681 1621 aa35.13■■■■□ 3.21
ANKS3-210ENST00000588398 WIZO95785 1651 aa34.96■■■■□ 3.19
ANKS3-210ENST00000588398 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.87■■■■□ 3.17
ANKS3-210ENST00000588398 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
ANKS3-210ENST00000588398 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
ANKS3-210ENST00000588398 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.7■■■■□ 3.15
ANKS3-210ENST00000588398 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.69■■■■□ 3.14
ANKS3-210ENST00000588398 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
ANKS3-210ENST00000588398 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.59■■■■□ 3.13
ANKS3-210ENST00000588398 CFTRP13569 1480 aa34.38■■■■□ 3.09
ANKS3-210ENST00000588398 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.32■■■■□ 3.08
ANKS3-210ENST00000588398 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.29■■■■□ 3.08
ANKS3-210ENST00000588398 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.27■■■■□ 3.08
ANKS3-210ENST00000588398 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.2■■■■□ 3.07
ANKS3-210ENST00000588398 WDR62O43379 1518 aa34.19■■■■□ 3.06
ANKS3-210ENST00000588398 PRDM2Q13029 1718 aa34.03■■■■□ 3.04
ANKS3-210ENST00000588398 TRIM41Q8WV44 630 aa33.94■■■■□ 3.02
ANKS3-210ENST00000588398 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
ANKS3-210ENST00000588398 ABCC8Q09428 1581 aa33.73■■■□□ 2.99
ANKS3-210ENST00000588398 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
ANKS3-210ENST00000588398 TOPBP1Q92547 1522 aa33.66■■■□□ 2.98
ANKS3-210ENST00000588398 OSCARQ8IYS5 282 aa33.62■■■□□ 2.97
ANKS3-210ENST00000588398 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.6■■■□□ 2.97
ANKS3-210ENST00000588398 IFT140Q96RY7 1462 aa33.6■■■□□ 2.97
ANKS3-210ENST00000588398 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
ANKS3-210ENST00000588398 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
ANKS3-210ENST00000588398 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
ANKS3-210ENST00000588398 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.92
ANKS3-210ENST00000588398 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.24■■■□□ 2.91
ANKS3-210ENST00000588398 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.24■■■□□ 2.91
ANKS3-210ENST00000588398 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.24■■■□□ 2.91
ANKS3-210ENST00000588398 SOGA1O94964 1423 aa33.24■■■□□ 2.91
ANKS3-210ENST00000588398 CUX1P39880 1505 aa33.23■■■□□ 2.91
ANKS3-210ENST00000588398 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.21■■■□□ 2.91
ANKS3-210ENST00000588398 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.18■■■□□ 2.93e-7■■■■■ 72.8
ANKS3-210ENST00000588398 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.18■■■□□ 2.9
ANKS3-210ENST00000588398 WDR97A6NE52 1622 aa33.11■■■□□ 2.89
ANKS3-210ENST00000588398 ARHGEF11O15085 1522 aa33.11■■■□□ 2.89
ANKS3-210ENST00000588398 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
ANKS3-210ENST00000588398 CHD1O14646 1710 aa32.99■■■□□ 2.87
ANKS3-210ENST00000588398 FBLN2P98095 1184 aa32.94■■■□□ 2.86
ANKS3-210ENST00000588398 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.94■■■□□ 2.86
ANKS3-210ENST00000588398 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.92■■■□□ 2.86
ANKS3-210ENST00000588398 GRIN2BQ13224 1484 aa32.92■■■□□ 2.86
ANKS3-210ENST00000588398 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.89■■■□□ 2.86
ANKS3-210ENST00000588398 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.88■■■□□ 2.85
ANKS3-210ENST00000588398 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
ANKS3-210ENST00000588398 TOP2BQ02880 1626 aa32.87■■■□□ 2.85
ANKS3-210ENST00000588398 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.85■■■□□ 2.85
ANKS3-210ENST00000588398 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.84■■■□□ 2.85
ANKS3-210ENST00000588398 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
ANKS3-210ENST00000588398 ARAP1Q96P48 1450 aa32.8■■■□□ 2.84
ANKS3-210ENST00000588398 SYNJ1O43426 1573 aa32.79■■■□□ 2.84
ANKS3-210ENST00000588398 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.75■■■□□ 2.83
ANKS3-210ENST00000588398 SYNJ2O15056 1496 aa32.74■■■□□ 2.83
ANKS3-210ENST00000588398 PBRM1Q86U86 1689 aa32.73■■■□□ 2.83
ANKS3-210ENST00000588398 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.61■■■□□ 2.81
ANKS3-210ENST00000588398 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
ANKS3-210ENST00000588398 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.51■■■□□ 2.8
ANKS3-210ENST00000588398 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.48■■■□□ 2.79
ANKS3-210ENST00000588398 ADAMTS12P58397 1594 aa32.48■■■□□ 2.79
ANKS3-210ENST00000588398 GRIN2AQ12879 1464 aa32.47■■■□□ 2.79
ANKS3-210ENST00000588398 NUP160Q12769 1436 aa32.33■■■□□ 2.77
ANKS3-210ENST00000588398 KIF27Q86VH2 1401 aa32.32■■■□□ 2.76
ANKS3-210ENST00000588398 CEP170Q5SW79 1584 aa32.27■■■□□ 2.76
ANKS3-210ENST00000588398 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.2■■■□□ 2.75
ANKS3-210ENST00000588398 IGF1RP08069 1367 aa32.17■■■□□ 2.74
ANKS3-210ENST00000588398 CUL7Q14999 1698 aa32.13■■■□□ 2.73
ANKS3-210ENST00000588398 SHROOM2Q13796 1616 aa32.1■■■□□ 2.73
ANKS3-210ENST00000588398 JPH4Q96JJ6 628 aa32.03■■■□□ 2.72
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