RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 NISCHQ9Y2I1 1504 aa16.35■□□□□ 0.21
EFTUD2-211ENST00000588374 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-211ENST00000588374 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.85□□□□□ -0.03
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.5□□□□□ -0.09
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCC9O60706 1549 aa14.25□□□□□ -0.13
EFTUD2-211ENST00000588374 DCAF8L2P0C7V8 631 aa13.83□□□□□ -0.2
EFTUD2-211ENST00000588374 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa13.66□□□□□ -0.22
EFTUD2-211ENST00000588374 NACADO15069 1562 aa13.64□□□□□ -0.23
EFTUD2-211ENST00000588374 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
EFTUD2-211ENST00000588374 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
EFTUD2-211ENST00000588374 MYO15BQ96JP2 1530 aa13.5□□□□□ -0.25
EFTUD2-211ENST00000588374 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa13.47□□□□□ -0.25
EFTUD2-211ENST00000588374 UNC13AQ9UPW8 1703 aa13.42□□□□□ -0.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP13.37□□□□□ -0.27
EFTUD2-211ENST00000588374 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-211ENST00000588374 SCRIBQ14160 1630 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-211ENST00000588374 BICRAQ9NZM4 1560 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJC5BQ9UF47 199 aa13.11□□□□□ -0.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa13.04□□□□□ -0.32
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa12.87□□□□□ -0.35
EFTUD2-211ENST00000588374 CECR2Q9BXF3 1484 aa12.78□□□□□ -0.36
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXD1Q16676 465 aa12.71□□□□□ -0.37
EFTUD2-211ENST00000588374 SMARCA4P51532 1647 aa12.68□□□□□ -0.38
EFTUD2-211ENST00000588374 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
EFTUD2-211ENST00000588374 MROH2BQ7Z745 1585 aa12.63□□□□□ -0.39
EFTUD2-211ENST00000588374 POTEDQ86YR6 584 aa12.62□□□□□ -0.39
EFTUD2-211ENST00000588374 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa12.61□□□□□ -0.39
EFTUD2-211ENST00000588374 NCAPD3P42695 1498 aa12.59□□□□□ -0.39
EFTUD2-211ENST00000588374 SMARCA2P51531 1590 aa12.58□□□□□ -0.4
EFTUD2-211ENST00000588374 WIZO95785 1651 aa12.52□□□□□ -0.4
EFTUD2-211ENST00000588374 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
EFTUD2-211ENST00000588374 PEG3Q9GZU2 1588 aa12.52□□□□□ -0.41
EFTUD2-211ENST00000588374 HMGXB3Q12766 1538 aa12.49□□□□□ -0.41
EFTUD2-211ENST00000588374 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
EFTUD2-211ENST00000588374 NESP48681 1621 aa12.33□□□□□ -0.43
EFTUD2-211ENST00000588374 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
EFTUD2-211ENST00000588374 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
EFTUD2-211ENST00000588374 ERCC6Q03468 1493 aa12.27□□□□□ -0.45
EFTUD2-211ENST00000588374 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.26□□□□□ -0.45
EFTUD2-211ENST00000588374 CADPSQ9ULU8 1353 aa12.24□□□□□ -0.45
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC88BA6NC98 1476 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-211ENST00000588374 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.19□□□□□ -0.46
EFTUD2-211ENST00000588374 CFTRP13569 1480 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-211ENST00000588374 MSH5O43196 834 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-211ENST00000588374 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.1□□□□□ -0.47
EFTUD2-211ENST00000588374 PRDM2Q13029 1718 aa12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-211ENST00000588374 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.08□□□□□ -0.48
EFTUD2-211ENST00000588374 CUX2O14529 1486 aa12.07□□□□□ -0.48
EFTUD2-211ENST00000588374 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.05□□□□□ -0.48
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR62O43379 1518 aa11.98□□□□□ -0.49
EFTUD2-211ENST00000588374 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
EFTUD2-211ENST00000588374 TOPBP1Q92547 1522 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCC8Q09428 1581 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-211ENST00000588374 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-211ENST00000588374 CUX1P39880 1505 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-211ENST00000588374 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
EFTUD2-211ENST00000588374 IFT140Q96RY7 1462 aa11.81□□□□□ -0.52
EFTUD2-211ENST00000588374 SOGA1O94964 1423 aa11.8□□□□□ -0.52
EFTUD2-211ENST00000588374 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
EFTUD2-211ENST00000588374 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.8□□□□□ -0.52
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
EFTUD2-211ENST00000588374 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-211ENST00000588374 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-211ENST00000588374 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-211ENST00000588374 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.76□□□□□ -0.533e-7■□□□□ 11.3
EFTUD2-211ENST00000588374 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-211ENST00000588374 SYNJ1O43426 1573 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-211ENST00000588374 TOP2BQ02880 1626 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-211ENST00000588374 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-211ENST00000588374 FBLN2P98095 1184 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-211ENST00000588374 OSCARQ8IYS5 282 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR97A6NE52 1622 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.65□□□□□ -0.55
EFTUD2-211ENST00000588374 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.64□□□□□ -0.55
EFTUD2-211ENST00000588374 PBRM1Q86U86 1689 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-211ENST00000588374 CHD1O14646 1710 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-211ENST00000588374 GRIN2BQ13224 1484 aa11.62□□□□□ -0.55
EFTUD2-211ENST00000588374 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
EFTUD2-211ENST00000588374 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.6□□□□□ -0.55
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM41Q8WV44 630 aa11.59□□□□□ -0.55
EFTUD2-211ENST00000588374 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-211ENST00000588374 SYNJ2O15056 1496 aa11.53□□□□□ -0.56
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF27Q86VH2 1401 aa11.52□□□□□ -0.57
EFTUD2-211ENST00000588374 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.51□□□□□ -0.57
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.5□□□□□ -0.57
EFTUD2-211ENST00000588374 IGF1RP08069 1367 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-211ENST00000588374 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.49□□□□□ -0.57
EFTUD2-211ENST00000588374 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTS12P58397 1594 aa11.48□□□□□ -0.57
EFTUD2-211ENST00000588374 PLPPR3Q6T4P5 718 aa11.47□□□□□ -0.57
EFTUD2-211ENST00000588374 GRIN2AQ12879 1464 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-211ENST00000588374 ADRA2BP18089 450 aa11.46□□□□□ -0.57
EFTUD2-211ENST00000588374 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa11.45□□□□□ -0.58
EFTUD2-211ENST00000588374 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms