RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588335.1

GRIN3B-202, Transcript of glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 3B, humanhuman

TSL 3

Gene GRIN3B, Length 528 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3B-202ENST00000588335 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.46■■■□□ 2.79
GRIN3B-202ENST00000588335 ABCC9O60706 1549 aa29.13■■■□□ 2.25
GRIN3B-202ENST00000588335 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.83■■■□□ 2.21
GRIN3B-202ENST00000588335 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.77■■■□□ 2.04
GRIN3B-202ENST00000588335 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.6■■■□□ 2.01
GRIN3B-202ENST00000588335 NACADO15069 1562 aa27.33■■□□□ 1.97
GRIN3B-202ENST00000588335 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.08■■□□□ 1.93
GRIN3B-202ENST00000588335 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
GRIN3B-202ENST00000588335 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.06■■□□□ 1.92
GRIN3B-202ENST00000588335 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.97■■□□□ 1.91
GRIN3B-202ENST00000588335 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.9■■□□□ 1.9
GRIN3B-202ENST00000588335 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.88■■□□□ 1.89
GRIN3B-202ENST00000588335 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.78■■□□□ 1.88
GRIN3B-202ENST00000588335 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.49■■□□□ 1.83
GRIN3B-202ENST00000588335 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.33■■□□□ 1.81
GRIN3B-202ENST00000588335 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.31■■□□□ 1.8
GRIN3B-202ENST00000588335 SCRIBQ14160 1630 aa26.26■■□□□ 1.79
GRIN3B-202ENST00000588335 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
GRIN3B-202ENST00000588335 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.91■■□□□ 1.74
GRIN3B-202ENST00000588335 CUX2O14529 1486 aa25.38■■□□□ 1.65
GRIN3B-202ENST00000588335 NCAPD3P42695 1498 aa25.27■■□□□ 1.64
GRIN3B-202ENST00000588335 ERCC6Q03468 1493 aa25.21■■□□□ 1.63
GRIN3B-202ENST00000588335 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
GRIN3B-202ENST00000588335 SMARCA4P51532 1647 aa25.15■■□□□ 1.62
GRIN3B-202ENST00000588335 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.08■■□□□ 1.6
GRIN3B-202ENST00000588335 SMARCA2P51531 1590 aa25.01■■□□□ 1.59
GRIN3B-202ENST00000588335 HMGXB3Q12766 1538 aa24.99■■□□□ 1.59
GRIN3B-202ENST00000588335 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.97■■□□□ 1.59
GRIN3B-202ENST00000588335 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.93■■□□□ 1.58
GRIN3B-202ENST00000588335 NESP48681 1621 aa24.89■■□□□ 1.57
GRIN3B-202ENST00000588335 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
GRIN3B-202ENST00000588335 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
GRIN3B-202ENST00000588335 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
GRIN3B-202ENST00000588335 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.72■■□□□ 1.55
GRIN3B-202ENST00000588335 WIZO95785 1651 aa24.72■■□□□ 1.55
GRIN3B-202ENST00000588335 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.63■■□□□ 1.53
GRIN3B-202ENST00000588335 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.53■■□□□ 1.52
GRIN3B-202ENST00000588335 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
GRIN3B-202ENST00000588335 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.46■■□□□ 1.51
GRIN3B-202ENST00000588335 TRIM41Q8WV44 630 aa24.46■■□□□ 1.51
GRIN3B-202ENST00000588335 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.38■■□□□ 1.49
GRIN3B-202ENST00000588335 WDR62O43379 1518 aa24.34■■□□□ 1.49
GRIN3B-202ENST00000588335 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
GRIN3B-202ENST00000588335 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.19■■□□□ 1.46
GRIN3B-202ENST00000588335 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.19■■□□□ 1.46
GRIN3B-202ENST00000588335 OSCARQ8IYS5 282 aa24.18■■□□□ 1.46
GRIN3B-202ENST00000588335 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.13■■□□□ 1.45
GRIN3B-202ENST00000588335 CFTRP13569 1480 aa24.13■■□□□ 1.45
GRIN3B-202ENST00000588335 PRDM2Q13029 1718 aa23.98■■□□□ 1.43
GRIN3B-202ENST00000588335 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
GRIN3B-202ENST00000588335 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.81■■□□□ 1.4
GRIN3B-202ENST00000588335 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.81■■□□□ 1.4
GRIN3B-202ENST00000588335 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.81■■□□□ 1.4
GRIN3B-202ENST00000588335 IFT140Q96RY7 1462 aa23.76■■□□□ 1.39
GRIN3B-202ENST00000588335 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
GRIN3B-202ENST00000588335 ARHGEF11O15085 1522 aa23.7■■□□□ 1.38
GRIN3B-202ENST00000588335 ABCC8Q09428 1581 aa23.67■■□□□ 1.38
GRIN3B-202ENST00000588335 TOPBP1Q92547 1522 aa23.62■■□□□ 1.37
GRIN3B-202ENST00000588335 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.59■■□□□ 1.37
GRIN3B-202ENST00000588335 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.58■■□□□ 1.37
GRIN3B-202ENST00000588335 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
GRIN3B-202ENST00000588335 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
GRIN3B-202ENST00000588335 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
GRIN3B-202ENST00000588335 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
GRIN3B-202ENST00000588335 CUX1P39880 1505 aa23.43■■□□□ 1.34
GRIN3B-202ENST00000588335 ARAP1Q96P48 1450 aa23.43■■□□□ 1.34
GRIN3B-202ENST00000588335 CHD1O14646 1710 aa23.42■■□□□ 1.34
GRIN3B-202ENST00000588335 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
GRIN3B-202ENST00000588335 FBLN2P98095 1184 aa23.38■■□□□ 1.33
GRIN3B-202ENST00000588335 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
GRIN3B-202ENST00000588335 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.35■■□□□ 1.33
GRIN3B-202ENST00000588335 SOGA1O94964 1423 aa23.32■■□□□ 1.32
GRIN3B-202ENST00000588335 TOP2BQ02880 1626 aa23.3■■□□□ 1.32
GRIN3B-202ENST00000588335 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.3■■□□□ 1.32
GRIN3B-202ENST00000588335 SYNJ1O43426 1573 aa23.26■■□□□ 1.31
GRIN3B-202ENST00000588335 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.25■■□□□ 1.31
GRIN3B-202ENST00000588335 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
GRIN3B-202ENST00000588335 WDR97A6NE52 1622 aa23.24■■□□□ 1.31
GRIN3B-202ENST00000588335 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.21■■□□□ 1.31
GRIN3B-202ENST00000588335 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
GRIN3B-202ENST00000588335 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.18■■□□□ 1.3
GRIN3B-202ENST00000588335 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
GRIN3B-202ENST00000588335 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.15■■□□□ 1.3
GRIN3B-202ENST00000588335 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
GRIN3B-202ENST00000588335 GRIN2BQ13224 1484 aa23.11■■□□□ 1.29
GRIN3B-202ENST00000588335 SYNJ2O15056 1496 aa23.09■■□□□ 1.29
GRIN3B-202ENST00000588335 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.06■■□□□ 1.28
GRIN3B-202ENST00000588335 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.02■■□□□ 1.28
GRIN3B-202ENST00000588335 PBRM1Q86U86 1689 aa22.97■■□□□ 1.27
GRIN3B-202ENST00000588335 KIF27Q86VH2 1401 aa22.91■■□□□ 1.26
GRIN3B-202ENST00000588335 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.91■■□□□ 1.26
GRIN3B-202ENST00000588335 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.81■■□□□ 1.24
GRIN3B-202ENST00000588335 ADAMTS12P58397 1594 aa22.8■■□□□ 1.24
GRIN3B-202ENST00000588335 GRIN2AQ12879 1464 aa22.79■■□□□ 1.24
GRIN3B-202ENST00000588335 NUP160Q12769 1436 aa22.76■■□□□ 1.23
GRIN3B-202ENST00000588335 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.76■■□□□ 1.23
GRIN3B-202ENST00000588335 IGF1RP08069 1367 aa22.76■■□□□ 1.23
GRIN3B-202ENST00000588335 CEP170Q5SW79 1584 aa22.73■■□□□ 1.23
GRIN3B-202ENST00000588335 CUL7Q14999 1698 aa22.73■■□□□ 1.23
GRIN3B-202ENST00000588335 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms