RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588083.5

MAP4K1-205, Transcript of mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 1, humanhuman

TSL 2

Gene MAP4K1, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K1-205ENST00000588083 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.35■■■■■ 5.97
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MAP4K1-205ENST00000588083 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.54■■■■■ 4.72
MAP4K1-205ENST00000588083 NACADO15069 1562 aa44.31■■■■■ 4.68
MAP4K1-205ENST00000588083 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.87■■■■■ 4.61
MAP4K1-205ENST00000588083 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.84■■■■■ 4.61
MAP4K1-205ENST00000588083 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.56■■■■■ 4.56
MAP4K1-205ENST00000588083 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
MAP4K1-205ENST00000588083 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.4■■■■■ 4.54
MAP4K1-205ENST00000588083 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.35■■■■■ 4.53
MAP4K1-205ENST00000588083 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.31■■■■■ 4.52
MAP4K1-205ENST00000588083 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.21■■■■■ 4.51
MAP4K1-205ENST00000588083 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.77■■■■■ 4.44
MAP4K1-205ENST00000588083 SCRIBQ14160 1630 aa42.68■■■■■ 4.42
MAP4K1-205ENST00000588083 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.14■■■■■ 4.34
MAP4K1-205ENST00000588083 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
MAP4K1-205ENST00000588083 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.95■■■■■ 4.31
MAP4K1-205ENST00000588083 NCAPD3P42695 1498 aa40.88■■■■■ 4.13
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MAP4K1-205ENST00000588083 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.75■■■■■ 4.11
MAP4K1-205ENST00000588083 SMARCA2P51531 1590 aa40.7■■■■■ 4.11
MAP4K1-205ENST00000588083 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
MAP4K1-205ENST00000588083 HMGXB3Q12766 1538 aa40.63■■■■■ 4.1
MAP4K1-205ENST00000588083 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.47■■■■■ 4.07
MAP4K1-205ENST00000588083 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
MAP4K1-205ENST00000588083 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.29■■■■■ 4.04
MAP4K1-205ENST00000588083 ERCC6Q03468 1493 aa40.2■■■■■ 4.03
MAP4K1-205ENST00000588083 CUX2O14529 1486 aa40.14■■■■■ 4.02
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MAP4K1-205ENST00000588083 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.76■■■■□ 3.96
MAP4K1-205ENST00000588083 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
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MAP4K1-205ENST00000588083 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.64■■■■□ 3.94
MAP4K1-205ENST00000588083 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.6■■■■□ 3.93
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MAP4K1-205ENST00000588083 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.3■■■■□ 3.88
MAP4K1-205ENST00000588083 CFTRP13569 1480 aa39.24■■■■□ 3.87
MAP4K1-205ENST00000588083 WDR62O43379 1518 aa39.23■■■■□ 3.87
MAP4K1-205ENST00000588083 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.18■■■■□ 3.86
MAP4K1-205ENST00000588083 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.15■■■■□ 3.86
MAP4K1-205ENST00000588083 PRDM2Q13029 1718 aa38.97■■■■□ 3.83
MAP4K1-205ENST00000588083 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.88■■■■□ 3.81
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MAP4K1-205ENST00000588083 ABCC8Q09428 1581 aa38.44■■■■□ 3.74
MAP4K1-205ENST00000588083 TOPBP1Q92547 1522 aa38.44■■■■□ 3.74
MAP4K1-205ENST00000588083 IFT140Q96RY7 1462 aa38.41■■■■□ 3.74
MAP4K1-205ENST00000588083 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.36■■■■□ 3.73
MAP4K1-205ENST00000588083 OSCARQ8IYS5 282 aa38.25■■■■□ 3.71
MAP4K1-205ENST00000588083 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.25■■■■□ 3.71
MAP4K1-205ENST00000588083 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.69
MAP4K1-205ENST00000588083 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
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MAP4K1-205ENST00000588083 TRIM41Q8WV44 630 aa38■■■■□ 3.67
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MAP4K1-205ENST00000588083 SOGA1O94964 1423 aa37.87■■■■□ 3.65
MAP4K1-205ENST00000588083 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.86■■■■□ 3.65
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MAP4K1-205ENST00000588083 WDR97A6NE52 1622 aa37.85■■■■□ 3.65
MAP4K1-205ENST00000588083 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.84■■■■□ 3.65
MAP4K1-205ENST00000588083 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
MAP4K1-205ENST00000588083 CHD1O14646 1710 aa37.81■■■■□ 3.64
MAP4K1-205ENST00000588083 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.79■■■■□ 3.64
MAP4K1-205ENST00000588083 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.79■■■■□ 3.64
MAP4K1-205ENST00000588083 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.79■■■■□ 3.64
MAP4K1-205ENST00000588083 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
MAP4K1-205ENST00000588083 ARHGEF11O15085 1522 aa37.68■■■■□ 3.62
MAP4K1-205ENST00000588083 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.58■■■■□ 3.61
MAP4K1-205ENST00000588083 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
MAP4K1-205ENST00000588083 FBLN2P98095 1184 aa37.56■■■■□ 3.6
MAP4K1-205ENST00000588083 GRIN2BQ13224 1484 aa37.55■■■■□ 3.6
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MAP4K1-205ENST00000588083 PBRM1Q86U86 1689 aa37.47■■■■□ 3.59
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MAP4K1-205ENST00000588083 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.42■■■■□ 3.58
MAP4K1-205ENST00000588083 SYNJ2O15056 1496 aa37.41■■■■□ 3.58
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MAP4K1-205ENST00000588083 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
MAP4K1-205ENST00000588083 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.39■■■■□ 3.58
MAP4K1-205ENST00000588083 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.39■■■■□ 3.58
MAP4K1-205ENST00000588083 TOP2BQ02880 1626 aa37.37■■■■□ 3.57
MAP4K1-205ENST00000588083 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.35■■■■□ 3.57
MAP4K1-205ENST00000588083 ARAP1Q96P48 1450 aa37.32■■■■□ 3.56
MAP4K1-205ENST00000588083 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.29■■■■□ 3.56
MAP4K1-205ENST00000588083 ADAMTS12P58397 1594 aa37.11■■■■□ 3.53
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MAP4K1-205ENST00000588083 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.03■■■■□ 3.52
MAP4K1-205ENST00000588083 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.99■■■■□ 3.51
MAP4K1-205ENST00000588083 NUP160Q12769 1436 aa36.95■■■■□ 3.51
MAP4K1-205ENST00000588083 CEP170Q5SW79 1584 aa36.92■■■■□ 3.5
MAP4K1-205ENST00000588083 SHROOM2Q13796 1616 aa36.81■■■■□ 3.48
MAP4K1-205ENST00000588083 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
MAP4K1-205ENST00000588083 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.74■■■■□ 3.47
MAP4K1-205ENST00000588083 KIF27Q86VH2 1401 aa36.6■■■■□ 3.45
MAP4K1-205ENST00000588083 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.58■■■■□ 3.45
MAP4K1-205ENST00000588083 CUL7Q14999 1698 aa36.56■■■■□ 3.44
MAP4K1-205ENST00000588083 IGF1RP08069 1367 aa36.53■■■■□ 3.44
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