RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587769.1

CTIF-204, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-204ENST00000587769 NISCHQ9Y2I1 1504 aa25.79■■□□□ 1.72
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CTIF-204ENST00000587769 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.78■■□□□ 1.08
CTIF-204ENST00000587769 NACADO15069 1562 aa21.7■■□□□ 1.06
CTIF-204ENST00000587769 DCAF8L2P0C7V8 631 aa21.69■■□□□ 1.06
CTIF-204ENST00000587769 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
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CTIF-204ENST00000587769 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.62■□□□□ 0.89
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CTIF-204ENST00000587769 SMARCA2P51531 1590 aa19.95■□□□□ 0.78
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CTIF-204ENST00000587769 TOP2BQ02880 1626 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-204ENST00000587769 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.59■□□□□ 0.57
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CTIF-204ENST00000587769 FBLN2P98095 1184 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-204ENST00000587769 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.44■□□□□ 0.54
CTIF-204ENST00000587769 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.44■□□□□ 0.54
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CTIF-204ENST00000587769 PBRM1Q86U86 1689 aa18.42■□□□□ 0.54
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CTIF-204ENST00000587769 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.36■□□□□ 0.53
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CTIF-204ENST00000587769 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.15■□□□□ 0.5
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CTIF-204ENST00000587769 EEA1Q15075 1411 aa18.12■□□□□ 0.49
CTIF-204ENST00000587769 CEP170Q5SW79 1584 aa18.12■□□□□ 0.49
CTIF-204ENST00000587769 NUP160Q12769 1436 aa18.1■□□□□ 0.49
CTIF-204ENST00000587769 CUL7Q14999 1698 aa18.09■□□□□ 0.49
CTIF-204ENST00000587769 IGF1RP08069 1367 aa18.06■□□□□ 0.48
CTIF-204ENST00000587769 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.04■□□□□ 0.48
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