RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587676.1

GGN-204, Transcript of gametogenetin, humanhuman

TSL 2

Gene GGN, Length 520 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGN-204ENST00000587676 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.64■■■■■ 6.66
GGN-204ENST00000587676 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.48■■■■■ 5.67
GGN-204ENST00000587676 ABCC9O60706 1549 aa49.73■■■■■ 5.55
GGN-204ENST00000587676 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.7■■■■■ 5.23
GGN-204ENST00000587676 NACADO15069 1562 aa47.57■■■■■ 5.21
GGN-204ENST00000587676 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.51■■■■■ 5.2
GGN-204ENST00000587676 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.19■■■■■ 5.14
GGN-204ENST00000587676 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
GGN-204ENST00000587676 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.85■■■■■ 5.09
GGN-204ENST00000587676 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.59■■■■■ 5.05
GGN-204ENST00000587676 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.45■■■■■ 5.03
GGN-204ENST00000587676 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.26■■■■■ 5
GGN-204ENST00000587676 SCRIBQ14160 1630 aa46.02■■■■■ 4.96
GGN-204ENST00000587676 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.01■■■■■ 4.96
GGN-204ENST00000587676 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.75■■■■■ 4.91
GGN-204ENST00000587676 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
GGN-204ENST00000587676 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.97■■■■■ 4.79
GGN-204ENST00000587676 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.73■■■■■ 4.75
GGN-204ENST00000587676 SMARCA4P51532 1647 aa44■■■■■ 4.63
GGN-204ENST00000587676 NCAPD3P42695 1498 aa43.92■■■■■ 4.62
GGN-204ENST00000587676 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
GGN-204ENST00000587676 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.87■■■■■ 4.61
GGN-204ENST00000587676 SMARCA2P51531 1590 aa43.8■■■■■ 4.6
GGN-204ENST00000587676 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.64■■■■■ 4.58
GGN-204ENST00000587676 HMGXB3Q12766 1538 aa43.63■■■■■ 4.58
GGN-204ENST00000587676 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.59■■■■■ 4.57
GGN-204ENST00000587676 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
GGN-204ENST00000587676 WIZO95785 1651 aa43.14■■■■■ 4.5
GGN-204ENST00000587676 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
GGN-204ENST00000587676 NESP48681 1621 aa42.93■■■■■ 4.46
GGN-204ENST00000587676 ERCC6Q03468 1493 aa42.89■■■■■ 4.46
GGN-204ENST00000587676 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.78■■■■■ 4.44
GGN-204ENST00000587676 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
GGN-204ENST00000587676 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.63■■■■■ 4.41
GGN-204ENST00000587676 CUX2O14529 1486 aa42.57■■■■■ 4.41
GGN-204ENST00000587676 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.54■■■■■ 4.4
GGN-204ENST00000587676 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.39■■■■■ 4.38
GGN-204ENST00000587676 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
GGN-204ENST00000587676 CFTRP13569 1480 aa42.29■■■■■ 4.36
GGN-204ENST00000587676 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.2■■■■■ 4.35
GGN-204ENST00000587676 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.11■■■■■ 4.33
GGN-204ENST00000587676 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.1■■■■■ 4.33
GGN-204ENST00000587676 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.08■■■■■ 4.33
GGN-204ENST00000587676 WDR62O43379 1518 aa41.95■■■■■ 4.31
GGN-204ENST00000587676 PRDM2Q13029 1718 aa41.89■■■■■ 4.3
GGN-204ENST00000587676 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
GGN-204ENST00000587676 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.72■■■■■ 4.27
GGN-204ENST00000587676 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
GGN-204ENST00000587676 ABCC8Q09428 1581 aa41.41■■■■■ 4.22
GGN-204ENST00000587676 TOPBP1Q92547 1522 aa41.4■■■■■ 4.22
GGN-204ENST00000587676 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.31■■■■■ 4.2
GGN-204ENST00000587676 IFT140Q96RY7 1462 aa41.23■■■■■ 4.19
GGN-204ENST00000587676 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
GGN-204ENST00000587676 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
GGN-204ENST00000587676 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
GGN-204ENST00000587676 CUX1P39880 1505 aa40.95■■■■■ 4.15
GGN-204ENST00000587676 SOGA1O94964 1423 aa40.89■■■■■ 4.14
GGN-204ENST00000587676 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.87■■■■■ 4.13
GGN-204ENST00000587676 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.86■■■■■ 4.13
GGN-204ENST00000587676 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
GGN-204ENST00000587676 OSCARQ8IYS5 282 aa40.81■■■■■ 4.12
GGN-204ENST00000587676 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.81■■■■■ 4.12
GGN-204ENST00000587676 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
GGN-204ENST00000587676 WDR97A6NE52 1622 aa40.62■■■■■ 4.09
GGN-204ENST00000587676 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.59■■■■■ 4.09
GGN-204ENST00000587676 TOP2BQ02880 1626 aa40.52■■■■■ 4.08
GGN-204ENST00000587676 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.5■■■■■ 4.07
GGN-204ENST00000587676 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.47■■■■■ 4.07
GGN-204ENST00000587676 SYNJ1O43426 1573 aa40.47■■■■■ 4.07
GGN-204ENST00000587676 GRIN2BQ13224 1484 aa40.43■■■■■ 4.06
GGN-204ENST00000587676 CHD1O14646 1710 aa40.42■■■■■ 4.06
GGN-204ENST00000587676 FBLN2P98095 1184 aa40.41■■■■■ 4.06
GGN-204ENST00000587676 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.39■■■■■ 4.06
GGN-204ENST00000587676 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.39■■■■■ 4.06
GGN-204ENST00000587676 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
GGN-204ENST00000587676 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.31■■■■■ 4.04
GGN-204ENST00000587676 PBRM1Q86U86 1689 aa40.27■■■■■ 4.04
GGN-204ENST00000587676 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
GGN-204ENST00000587676 SYNJ2O15056 1496 aa40.2■■■■■ 4.03
GGN-204ENST00000587676 TRIM41Q8WV44 630 aa40.16■■■■■ 4.02
GGN-204ENST00000587676 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.12■■■■■ 4.01
GGN-204ENST00000587676 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.12■■■■■ 4.01
GGN-204ENST00000587676 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.12■■■■■ 4.01
GGN-204ENST00000587676 ARHGEF11O15085 1522 aa40.07■■■■■ 4.01
GGN-204ENST00000587676 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.98■■■■□ 3.99
GGN-204ENST00000587676 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.98■■■■□ 3.99
GGN-204ENST00000587676 ADAMTS12P58397 1594 aa39.94■■■■□ 3.98
GGN-204ENST00000587676 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.91■■■■□ 3.98
GGN-204ENST00000587676 GRIN2AQ12879 1464 aa39.89■■■■□ 3.98
GGN-204ENST00000587676 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.78■■■■□ 3.96
GGN-204ENST00000587676 KIF27Q86VH2 1401 aa39.78■■■■□ 3.96
GGN-204ENST00000587676 NUP160Q12769 1436 aa39.74■■■■□ 3.95
GGN-204ENST00000587676 ARAP1Q96P48 1450 aa39.73■■■■□ 3.95
GGN-204ENST00000587676 CEP170Q5SW79 1584 aa39.7■■■■□ 3.95
GGN-204ENST00000587676 IGF1RP08069 1367 aa39.68■■■■□ 3.94
GGN-204ENST00000587676 CUL7Q14999 1698 aa39.54■■■■□ 3.92
GGN-204ENST00000587676 SHROOM2Q13796 1616 aa39.47■■■■□ 3.91
GGN-204ENST00000587676 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.43■■■■□ 3.9
GGN-204ENST00000587676 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.4■■■■□ 3.9
GGN-204ENST00000587676 JPH4Q96JJ6 628 aa39.39■■■■□ 3.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.9 ms