RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587256.1

ATG4D-207, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-207ENST00000587256 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.14■■■■□ 3.38
ATG4D-207ENST00000587256 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.22■■■□□ 2.75
ATG4D-207ENST00000587256 ABCC9O60706 1549 aa31.62■■■□□ 2.65
ATG4D-207ENST00000587256 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.38■■■□□ 2.45
ATG4D-207ENST00000587256 NACADO15069 1562 aa30.29■■■□□ 2.44
ATG4D-207ENST00000587256 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.24■■■□□ 2.43
ATG4D-207ENST00000587256 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
ATG4D-207ENST00000587256 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.05■■■□□ 2.4
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ATG4D-207ENST00000587256 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.65■■■□□ 2.34
ATG4D-207ENST00000587256 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.49■■■□□ 2.31
ATG4D-207ENST00000587256 SCRIBQ14160 1630 aa29.42■■■□□ 2.3
ATG4D-207ENST00000587256 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.42■■■□□ 2.3
ATG4D-207ENST00000587256 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.15■■■□□ 2.26
ATG4D-207ENST00000587256 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29■■■□□ 2.23
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ATG4D-207ENST00000587256 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.58■■■□□ 2.17
ATG4D-207ENST00000587256 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.42■■■□□ 2.14
ATG4D-207ENST00000587256 SMARCA4P51532 1647 aa28.1■■■□□ 2.09
ATG4D-207ENST00000587256 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
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ATG4D-207ENST00000587256 SMARCA2P51531 1590 aa27.94■■■□□ 2.06
ATG4D-207ENST00000587256 NCAPD3P42695 1498 aa27.92■■■□□ 2.06
ATG4D-207ENST00000587256 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.86■■■□□ 2.05
ATG4D-207ENST00000587256 HMGXB3Q12766 1538 aa27.83■■■□□ 2.05
ATG4D-207ENST00000587256 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.8■■■□□ 2.04
ATG4D-207ENST00000587256 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
ATG4D-207ENST00000587256 WIZO95785 1651 aa27.56■■■□□ 2
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ATG4D-207ENST00000587256 ERCC6Q03468 1493 aa27.3■■□□□ 1.96
ATG4D-207ENST00000587256 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
ATG4D-207ENST00000587256 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.25■■□□□ 1.95
ATG4D-207ENST00000587256 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.11■■□□□ 1.93
ATG4D-207ENST00000587256 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.06■■□□□ 1.92
ATG4D-207ENST00000587256 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.01■■□□□ 1.92
ATG4D-207ENST00000587256 CUX2O14529 1486 aa27■■□□□ 1.91
ATG4D-207ENST00000587256 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
ATG4D-207ENST00000587256 CFTRP13569 1480 aa26.93■■□□□ 1.9
ATG4D-207ENST00000587256 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.92■■□□□ 1.9
ATG4D-207ENST00000587256 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.84■■□□□ 1.89
ATG4D-207ENST00000587256 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.84■■□□□ 1.89
ATG4D-207ENST00000587256 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.81■■□□□ 1.88
ATG4D-207ENST00000587256 PRDM2Q13029 1718 aa26.77■■□□□ 1.88
ATG4D-207ENST00000587256 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
ATG4D-207ENST00000587256 WDR62O43379 1518 aa26.72■■□□□ 1.87
ATG4D-207ENST00000587256 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
ATG4D-207ENST00000587256 TOPBP1Q92547 1522 aa26.39■■□□□ 1.82
ATG4D-207ENST00000587256 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.37■■□□□ 1.81
ATG4D-207ENST00000587256 ABCC8Q09428 1581 aa26.37■■□□□ 1.81
ATG4D-207ENST00000587256 IFT140Q96RY7 1462 aa26.26■■□□□ 1.79
ATG4D-207ENST00000587256 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.21■■□□□ 1.79
ATG4D-207ENST00000587256 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
ATG4D-207ENST00000587256 CUX1P39880 1505 aa26.15■■□□□ 1.78
ATG4D-207ENST00000587256 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
ATG4D-207ENST00000587256 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.11■■□□□ 1.77
ATG4D-207ENST00000587256 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
ATG4D-207ENST00000587256 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
ATG4D-207ENST00000587256 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.04■■□□□ 1.76
ATG4D-207ENST00000587256 SOGA1O94964 1423 aa26.03■■□□□ 1.76
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ATG4D-207ENST00000587256 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
ATG4D-207ENST00000587256 WDR97A6NE52 1622 aa25.92■■□□□ 1.74
ATG4D-207ENST00000587256 TOP2BQ02880 1626 aa25.92■■□□□ 1.74
ATG4D-207ENST00000587256 SYNJ1O43426 1573 aa25.91■■□□□ 1.74
ATG4D-207ENST00000587256 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
ATG4D-207ENST00000587256 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.91■■□□□ 1.74
ATG4D-207ENST00000587256 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.82■■□□□ 1.72
ATG4D-207ENST00000587256 OSCARQ8IYS5 282 aa25.81■■□□□ 1.72
ATG4D-207ENST00000587256 GRIN2BQ13224 1484 aa25.77■■□□□ 1.72
ATG4D-207ENST00000587256 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.77■■□□□ 1.72
ATG4D-207ENST00000587256 CHD1O14646 1710 aa25.75■■□□□ 1.71
ATG4D-207ENST00000587256 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.75■■□□□ 1.71
ATG4D-207ENST00000587256 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.75■■□□□ 1.71
ATG4D-207ENST00000587256 PBRM1Q86U86 1689 aa25.74■■□□□ 1.71
ATG4D-207ENST00000587256 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
ATG4D-207ENST00000587256 FBLN2P98095 1184 aa25.7■■□□□ 1.7
ATG4D-207ENST00000587256 SYNJ2O15056 1496 aa25.61■■□□□ 1.69
ATG4D-207ENST00000587256 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
ATG4D-207ENST00000587256 ADAMTS12P58397 1594 aa25.54■■□□□ 1.68
ATG4D-207ENST00000587256 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.52■■□□□ 1.68
ATG4D-207ENST00000587256 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG4D-207ENST00000587256 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG4D-207ENST00000587256 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG4D-207ENST00000587256 ARHGEF11O15085 1522 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG4D-207ENST00000587256 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.46■■□□□ 1.67
ATG4D-207ENST00000587256 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.45■■□□□ 1.66
ATG4D-207ENST00000587256 GRIN2AQ12879 1464 aa25.44■■□□□ 1.66
ATG4D-207ENST00000587256 KIF27Q86VH2 1401 aa25.42■■□□□ 1.66
ATG4D-207ENST00000587256 TRIM41Q8WV44 630 aa25.4■■□□□ 1.66
ATG4D-207ENST00000587256 CEP170Q5SW79 1584 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4D-207ENST00000587256 NUP160Q12769 1436 aa25.31■■□□□ 1.64
ATG4D-207ENST00000587256 CUL7Q14999 1698 aa25.3■■□□□ 1.64
ATG4D-207ENST00000587256 IGF1RP08069 1367 aa25.27■■□□□ 1.64
ATG4D-207ENST00000587256 ARAP1Q96P48 1450 aa25.24■■□□□ 1.63
ATG4D-207ENST00000587256 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG4D-207ENST00000587256 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.17■■□□□ 1.62
ATG4D-207ENST00000587256 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.15■■□□□ 1.62
ATG4D-207ENST00000587256 SHROOM2Q13796 1616 aa25.14■■□□□ 1.61
ATG4D-207ENST00000587256 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.09■■□□□ 1.61
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