RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586789.5

POLR2I-204, Transcript of RNA polymerase II subunit I, humanhuman

TSL 5

Gene POLR2I, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2I-204ENST00000586789 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.6■■■■■ 5.21
POLR2I-204ENST00000586789 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.45■■■■■ 4.39
POLR2I-204ENST00000586789 ABCC9O60706 1549 aa42.05■■■■■ 4.32
POLR2I-204ENST00000586789 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.23■■■■■ 4.03
POLR2I-204ENST00000586789 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.12■■■■■ 4.01
POLR2I-204ENST00000586789 NACADO15069 1562 aa40.06■■■■■ 4
POLR2I-204ENST00000586789 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.64■■■■□ 3.94
POLR2I-204ENST00000586789 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
POLR2I-204ENST00000586789 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.32■■■■□ 3.89
POLR2I-204ENST00000586789 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.26■■■■□ 3.88
POLR2I-204ENST00000586789 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.18■■■■□ 3.86
POLR2I-204ENST00000586789 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.95■■■■□ 3.83
POLR2I-204ENST00000586789 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.93■■■■□ 3.82
POLR2I-204ENST00000586789 SCRIBQ14160 1630 aa38.77■■■■□ 3.8
POLR2I-204ENST00000586789 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.54■■■■□ 3.76
POLR2I-204ENST00000586789 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.67
POLR2I-204ENST00000586789 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.95■■■■□ 3.67
POLR2I-204ENST00000586789 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.82■■■■□ 3.64
POLR2I-204ENST00000586789 SMARCA4P51532 1647 aa37■■■■□ 3.51
POLR2I-204ENST00000586789 NCAPD3P42695 1498 aa36.97■■■■□ 3.51
POLR2I-204ENST00000586789 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.94■■■■□ 3.5
POLR2I-204ENST00000586789 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
POLR2I-204ENST00000586789 SMARCA2P51531 1590 aa36.88■■■■□ 3.49
POLR2I-204ENST00000586789 HMGXB3Q12766 1538 aa36.73■■■■□ 3.47
POLR2I-204ENST00000586789 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.68■■■■□ 3.46
POLR2I-204ENST00000586789 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
POLR2I-204ENST00000586789 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.61■■■■□ 3.45
POLR2I-204ENST00000586789 ERCC6Q03468 1493 aa36.32■■■■□ 3.41
POLR2I-204ENST00000586789 WIZO95785 1651 aa36.24■■■■□ 3.39
POLR2I-204ENST00000586789 NESP48681 1621 aa36.23■■■■□ 3.39
POLR2I-204ENST00000586789 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
POLR2I-204ENST00000586789 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.06■■■■□ 3.36
POLR2I-204ENST00000586789 CUX2O14529 1486 aa36.01■■■■□ 3.36
POLR2I-204ENST00000586789 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.9■■■■□ 3.34
POLR2I-204ENST00000586789 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.9■■■■□ 3.34
POLR2I-204ENST00000586789 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
POLR2I-204ENST00000586789 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.73■■■■□ 3.31
POLR2I-204ENST00000586789 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
POLR2I-204ENST00000586789 CFTRP13569 1480 aa35.57■■■■□ 3.28
POLR2I-204ENST00000586789 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.53■■■■□ 3.28
POLR2I-204ENST00000586789 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.51■■■■□ 3.28
POLR2I-204ENST00000586789 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.5■■■■□ 3.27
POLR2I-204ENST00000586789 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.45■■■■□ 3.27
POLR2I-204ENST00000586789 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.43■■■■□ 3.26
POLR2I-204ENST00000586789 WDR62O43379 1518 aa35.37■■■■□ 3.25
POLR2I-204ENST00000586789 PRDM2Q13029 1718 aa35.18■■■■□ 3.22
POLR2I-204ENST00000586789 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
POLR2I-204ENST00000586789 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
POLR2I-204ENST00000586789 TOPBP1Q92547 1522 aa34.86■■■■□ 3.17
POLR2I-204ENST00000586789 ABCC8Q09428 1581 aa34.86■■■■□ 3.17
POLR2I-204ENST00000586789 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.78■■■■□ 3.16
POLR2I-204ENST00000586789 IFT140Q96RY7 1462 aa34.78■■■■□ 3.16
POLR2I-204ENST00000586789 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
POLR2I-204ENST00000586789 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
POLR2I-204ENST00000586789 OSCARQ8IYS5 282 aa34.52■■■■□ 3.12
POLR2I-204ENST00000586789 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
POLR2I-204ENST00000586789 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
POLR2I-204ENST00000586789 SOGA1O94964 1423 aa34.44■■■■□ 3.1
POLR2I-204ENST00000586789 CUX1P39880 1505 aa34.43■■■■□ 3.1
POLR2I-204ENST00000586789 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.41■■■■□ 3.1
POLR2I-204ENST00000586789 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.41■■■■□ 3.1
POLR2I-204ENST00000586789 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.4■■■■□ 3.1
POLR2I-204ENST00000586789 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
POLR2I-204ENST00000586789 FBLN2P98095 1184 aa34.19■■■■□ 3.06
POLR2I-204ENST00000586789 TRIM41Q8WV44 630 aa34.18■■■■□ 3.06
POLR2I-204ENST00000586789 WDR97A6NE52 1622 aa34.18■■■■□ 3.06
POLR2I-204ENST00000586789 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.11■■■■□ 3.05
POLR2I-204ENST00000586789 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.08■■■■□ 3.05
POLR2I-204ENST00000586789 GRIN2BQ13224 1484 aa34.07■■■■□ 3.05
POLR2I-204ENST00000586789 CHD1O14646 1710 aa34.07■■■■□ 3.05
POLR2I-204ENST00000586789 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.04■■■■□ 3.04
POLR2I-204ENST00000586789 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.01■■■■□ 3.04
POLR2I-204ENST00000586789 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
POLR2I-204ENST00000586789 TOP2BQ02880 1626 aa34.01■■■■□ 3.03
POLR2I-204ENST00000586789 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
POLR2I-204ENST00000586789 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.99■■■■□ 3.03
POLR2I-204ENST00000586789 SYNJ1O43426 1573 aa33.98■■■■□ 3.03
POLR2I-204ENST00000586789 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.92■■■■□ 3.02
POLR2I-204ENST00000586789 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.92■■■■□ 3.02
POLR2I-204ENST00000586789 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.92■■■■□ 3.02
POLR2I-204ENST00000586789 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.9■■■■□ 3.02
POLR2I-204ENST00000586789 ARHGEF11O15085 1522 aa33.89■■■■□ 3.02
POLR2I-204ENST00000586789 PBRM1Q86U86 1689 aa33.89■■■■□ 3.02
POLR2I-204ENST00000586789 SYNJ2O15056 1496 aa33.88■■■■□ 3.01
POLR2I-204ENST00000586789 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.7■■■□□ 2.99
POLR2I-204ENST00000586789 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.69■■■□□ 2.98
POLR2I-204ENST00000586789 ADAMTS12P58397 1594 aa33.64■■■□□ 2.98
POLR2I-204ENST00000586789 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.62■■■□□ 2.97
POLR2I-204ENST00000586789 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.62■■■□□ 2.97
POLR2I-204ENST00000586789 GRIN2AQ12879 1464 aa33.61■■■□□ 2.97
POLR2I-204ENST00000586789 ARAP1Q96P48 1450 aa33.59■■■□□ 2.97
POLR2I-204ENST00000586789 NUP160Q12769 1436 aa33.46■■■□□ 2.95
POLR2I-204ENST00000586789 KIF27Q86VH2 1401 aa33.45■■■□□ 2.94
POLR2I-204ENST00000586789 CEP170Q5SW79 1584 aa33.43■■■□□ 2.94
POLR2I-204ENST00000586789 IGF1RP08069 1367 aa33.33■■■□□ 2.93
POLR2I-204ENST00000586789 CUL7Q14999 1698 aa33.23■■■□□ 2.91
POLR2I-204ENST00000586789 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.21■■■□□ 2.91
POLR2I-204ENST00000586789 SHROOM2Q13796 1616 aa33.2■■■□□ 2.91
POLR2I-204ENST00000586789 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
POLR2I-204ENST00000586789 JPH4Q96JJ6 628 aa33.19■■■□□ 2.9
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