RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.2■■■□□ 2.42
DNMT1-208ENST00000586667 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.71■■□□□ 1.87
DNMT1-208ENST00000586667 ABCC9O60706 1549 aa25.62■■□□□ 1.69
DNMT1-208ENST00000586667 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
DNMT1-208ENST00000586667 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.04■■□□□ 1.6
DNMT1-208ENST00000586667 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.97■■□□□ 1.59
DNMT1-208ENST00000586667 NACADO15069 1562 aa24.93■■□□□ 1.58
DNMT1-208ENST00000586667 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.84■■□□□ 1.57
DNMT1-208ENST00000586667 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.76■■□□□ 1.55
DNMT1-208ENST00000586667 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.4■■□□□ 1.5
DNMT1-208ENST00000586667 SCRIBQ14160 1630 aa24.38■■□□□ 1.49
DNMT1-208ENST00000586667 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.2■■□□□ 1.46
DNMT1-208ENST00000586667 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.02■■□□□ 1.44
DNMT1-208ENST00000586667 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
DNMT1-208ENST00000586667 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.49■■□□□ 1.35
DNMT1-208ENST00000586667 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
DNMT1-208ENST00000586667 SMARCA4P51532 1647 aa23.37■■□□□ 1.33
DNMT1-208ENST00000586667 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
DNMT1-208ENST00000586667 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.31■■□□□ 1.32
DNMT1-208ENST00000586667 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.24■■□□□ 1.31
DNMT1-208ENST00000586667 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.17■■□□□ 1.3
DNMT1-208ENST00000586667 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
DNMT1-208ENST00000586667 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.1■■□□□ 1.29
DNMT1-208ENST00000586667 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.1■■□□□ 1.29
DNMT1-208ENST00000586667 WIZO95785 1651 aa23.07■■□□□ 1.28
DNMT1-208ENST00000586667 SMARCA2P51531 1590 aa23.07■■□□□ 1.28
DNMT1-208ENST00000586667 NCAPD3P42695 1498 aa23■■□□□ 1.27
DNMT1-208ENST00000586667 HMGXB3Q12766 1538 aa22.98■■□□□ 1.27
DNMT1-208ENST00000586667 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
DNMT1-208ENST00000586667 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
DNMT1-208ENST00000586667 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
DNMT1-208ENST00000586667 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.54■■□□□ 1.2
DNMT1-208ENST00000586667 NESP48681 1621 aa22.35■■□□□ 1.17
DNMT1-208ENST00000586667 CFTRP13569 1480 aa22.34■■□□□ 1.17
DNMT1-208ENST00000586667 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.33■■□□□ 1.16
DNMT1-208ENST00000586667 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.31■■□□□ 1.16
DNMT1-208ENST00000586667 PRDM2Q13029 1718 aa22.26■■□□□ 1.15
DNMT1-208ENST00000586667 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.13■■□□□ 1.13
DNMT1-208ENST00000586667 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.09■■□□□ 1.13
DNMT1-208ENST00000586667 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.08■■□□□ 1.13
DNMT1-208ENST00000586667 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.01■■□□□ 1.11
DNMT1-208ENST00000586667 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
DNMT1-208ENST00000586667 ERCC6Q03468 1493 aa21.98■■□□□ 1.11
DNMT1-208ENST00000586667 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.91■■□□□ 1.1
DNMT1-208ENST00000586667 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
DNMT1-208ENST00000586667 ABCC8Q09428 1581 aa21.89■■□□□ 1.09
DNMT1-208ENST00000586667 WDR62O43379 1518 aa21.89■■□□□ 1.09
DNMT1-208ENST00000586667 CUX1P39880 1505 aa21.85■■□□□ 1.09
DNMT1-208ENST00000586667 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.84■■□□□ 1.09
DNMT1-208ENST00000586667 SYNJ1O43426 1573 aa21.82■■□□□ 1.08
DNMT1-208ENST00000586667 TOPBP1Q92547 1522 aa21.81■■□□□ 1.08
DNMT1-208ENST00000586667 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
DNMT1-208ENST00000586667 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.78■■□□□ 1.08
DNMT1-208ENST00000586667 TOP2BQ02880 1626 aa21.77■■□□□ 1.07
DNMT1-208ENST00000586667 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
DNMT1-208ENST00000586667 CUX2O14529 1486 aa21.66■■□□□ 1.06
DNMT1-208ENST00000586667 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.66■■□□□ 1.06
DNMT1-208ENST00000586667 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
DNMT1-208ENST00000586667 WDR97A6NE52 1622 aa21.58■■□□□ 1.04
DNMT1-208ENST00000586667 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.53■■□□□ 1.04
DNMT1-208ENST00000586667 IFT140Q96RY7 1462 aa21.52■■□□□ 1.04
DNMT1-208ENST00000586667 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.52■■□□□ 1.04
DNMT1-208ENST00000586667 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.48■■□□□ 1.03
DNMT1-208ENST00000586667 SOGA1O94964 1423 aa21.47■■□□□ 1.03
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
DNMT1-208ENST00000586667 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.43■■□□□ 1.02
DNMT1-208ENST00000586667 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
DNMT1-208ENST00000586667 TRIM41Q8WV44 630 aa21.41■■□□□ 1.02
DNMT1-208ENST00000586667 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
DNMT1-208ENST00000586667 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 11e-7■■■■□ 23.2
DNMT1-208ENST00000586667 PBRM1Q86U86 1689 aa21.3■■□□□ 1
DNMT1-208ENST00000586667 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.29■■□□□ 1
DNMT1-208ENST00000586667 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.28■■□□□ 1
DNMT1-208ENST00000586667 KIF27Q86VH2 1401 aa21.26■□□□□ 0.99
DNMT1-208ENST00000586667 GRIN2BQ13224 1484 aa21.22■□□□□ 0.99
DNMT1-208ENST00000586667 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.22■□□□□ 0.99
DNMT1-208ENST00000586667 ADAMTS12P58397 1594 aa21.19■□□□□ 0.98
DNMT1-208ENST00000586667 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.18■□□□□ 0.98
DNMT1-208ENST00000586667 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
DNMT1-208ENST00000586667 EEA1Q15075 1411 aa21.14■□□□□ 0.98
DNMT1-208ENST00000586667 IGF1RP08069 1367 aa21.13■□□□□ 0.97
DNMT1-208ENST00000586667 CUL7Q14999 1698 aa21.13■□□□□ 0.97
DNMT1-208ENST00000586667 SYNJ2O15056 1496 aa21.06■□□□□ 0.96
DNMT1-208ENST00000586667 PRXQ9BXM0 1461 aa21.06■□□□□ 0.96
DNMT1-208ENST00000586667 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.05■□□□□ 0.96
DNMT1-208ENST00000586667 CHD1O14646 1710 aa21.05■□□□□ 0.96
DNMT1-208ENST00000586667 GRIN2AQ12879 1464 aa21■□□□□ 0.95
DNMT1-208ENST00000586667 KIF21BO75037 1637 aa21■□□□□ 0.95
DNMT1-208ENST00000586667 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.98■□□□□ 0.95
DNMT1-208ENST00000586667 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
DNMT1-208ENST00000586667 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.97■□□□□ 0.95
DNMT1-208ENST00000586667 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.94■□□□□ 0.94
DNMT1-208ENST00000586667 CEP170Q5SW79 1584 aa20.92■□□□□ 0.94
DNMT1-208ENST00000586667 NUP160Q12769 1436 aa20.9■□□□□ 0.94
DNMT1-208ENST00000586667 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.86■□□□□ 0.93
DNMT1-208ENST00000586667 GOLGA3Q08378 1498 aa20.84■□□□□ 0.93
DNMT1-208ENST00000586667 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
DNMT1-208ENST00000586667 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.81■□□□□ 0.92
DNMT1-208ENST00000586667 FBLN2P98095 1184 aa20.81■□□□□ 0.92
DNMT1-208ENST00000586667 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.75■□□□□ 0.91
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