RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585236.5

TSPOAP1-AS1-211, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.99■■■■■ 7.03
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.58■■■■■ 5.37
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.45■■■■■ 5.35
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.03■■■■■ 5.28
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 NACADO15069 1562 aa47.63■■■■■ 5.22
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.63■■■■■ 5.22
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SCRIBQ14160 1630 aa47.2■■■■■ 5.15
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.82■■■■■ 4.93
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 WIZO95785 1651 aa45.26■■■■■ 4.84
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.05■■■■■ 4.8
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.78■■■■■ 4.76
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.69■■■■■ 4.74
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.41■■■■■ 4.7
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SMARCA2P51531 1590 aa44.4■■■■■ 4.7
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.35■■■■■ 4.69
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 HMGXB3Q12766 1538 aa43.92■■■■■ 4.62
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ABCC8Q09428 1581 aa43.57■■■■■ 4.57
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.35■■■■■ 4.53
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.23■■■■■ 4.51
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CFTRP13569 1480 aa43.1■■■■■ 4.49
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SYNJ1O43426 1573 aa43.04■■■■■ 4.48
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 NESP48681 1621 aa42.97■■■■■ 4.47
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PRDM2Q13029 1718 aa42.9■■■■■ 4.46
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.85■■■■■ 4.45
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SOGA1O94964 1423 aa42.84■■■■■ 4.45
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 EEA1Q15075 1411 aa42.82■■■■■ 4.45
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TOP2BQ02880 1626 aa42.82■■■■■ 4.45
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.77■■■■■ 4.44
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.75■■■■■ 4.43
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.66■■■■■ 4.42
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CUX1P39880 1505 aa42.62■■■■■ 4.41
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ERCC6Q03468 1493 aa42.6■■■■■ 4.41
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.58■■■■■ 4.41
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.55■■■■■ 4.4
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.47■■■■■ 4.39
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.41■■■■■ 4.38
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.39■■■■■ 4.38
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 GOLGA3Q08378 1498 aa42.27■■■■■ 4.36
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.22■■■■■ 4.35
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.09■■■■■ 4.33
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CEP162Q5TB80 1403 aa42.03■■■■■ 4.32
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CUX2O14529 1486 aa42■■■■■ 4.31
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.95■■■■■ 4.31
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PRXQ9BXM0 1461 aa41.92■■■■■ 4.3
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.89■■■■■ 4.3
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.69■■■■■ 4.27
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 WDR97A6NE52 1622 aa41.55■■■■■ 4.24
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ARAP1Q96P48 1450 aa41.15■■■■■ 4.18
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.07■■■■■ 4.16
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TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.96■■■■■ 4.15
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.93■■■■■ 4.14
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
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