RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585077.1

HEXDC-215, Transcript of hexosaminidase D, humanhuman

TSL 2

Gene HEXDC, Length 1,139 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEXDC-215ENST00000585077 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.32■■■■■ 6.77
HEXDC-215ENST00000585077 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.24■■■■■ 5.79
HEXDC-215ENST00000585077 ABCC9O60706 1549 aa50.92■■■■■ 5.74
HEXDC-215ENST00000585077 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.6■■■■■ 5.37
HEXDC-215ENST00000585077 NACADO15069 1562 aa48.35■■■■■ 5.33
HEXDC-215ENST00000585077 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.21■■■■■ 5.31
HEXDC-215ENST00000585077 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.81■■■■■ 5.24
HEXDC-215ENST00000585077 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.6■■■■■ 5.21
HEXDC-215ENST00000585077 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.53■■■■■ 5.2
HEXDC-215ENST00000585077 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.48■■■■■ 5.19
HEXDC-215ENST00000585077 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.45■■■■■ 5.19
HEXDC-215ENST00000585077 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.35■■■■■ 5.17
HEXDC-215ENST00000585077 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.22■■■■■ 5.15
HEXDC-215ENST00000585077 SCRIBQ14160 1630 aa46.77■■■■■ 5.08
HEXDC-215ENST00000585077 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.55■■■■■ 5.04
HEXDC-215ENST00000585077 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46■■■■■ 4.95
HEXDC-215ENST00000585077 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46■■■■■ 4.95
HEXDC-215ENST00000585077 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.8■■■■■ 4.92
HEXDC-215ENST00000585077 NCAPD3P42695 1498 aa44.65■■■■■ 4.74
HEXDC-215ENST00000585077 SMARCA4P51532 1647 aa44.64■■■■■ 4.74
HEXDC-215ENST00000585077 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.59■■■■■ 4.73
HEXDC-215ENST00000585077 SMARCA2P51531 1590 aa44.46■■■■■ 4.71
HEXDC-215ENST00000585077 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.45■■■■■ 4.71
HEXDC-215ENST00000585077 HMGXB3Q12766 1538 aa44.35■■■■■ 4.69
HEXDC-215ENST00000585077 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.2■■■■■ 4.67
HEXDC-215ENST00000585077 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.18■■■■■ 4.66
HEXDC-215ENST00000585077 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
HEXDC-215ENST00000585077 ERCC6Q03468 1493 aa43.9■■■■■ 4.62
HEXDC-215ENST00000585077 NESP48681 1621 aa43.88■■■■■ 4.61
HEXDC-215ENST00000585077 WIZO95785 1651 aa43.68■■■■■ 4.58
HEXDC-215ENST00000585077 CUX2O14529 1486 aa43.68■■■■■ 4.58
HEXDC-215ENST00000585077 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.56■■■■■ 4.56
HEXDC-215ENST00000585077 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
HEXDC-215ENST00000585077 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
HEXDC-215ENST00000585077 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.31■■■■■ 4.52
HEXDC-215ENST00000585077 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.3■■■■■ 4.52
HEXDC-215ENST00000585077 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.3■■■■■ 4.52
HEXDC-215ENST00000585077 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.23■■■■■ 4.51
HEXDC-215ENST00000585077 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
HEXDC-215ENST00000585077 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.93■■■■■ 4.46
HEXDC-215ENST00000585077 CFTRP13569 1480 aa42.91■■■■■ 4.46
HEXDC-215ENST00000585077 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.83■■■■■ 4.45
HEXDC-215ENST00000585077 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.83■■■■■ 4.45
HEXDC-215ENST00000585077 WDR62O43379 1518 aa42.81■■■■■ 4.44
HEXDC-215ENST00000585077 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.67■■■■■ 4.42
HEXDC-215ENST00000585077 PRDM2Q13029 1718 aa42.49■■■■■ 4.39
HEXDC-215ENST00000585077 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
HEXDC-215ENST00000585077 TOPBP1Q92547 1522 aa42.07■■■■■ 4.33
HEXDC-215ENST00000585077 IFT140Q96RY7 1462 aa41.96■■■■■ 4.31
HEXDC-215ENST00000585077 ABCC8Q09428 1581 aa41.95■■■■■ 4.31
HEXDC-215ENST00000585077 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.94■■■■■ 4.3
HEXDC-215ENST00000585077 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
HEXDC-215ENST00000585077 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
HEXDC-215ENST00000585077 OSCARQ8IYS5 282 aa41.74■■■■■ 4.27
HEXDC-215ENST00000585077 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
HEXDC-215ENST00000585077 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
HEXDC-215ENST00000585077 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
HEXDC-215ENST00000585077 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.55■■■■■ 4.241e-8■■■■■ 28.7
HEXDC-215ENST00000585077 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.53■■■■■ 4.24
HEXDC-215ENST00000585077 CUX1P39880 1505 aa41.51■■■■■ 4.24
HEXDC-215ENST00000585077 TRIM41Q8WV44 630 aa41.51■■■■■ 4.24
HEXDC-215ENST00000585077 SOGA1O94964 1423 aa41.47■■■■■ 4.23
HEXDC-215ENST00000585077 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.47■■■■■ 4.23
HEXDC-215ENST00000585077 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
HEXDC-215ENST00000585077 CHD1O14646 1710 aa41.29■■■■■ 4.2
HEXDC-215ENST00000585077 WDR97A6NE52 1622 aa41.22■■■■■ 4.19
HEXDC-215ENST00000585077 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.2■■■■■ 4.19
HEXDC-215ENST00000585077 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.2■■■■■ 4.19
HEXDC-215ENST00000585077 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.2■■■■■ 4.19
HEXDC-215ENST00000585077 FBLN2P98095 1184 aa41.18■■■■■ 4.18
HEXDC-215ENST00000585077 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.14■■■■■ 4.18
HEXDC-215ENST00000585077 ARHGEF11O15085 1522 aa41.11■■■■■ 4.17
HEXDC-215ENST00000585077 GRIN2BQ13224 1484 aa41.07■■■■■ 4.16
HEXDC-215ENST00000585077 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
HEXDC-215ENST00000585077 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.01■■■■■ 4.16
HEXDC-215ENST00000585077 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.98■■■■■ 4.15
HEXDC-215ENST00000585077 PBRM1Q86U86 1689 aa40.94■■■■■ 4.14
HEXDC-215ENST00000585077 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.93■■■■■ 4.14
HEXDC-215ENST00000585077 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
HEXDC-215ENST00000585077 TOP2BQ02880 1626 aa40.92■■■■■ 4.14
HEXDC-215ENST00000585077 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.92■■■■■ 4.14
HEXDC-215ENST00000585077 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.92■■■■■ 4.14
HEXDC-215ENST00000585077 SYNJ1O43426 1573 aa40.91■■■■■ 4.14
HEXDC-215ENST00000585077 SYNJ2O15056 1496 aa40.88■■■■■ 4.13
HEXDC-215ENST00000585077 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.83■■■■■ 4.13
HEXDC-215ENST00000585077 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.77■■■■■ 4.12
HEXDC-215ENST00000585077 ARAP1Q96P48 1450 aa40.75■■■■■ 4.11
HEXDC-215ENST00000585077 ADAMTS12P58397 1594 aa40.6■■■■■ 4.09
HEXDC-215ENST00000585077 GRIN2AQ12879 1464 aa40.55■■■■■ 4.08
HEXDC-215ENST00000585077 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.48■■■■■ 4.07
HEXDC-215ENST00000585077 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.47■■■■■ 4.07
HEXDC-215ENST00000585077 CEP170Q5SW79 1584 aa40.4■■■■■ 4.06
HEXDC-215ENST00000585077 NUP160Q12769 1436 aa40.4■■■■■ 4.06
HEXDC-215ENST00000585077 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.25■■■■■ 4.03
HEXDC-215ENST00000585077 SHROOM2Q13796 1616 aa40.18■■■■■ 4.02
HEXDC-215ENST00000585077 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
HEXDC-215ENST00000585077 KIF27Q86VH2 1401 aa40.12■■■■■ 4.01
HEXDC-215ENST00000585077 IGF1RP08069 1367 aa40.09■■■■■ 4.01
HEXDC-215ENST00000585077 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40■■■■□ 3.99
HEXDC-215ENST00000585077 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.6 ms