RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584214.1

CENPV-206, Transcript of centromere protein V, humanhuman

TSL 2

Gene CENPV, Length 735 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPV-206ENST00000584214 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.28■■■■■ 6.92
CENPV-206ENST00000584214 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.18■■■■■ 5.94
CENPV-206ENST00000584214 ABCC9O60706 1549 aa51.64■■■■■ 5.86
CENPV-206ENST00000584214 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.44■■■■■ 5.5
CENPV-206ENST00000584214 NACADO15069 1562 aa49.22■■■■■ 5.47
CENPV-206ENST00000584214 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.83■■■■■ 5.41
CENPV-206ENST00000584214 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.75■■■■■ 5.39
CENPV-206ENST00000584214 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.41■■■■■ 5.34
CENPV-206ENST00000584214 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.3■■■■■ 5.32
CENPV-206ENST00000584214 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.26■■■■■ 5.32
CENPV-206ENST00000584214 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.09■■■■■ 5.29
CENPV-206ENST00000584214 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.07■■■■■ 5.29
CENPV-206ENST00000584214 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.97■■■■■ 5.27
CENPV-206ENST00000584214 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.47■■■■■ 5.19
CENPV-206ENST00000584214 SCRIBQ14160 1630 aa47.44■■■■■ 5.18
CENPV-206ENST00000584214 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.75■■■■■ 5.07
CENPV-206ENST00000584214 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.72■■■■■ 5.07
CENPV-206ENST00000584214 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.51■■■■■ 5.04
CENPV-206ENST00000584214 NCAPD3P42695 1498 aa45.43■■■■■ 4.86
CENPV-206ENST00000584214 SMARCA4P51532 1647 aa45.37■■■■■ 4.85
CENPV-206ENST00000584214 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.31■■■■■ 4.84
CENPV-206ENST00000584214 SMARCA2P51531 1590 aa45.24■■■■■ 4.83
CENPV-206ENST00000584214 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.23■■■■■ 4.83
CENPV-206ENST00000584214 HMGXB3Q12766 1538 aa45.15■■■■■ 4.82
CENPV-206ENST00000584214 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.01■■■■■ 4.8
CENPV-206ENST00000584214 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.87■■■■■ 4.77
CENPV-206ENST00000584214 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
CENPV-206ENST00000584214 ERCC6Q03468 1493 aa44.57■■■■■ 4.73
CENPV-206ENST00000584214 NESP48681 1621 aa44.48■■■■■ 4.71
CENPV-206ENST00000584214 CUX2O14529 1486 aa44.45■■■■■ 4.71
CENPV-206ENST00000584214 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.35■■■■■ 4.69
CENPV-206ENST00000584214 WIZO95785 1651 aa44.34■■■■■ 4.69
CENPV-206ENST00000584214 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.11■■■■■ 4.65
CENPV-206ENST00000584214 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.04■■■■■ 4.64
CENPV-206ENST00000584214 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.04■■■■■ 4.64
CENPV-206ENST00000584214 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
CENPV-206ENST00000584214 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.97■■■■■ 4.63
CENPV-206ENST00000584214 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.91■■■■■ 4.62
CENPV-206ENST00000584214 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
CENPV-206ENST00000584214 CFTRP13569 1480 aa43.64■■■■■ 4.58
CENPV-206ENST00000584214 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.63■■■■■ 4.57
CENPV-206ENST00000584214 WDR62O43379 1518 aa43.53■■■■■ 4.56
CENPV-206ENST00000584214 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.53■■■■■ 4.56
CENPV-206ENST00000584214 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.51■■■■■ 4.56
CENPV-206ENST00000584214 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.32■■■■■ 4.53
CENPV-206ENST00000584214 PRDM2Q13029 1718 aa43.26■■■■■ 4.52
CENPV-206ENST00000584214 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
CENPV-206ENST00000584214 ABCC8Q09428 1581 aa42.74■■■■■ 4.43
CENPV-206ENST00000584214 TOPBP1Q92547 1522 aa42.74■■■■■ 4.43
CENPV-206ENST00000584214 IFT140Q96RY7 1462 aa42.66■■■■■ 4.42
CENPV-206ENST00000584214 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.64■■■■■ 4.42
CENPV-206ENST00000584214 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.5■■■■■ 4.39
CENPV-206ENST00000584214 OSCARQ8IYS5 282 aa42.42■■■■■ 4.38
CENPV-206ENST00000584214 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
CENPV-206ENST00000584214 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
CENPV-206ENST00000584214 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
CENPV-206ENST00000584214 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
CENPV-206ENST00000584214 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.16■■■■■ 4.341e-8■■□□□ 14.3
CENPV-206ENST00000584214 CUX1P39880 1505 aa42.15■■■■■ 4.34
CENPV-206ENST00000584214 SOGA1O94964 1423 aa42.12■■■■■ 4.33
CENPV-206ENST00000584214 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.11■■■■■ 4.33
CENPV-206ENST00000584214 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.11■■■■■ 4.33
CENPV-206ENST00000584214 WDR97A6NE52 1622 aa42.03■■■■■ 4.32
CENPV-206ENST00000584214 TRIM41Q8WV44 630 aa42.02■■■■■ 4.32
CENPV-206ENST00000584214 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
CENPV-206ENST00000584214 CHD1O14646 1710 aa41.92■■■■■ 4.3
CENPV-206ENST00000584214 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.83■■■■■ 4.29
CENPV-206ENST00000584214 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.83■■■■■ 4.29
CENPV-206ENST00000584214 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.83■■■■■ 4.29
CENPV-206ENST00000584214 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.76■■■■■ 4.28
CENPV-206ENST00000584214 ARHGEF11O15085 1522 aa41.75■■■■■ 4.27
CENPV-206ENST00000584214 GRIN2BQ13224 1484 aa41.74■■■■■ 4.27
CENPV-206ENST00000584214 FBLN2P98095 1184 aa41.73■■■■■ 4.27
CENPV-206ENST00000584214 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
CENPV-206ENST00000584214 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.7■■■■■ 4.27
CENPV-206ENST00000584214 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.64■■■■■ 4.26
CENPV-206ENST00000584214 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.62■■■■■ 4.25
CENPV-206ENST00000584214 TOP2BQ02880 1626 aa41.62■■■■■ 4.25
CENPV-206ENST00000584214 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.6■■■■■ 4.25
CENPV-206ENST00000584214 PBRM1Q86U86 1689 aa41.6■■■■■ 4.25
CENPV-206ENST00000584214 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.6■■■■■ 4.25
CENPV-206ENST00000584214 SYNJ2O15056 1496 aa41.57■■■■■ 4.25
CENPV-206ENST00000584214 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
CENPV-206ENST00000584214 SYNJ1O43426 1573 aa41.53■■■■■ 4.24
CENPV-206ENST00000584214 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.49■■■■■ 4.23
CENPV-206ENST00000584214 ARAP1Q96P48 1450 aa41.36■■■■■ 4.21
CENPV-206ENST00000584214 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.34■■■■■ 4.21
CENPV-206ENST00000584214 ADAMTS12P58397 1594 aa41.24■■■■■ 4.19
CENPV-206ENST00000584214 GRIN2AQ12879 1464 aa41.21■■■■■ 4.19
CENPV-206ENST00000584214 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.2■■■■■ 4.19
CENPV-206ENST00000584214 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.14■■■■■ 4.18
CENPV-206ENST00000584214 NUP160Q12769 1436 aa41.08■■■■■ 4.17
CENPV-206ENST00000584214 CEP170Q5SW79 1584 aa41.03■■■■■ 4.16
CENPV-206ENST00000584214 SHROOM2Q13796 1616 aa40.87■■■■■ 4.13
CENPV-206ENST00000584214 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.8■■■■■ 4.12
CENPV-206ENST00000584214 KIF27Q86VH2 1401 aa40.78■■■■■ 4.12
CENPV-206ENST00000584214 IGF1RP08069 1367 aa40.73■■■■■ 4.11
CENPV-206ENST00000584214 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
CENPV-206ENST00000584214 CUL7Q14999 1698 aa40.68■■■■■ 4.1
CENPV-206ENST00000584214 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.65■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 166 ms