RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584197.5

ANAPC11-220, Transcript of anaphase promoting complex subunit 11, humanhuman

TSL 5

Gene ANAPC11, Length 386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANAPC11-220ENST00000584197 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.28■■■■■ 7.88
ANAPC11-220ENST00000584197 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.31■■■■■ 6.76
ANAPC11-220ENST00000584197 ABCC9O60706 1549 aa56.43■■■■■ 6.62
ANAPC11-220ENST00000584197 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.11■■■■■ 6.25
ANAPC11-220ENST00000584197 NACADO15069 1562 aa53.96■■■■■ 6.23
ANAPC11-220ENST00000584197 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.75■■■■■ 6.2
ANAPC11-220ENST00000584197 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.54■■■■■ 6.16
ANAPC11-220ENST00000584197 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.47■■■■■ 6.15
ANAPC11-220ENST00000584197 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.17■■■■■ 6.1
ANAPC11-220ENST00000584197 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.92■■■■■ 6.06
ANAPC11-220ENST00000584197 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.66■■■■■ 6.02
ANAPC11-220ENST00000584197 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.57■■■■■ 6.01
ANAPC11-220ENST00000584197 SCRIBQ14160 1630 aa52.24■■■■■ 5.95
ANAPC11-220ENST00000584197 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.22■■■■■ 5.95
ANAPC11-220ENST00000584197 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.92■■■■■ 5.9
ANAPC11-220ENST00000584197 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.17■■■■■ 5.78
ANAPC11-220ENST00000584197 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.05■■■■■ 5.76
ANAPC11-220ENST00000584197 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.75■■■■■ 5.71
ANAPC11-220ENST00000584197 SMARCA4P51532 1647 aa49.96■■■■■ 5.59
ANAPC11-220ENST00000584197 NCAPD3P42695 1498 aa49.82■■■■■ 5.57
ANAPC11-220ENST00000584197 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.82■■■■■ 5.57
ANAPC11-220ENST00000584197 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.78■■■■■ 5.56
ANAPC11-220ENST00000584197 SMARCA2P51531 1590 aa49.67■■■■■ 5.54
ANAPC11-220ENST00000584197 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.54■■■■■ 5.52
ANAPC11-220ENST00000584197 HMGXB3Q12766 1538 aa49.54■■■■■ 5.52
ANAPC11-220ENST00000584197 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.49■■■■■ 5.51
ANAPC11-220ENST00000584197 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.31■■■■■ 5.48
ANAPC11-220ENST00000584197 WIZO95785 1651 aa48.98■■■■■ 5.43
ANAPC11-220ENST00000584197 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.83■■■■■ 5.41
ANAPC11-220ENST00000584197 NESP48681 1621 aa48.76■■■■■ 5.4
ANAPC11-220ENST00000584197 ERCC6Q03468 1493 aa48.63■■■■■ 5.38
ANAPC11-220ENST00000584197 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.55■■■■■ 5.36
ANAPC11-220ENST00000584197 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.42■■■■■ 5.34
ANAPC11-220ENST00000584197 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.33■■■■■ 5.33
ANAPC11-220ENST00000584197 CUX2O14529 1486 aa48.3■■■■■ 5.32
ANAPC11-220ENST00000584197 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.21■■■■■ 5.31
ANAPC11-220ENST00000584197 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.15■■■■■ 5.3
ANAPC11-220ENST00000584197 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.11■■■■■ 5.29
ANAPC11-220ENST00000584197 CFTRP13569 1480 aa47.98■■■■■ 5.27
ANAPC11-220ENST00000584197 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.86■■■■■ 5.25
ANAPC11-220ENST00000584197 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.77■■■■■ 5.24
ANAPC11-220ENST00000584197 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.77■■■■■ 5.24
ANAPC11-220ENST00000584197 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.74■■■■■ 5.23
ANAPC11-220ENST00000584197 WDR62O43379 1518 aa47.65■■■■■ 5.22
ANAPC11-220ENST00000584197 PRDM2Q13029 1718 aa47.56■■■■■ 5.2
ANAPC11-220ENST00000584197 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.35■■■■■ 5.17
ANAPC11-220ENST00000584197 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.29■■■■■ 5.16
ANAPC11-220ENST00000584197 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.2■■■■■ 5.15
ANAPC11-220ENST00000584197 TOPBP1Q92547 1522 aa46.98■■■■■ 5.11
ANAPC11-220ENST00000584197 ABCC8Q09428 1581 aa46.9■■■■■ 5.1
ANAPC11-220ENST00000584197 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.88■■■■■ 5.1
ANAPC11-220ENST00000584197 IFT140Q96RY7 1462 aa46.76■■■■■ 5.08
ANAPC11-220ENST00000584197 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.62■■■■■ 5.05
ANAPC11-220ENST00000584197 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.56■■■■■ 5.04
ANAPC11-220ENST00000584197 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.53■■■■■ 5.04
ANAPC11-220ENST00000584197 CUX1P39880 1505 aa46.49■■■■■ 5.03
ANAPC11-220ENST00000584197 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
ANAPC11-220ENST00000584197 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.38■■■■■ 5.01
ANAPC11-220ENST00000584197 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.36■■■■■ 5.01
ANAPC11-220ENST00000584197 SOGA1O94964 1423 aa46.33■■■■■ 5.01
ANAPC11-220ENST00000584197 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.29■■■■■ 51e-6■■■■■ 31
ANAPC11-220ENST00000584197 OSCARQ8IYS5 282 aa46.19■■■■■ 4.98
ANAPC11-220ENST00000584197 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
ANAPC11-220ENST00000584197 WDR97A6NE52 1622 aa46.1■■■■■ 4.97
ANAPC11-220ENST00000584197 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.01■■■■■ 4.96
ANAPC11-220ENST00000584197 TOP2BQ02880 1626 aa45.98■■■■■ 4.95
ANAPC11-220ENST00000584197 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.98■■■■■ 4.95
ANAPC11-220ENST00000584197 SYNJ1O43426 1573 aa45.96■■■■■ 4.95
ANAPC11-220ENST00000584197 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.91■■■■■ 4.94
ANAPC11-220ENST00000584197 CHD1O14646 1710 aa45.89■■■■■ 4.94
ANAPC11-220ENST00000584197 GRIN2BQ13224 1484 aa45.84■■■■■ 4.93
ANAPC11-220ENST00000584197 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.84■■■■■ 4.93
ANAPC11-220ENST00000584197 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.8■■■■■ 4.92
ANAPC11-220ENST00000584197 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.78■■■■■ 4.92
ANAPC11-220ENST00000584197 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.76■■■■■ 4.92
ANAPC11-220ENST00000584197 PBRM1Q86U86 1689 aa45.73■■■■■ 4.91
ANAPC11-220ENST00000584197 FBLN2P98095 1184 aa45.73■■■■■ 4.91
ANAPC11-220ENST00000584197 SYNJ2O15056 1496 aa45.6■■■■■ 4.89
ANAPC11-220ENST00000584197 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.56■■■■■ 4.88
ANAPC11-220ENST00000584197 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.55■■■■■ 4.88
ANAPC11-220ENST00000584197 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.55■■■■■ 4.88
ANAPC11-220ENST00000584197 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.55■■■■■ 4.88
ANAPC11-220ENST00000584197 TRIM41Q8WV44 630 aa45.51■■■■■ 4.88
ANAPC11-220ENST00000584197 ARHGEF11O15085 1522 aa45.51■■■■■ 4.88
ANAPC11-220ENST00000584197 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.42■■■■■ 4.86
ANAPC11-220ENST00000584197 ADAMTS12P58397 1594 aa45.37■■■■■ 4.85
ANAPC11-220ENST00000584197 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.35■■■■■ 4.85
ANAPC11-220ENST00000584197 GRIN2AQ12879 1464 aa45.27■■■■■ 4.84
ANAPC11-220ENST00000584197 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.25■■■■■ 4.83
ANAPC11-220ENST00000584197 ARAP1Q96P48 1450 aa45.12■■■■■ 4.81
ANAPC11-220ENST00000584197 NUP160Q12769 1436 aa45.1■■■■■ 4.81
ANAPC11-220ENST00000584197 CEP170Q5SW79 1584 aa45.08■■■■■ 4.81
ANAPC11-220ENST00000584197 KIF27Q86VH2 1401 aa45.06■■■■■ 4.8
ANAPC11-220ENST00000584197 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.05■■■■■ 4.8
ANAPC11-220ENST00000584197 IGF1RP08069 1367 aa44.97■■■■■ 4.79
ANAPC11-220ENST00000584197 CUL7Q14999 1698 aa44.84■■■■■ 4.77
ANAPC11-220ENST00000584197 SHROOM2Q13796 1616 aa44.82■■■■■ 4.77
ANAPC11-220ENST00000584197 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.77■■■■■ 4.76
ANAPC11-220ENST00000584197 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.71■■■■■ 4.75
ANAPC11-220ENST00000584197 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.66■■■■■ 4.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms