RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583841.1

TSPOAP1-AS1-210, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1-AS1, Length 840 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.26■■■■□ 3.55
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TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.94■■■□□ 2.54
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NACADO15069 1562 aa30.81■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.81■■■□□ 2.52
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.75■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.73■■■□□ 2.51
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SCRIBQ14160 1630 aa30.14■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.82■■■□□ 2.36
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.8■■■□□ 2.36
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
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TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.97■■■□□ 2.23
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SMARCA4P51532 1647 aa28.84■■■□□ 2.21
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.76■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.65■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SMARCA2P51531 1590 aa28.51■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.51■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 WIZO95785 1651 aa28.51■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.5■■■□□ 2.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NCAPD3P42695 1498 aa28.39■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HMGXB3Q12766 1538 aa28.33■■■□□ 2.13
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TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NESP48681 1621 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.61■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.59■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CFTRP13569 1480 aa27.55■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PRDM2Q13029 1718 aa27.52■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.4■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ERCC6Q03468 1493 aa27.33■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.25■■□□□ 1.95
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.09■■□□□ 1.93
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ABCC8Q09428 1581 aa27.04■■□□□ 1.92
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 WDR62O43379 1518 aa27■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.97■■□□□ 1.91
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CUX1P39880 1505 aa26.95■■□□□ 1.9
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TOPBP1Q92547 1522 aa26.95■■□□□ 1.9
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TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.86■■□□□ 1.89
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TOP2BQ02880 1626 aa26.84■■□□□ 1.89
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CUX2O14529 1486 aa26.81■■□□□ 1.88
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.77■■□□□ 1.88
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TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.64■■□□□ 1.86
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IFT140Q96RY7 1462 aa26.63■■□□□ 1.85
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SOGA1O94964 1423 aa26.63■■□□□ 1.85
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRIM41Q8WV44 630 aa26.62■■□□□ 1.85
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.61■■□□□ 1.85
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 WDR97A6NE52 1622 aa26.57■■□□□ 1.84
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.5■■□□□ 1.83
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.4■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PBRM1Q86U86 1689 aa26.35■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.35■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIF27Q86VH2 1401 aa26.31■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.27■■□□□ 1.8
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GRIN2BQ13224 1484 aa26.26■■□□□ 1.79
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.2■■□□□ 1.79
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.19■■□□□ 1.78
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TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IGF1RP08069 1367 aa26.12■■□□□ 1.77
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ADAMTS12P58397 1594 aa26.12■■□□□ 1.77
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EEA1Q15075 1411 aa26.11■■□□□ 1.77
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CUL7Q14999 1698 aa26.1■■□□□ 1.77
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CHD1O14646 1710 aa26.08■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.04■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SYNJ2O15056 1496 aa26.04■■□□□ 1.76
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FBLN2P98095 1184 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GRIN2AQ12879 1464 aa25.94■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PRXQ9BXM0 1461 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIF21BO75037 1637 aa25.88■■□□□ 1.73
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CEP170Q5SW79 1584 aa25.82■■□□□ 1.72
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.78■■□□□ 1.72
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NUP160Q12769 1436 aa25.78■■□□□ 1.72
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 OSCARQ8IYS5 282 aa25.77■■□□□ 1.72
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GOLGA3Q08378 1498 aa25.74■■□□□ 1.71
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