RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583704.1

TTC19-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 2

Gene TTC19, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-210	ENST00000583704	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		55.82	■■■■■ 6.53
TTC19-210	ENST00000583704	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.06	■■■■■ 5.6
TTC19-210	ENST00000583704	ABCC9	O60706	1549 aa		49.87	■■■■■ 5.57
TTC19-210	ENST00000583704	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.54	■■■■■ 5.2
TTC19-210	ENST00000583704	NACAD	O15069	1562 aa		47.24	■■■■■ 5.15
TTC19-210	ENST00000583704	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.01	■■■■■ 5.12
TTC19-210	ENST00000583704	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.62	■■■■■ 5.05
TTC19-210	ENST00000583704	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.58	■■■■■ 5.05
TTC19-210	ENST00000583704	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.55	■■■■■ 5.04
TTC19-210	ENST00000583704	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.43	■■■■■ 5.02
TTC19-210	ENST00000583704	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.32	■■■■■ 5.01
TTC19-210	ENST00000583704	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.18	■■■■■ 4.98
TTC19-210	ENST00000583704	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.1	■■■■■ 4.97
TTC19-210	ENST00000583704	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.66	■■■■■ 4.9
TTC19-210	ENST00000583704	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.52	■■■■■ 4.88
TTC19-210	ENST00000583704	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.08	■■■■■ 4.81
TTC19-210	ENST00000583704	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.03	■■■■■ 4.8
TTC19-210	ENST00000583704	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.9	■■■■■ 4.78
TTC19-210	ENST00000583704	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.58	■■■■■ 4.57
TTC19-210	ENST00000583704	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.55	■■■■■ 4.56
TTC19-210	ENST00000583704	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.5	■■■■■ 4.55
TTC19-210	ENST00000583704	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.4	■■■■■ 4.54
TTC19-210	ENST00000583704	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.33	■■■■■ 4.53
TTC19-210	ENST00000583704	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.32	■■■■■ 4.53
TTC19-210	ENST00000583704	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.11	■■■■■ 4.49
TTC19-210	ENST00000583704	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.09	■■■■■ 4.49
TTC19-210	ENST00000583704	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.05	■■■■■ 4.48
TTC19-210	ENST00000583704	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.03	■■■■■ 4.48
TTC19-210	ENST00000583704	NES	P48681	1621 aa		42.91	■■■■■ 4.46
TTC19-210	ENST00000583704	CUX2	O14529	1486 aa		42.89	■■■■■ 4.46
TTC19-210	ENST00000583704	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.62	■■■■■ 4.41
TTC19-210	ENST00000583704	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.62	■■■■■ 4.41
TTC19-210	ENST00000583704	WIZ	O95785	1651 aa		42.56	■■■■■ 4.4
TTC19-210	ENST00000583704	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
TTC19-210	ENST00000583704	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.41	■■■■■ 4.38
TTC19-210	ENST00000583704	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.33	■■■■■ 4.37
TTC19-210	ENST00000583704	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.27	■■■■■ 4.36
TTC19-210	ENST00000583704	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.18	■■■■■ 4.34
TTC19-210	ENST00000583704	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.01	■■■■■ 4.32
TTC19-210	ENST00000583704	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.99	■■■■■ 4.31
TTC19-210	ENST00000583704	WDR62	O43379	1518 aa		41.9	■■■■■ 4.3
TTC19-210	ENST00000583704	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.86	■■■■■ 4.29
TTC19-210	ENST00000583704	CFTR	P13569	1480 aa		41.85	■■■■■ 4.29
TTC19-210	ENST00000583704	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.82	■■■■■ 4.29
TTC19-210	ENST00000583704	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.53	■■■■■ 4.24
TTC19-210	ENST00000583704	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.5	■■■■■ 4.23
TTC19-210	ENST00000583704	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.49	■■■■■ 4.23
TTC19-210	ENST00000583704	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.06	■■■■■ 4.16
TTC19-210	ENST00000583704	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41	■■■■■ 4.15
TTC19-210	ENST00000583704	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.94	■■■■■ 4.14
TTC19-210	ENST00000583704	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		40.94	■■■■■ 4.14
TTC19-210	ENST00000583704	ABCC8	Q09428	1581 aa		40.93	■■■■■ 4.14
TTC19-210	ENST00000583704	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.91	■■■■■ 4.14
TTC19-210	ENST00000583704	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.88	■■■■■ 4.13
TTC19-210	ENST00000583704	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.77	■■■■■ 4.12
TTC19-210	ENST00000583704	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
TTC19-210	ENST00000583704	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.65	■■■■■ 4.1
TTC19-210	ENST00000583704	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.58	■■■■■ 4.09	3e-8	■■■□□ 16.7
TTC19-210	ENST00000583704	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.51	■■■■■ 4.07
TTC19-210	ENST00000583704	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.46	■■■■■ 4.07
TTC19-210	ENST00000583704	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.46	■■■■■ 4.07
TTC19-210	ENST00000583704	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.46	■■■■■ 4.07
TTC19-210	ENST00000583704	CHD1	O14646	1710 aa		40.45	■■■■■ 4.07
TTC19-210	ENST00000583704	SOGA1	O94964	1423 aa		40.43	■■■■■ 4.06
TTC19-210	ENST00000583704	CUX1	P39880	1505 aa		40.43	■■■■■ 4.06
TTC19-210	ENST00000583704	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
TTC19-210	ENST00000583704	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.43	■■■■■ 4.06
TTC19-210	ENST00000583704	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.35	■■■■■ 4.05
TTC19-210	ENST00000583704	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.33	■■■■■ 4.05
TTC19-210	ENST00000583704	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.28	■■■■■ 4.04
TTC19-210	ENST00000583704	FBLN2	P98095	1184 aa		40.26	■■■■■ 4.04
TTC19-210	ENST00000583704	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.19	■■■■■ 4.03
TTC19-210	ENST00000583704	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.08	■■■■■ 4.01
TTC19-210	ENST00000583704	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.07	■■■■■ 4.01
TTC19-210	ENST00000583704	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.02	■■■■■ 4
TTC19-210	ENST00000583704	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		39.97	■■■■□ 3.99
TTC19-210	ENST00000583704	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		39.97	■■■■□ 3.99
TTC19-210	ENST00000583704	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	39.97	■■■■□ 3.99
TTC19-210	ENST00000583704	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		39.96	■■■■□ 3.99
TTC19-210	ENST00000583704	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.95	■■■■□ 3.99
TTC19-210	ENST00000583704	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.94	■■■■□ 3.98
TTC19-210	ENST00000583704	SYNJ2	O15056	1496 aa		39.94	■■■■□ 3.98
TTC19-210	ENST00000583704	SYNJ1	O43426	1573 aa		39.93	■■■■□ 3.98
TTC19-210	ENST00000583704	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		39.93	■■■■□ 3.98
TTC19-210	ENST00000583704	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		39.85	■■■■□ 3.97
TTC19-210	ENST00000583704	TOP2B	Q02880	1626 aa		39.83	■■■■□ 3.97
TTC19-210	ENST00000583704	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	39.82	■■■■□ 3.96
TTC19-210	ENST00000583704	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.63	■■■■□ 3.93
TTC19-210	ENST00000583704	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.59	■■■■□ 3.93
TTC19-210	ENST00000583704	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	39.48	■■■■□ 3.91
TTC19-210	ENST00000583704	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.47	■■■■□ 3.91
TTC19-210	ENST00000583704	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.46	■■■■□ 3.91
TTC19-210	ENST00000583704	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.46	■■■■□ 3.91
TTC19-210	ENST00000583704	NUP160	Q12769	1436 aa		39.43	■■■■□ 3.9
TTC19-210	ENST00000583704	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.36	■■■■□ 3.89
TTC19-210	ENST00000583704	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.27	■■■■□ 3.88
TTC19-210	ENST00000583704	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.07	■■■■□ 3.84
TTC19-210	ENST00000583704	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	39.03	■■■■□ 3.84
TTC19-210	ENST00000583704	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.01	■■■■□ 3.84
TTC19-210	ENST00000583704	JPH4	Q96JJ6	628 aa		38.98	■■■■□ 3.83

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