RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583486.1

GPS1-218, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPS1, Length 796 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-218ENST00000583486 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.67■■■■□ 3.62
GPS1-218ENST00000583486 ABCC9O60706 1549 aa34.76■■■■□ 3.15
GPS1-218ENST00000583486 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.12■■■■□ 3.05
GPS1-218ENST00000583486 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.15■■■□□ 2.9
GPS1-218ENST00000583486 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.83■■■□□ 2.85
GPS1-218ENST00000583486 NACADO15069 1562 aa32.44■■■□□ 2.78
GPS1-218ENST00000583486 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.25■■■□□ 2.752e-8■■■□□ 18.6
GPS1-218ENST00000583486 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.15■■■□□ 2.74
GPS1-218ENST00000583486 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.97■■■□□ 2.71
GPS1-218ENST00000583486 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.82■■■□□ 2.68
GPS1-218ENST00000583486 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.77■■■□□ 2.68
GPS1-218ENST00000583486 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.44■■■□□ 2.62
GPS1-218ENST00000583486 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.41■■■□□ 2.62
GPS1-218ENST00000583486 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.35■■■□□ 2.61
GPS1-218ENST00000583486 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
GPS1-218ENST00000583486 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.1■■■□□ 2.57
GPS1-218ENST00000583486 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
GPS1-218ENST00000583486 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.03■■■□□ 2.56
GPS1-218ENST00000583486 SCRIBQ14160 1630 aa31.02■■■□□ 2.56
GPS1-218ENST00000583486 CUX2O14529 1486 aa30.29■■■□□ 2.44
GPS1-218ENST00000583486 ERCC6Q03468 1493 aa30.13■■■□□ 2.41
GPS1-218ENST00000583486 NCAPD3P42695 1498 aa29.94■■■□□ 2.38
GPS1-218ENST00000583486 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.74■■■□□ 2.35
GPS1-218ENST00000583486 HMGXB3Q12766 1538 aa29.66■■■□□ 2.34
GPS1-218ENST00000583486 SMARCA2P51531 1590 aa29.66■■■□□ 2.34
GPS1-218ENST00000583486 NESP48681 1621 aa29.63■■■□□ 2.33
GPS1-218ENST00000583486 SMARCA4P51532 1647 aa29.53■■■□□ 2.32
GPS1-218ENST00000583486 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
GPS1-218ENST00000583486 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
GPS1-218ENST00000583486 TRIM41Q8WV44 630 aa29.39■■■□□ 2.3
GPS1-218ENST00000583486 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.39■■■□□ 2.29
GPS1-218ENST00000583486 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
GPS1-218ENST00000583486 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.28■■■□□ 2.28
GPS1-218ENST00000583486 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.25■■■□□ 2.27
GPS1-218ENST00000583486 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.23■■■□□ 2.27
GPS1-218ENST00000583486 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.03■■■□□ 2.24
GPS1-218ENST00000583486 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.01■■■□□ 2.24
GPS1-218ENST00000583486 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.99■■■□□ 2.23
GPS1-218ENST00000583486 WDR62O43379 1518 aa28.95■■■□□ 2.23
GPS1-218ENST00000583486 OSCARQ8IYS5 282 aa28.82■■■□□ 2.2
GPS1-218ENST00000583486 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.79■■■□□ 2.2
GPS1-218ENST00000583486 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.68■■■□□ 2.18
GPS1-218ENST00000583486 WIZO95785 1651 aa28.6■■■□□ 2.17
GPS1-218ENST00000583486 CFTRP13569 1480 aa28.53■■■□□ 2.16
GPS1-218ENST00000583486 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
GPS1-218ENST00000583486 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.43■■■□□ 2.14
GPS1-218ENST00000583486 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.43■■■□□ 2.14
GPS1-218ENST00000583486 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.43■■■□□ 2.14
GPS1-218ENST00000583486 ARHGEF11O15085 1522 aa28.3■■■□□ 2.12
GPS1-218ENST00000583486 IFT140Q96RY7 1462 aa28.24■■■□□ 2.11
GPS1-218ENST00000583486 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
GPS1-218ENST00000583486 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
GPS1-218ENST00000583486 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
GPS1-218ENST00000583486 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.16■■■□□ 2.1
GPS1-218ENST00000583486 PRDM2Q13029 1718 aa28.14■■■□□ 2.1
GPS1-218ENST00000583486 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
GPS1-218ENST00000583486 TOPBP1Q92547 1522 aa28.03■■■□□ 2.08
GPS1-218ENST00000583486 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
GPS1-218ENST00000583486 ABCC8Q09428 1581 aa28■■■□□ 2.07
GPS1-218ENST00000583486 ARAP1Q96P48 1450 aa27.95■■■□□ 2.07
GPS1-218ENST00000583486 CHD1O14646 1710 aa27.92■■■□□ 2.06
GPS1-218ENST00000583486 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.9■■■□□ 2.06
GPS1-218ENST00000583486 FBLN2P98095 1184 aa27.9■■■□□ 2.06
GPS1-218ENST00000583486 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.89■■■□□ 2.05
GPS1-218ENST00000583486 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.88■■■□□ 2.05
GPS1-218ENST00000583486 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
GPS1-218ENST00000583486 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
GPS1-218ENST00000583486 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
GPS1-218ENST00000583486 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
GPS1-218ENST00000583486 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.61■■■□□ 2.01
GPS1-218ENST00000583486 SOGA1O94964 1423 aa27.59■■■□□ 2.01
GPS1-218ENST00000583486 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.59■■■□□ 2.01
GPS1-218ENST00000583486 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
GPS1-218ENST00000583486 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.58■■■□□ 2.01
GPS1-218ENST00000583486 SYNJ1O43426 1573 aa27.57■■■□□ 2
GPS1-218ENST00000583486 WDR97A6NE52 1622 aa27.56■■■□□ 2
GPS1-218ENST00000583486 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
GPS1-218ENST00000583486 GRIN2BQ13224 1484 aa27.44■■□□□ 1.98
GPS1-218ENST00000583486 SYNJ2O15056 1496 aa27.44■■□□□ 1.98
GPS1-218ENST00000583486 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.44■■□□□ 1.98
GPS1-218ENST00000583486 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.4■■□□□ 1.98
GPS1-218ENST00000583486 CUX1P39880 1505 aa27.29■■□□□ 1.96
GPS1-218ENST00000583486 PBRM1Q86U86 1689 aa27.23■■□□□ 1.95
GPS1-218ENST00000583486 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.1■■□□□ 1.93
GPS1-218ENST00000583486 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.09■■□□□ 1.93
GPS1-218ENST00000583486 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.08■■□□□ 1.93
GPS1-218ENST00000583486 GRIN2AQ12879 1464 aa27.07■■□□□ 1.92
GPS1-218ENST00000583486 CEP170Q5SW79 1584 aa27.04■■□□□ 1.92
GPS1-218ENST00000583486 NUP160Q12769 1436 aa27■■□□□ 1.91
GPS1-218ENST00000583486 ADAMTS12P58397 1594 aa26.95■■□□□ 1.9
GPS1-218ENST00000583486 SHROOM2Q13796 1616 aa26.94■■□□□ 1.9
GPS1-218ENST00000583486 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.93■■□□□ 1.9
GPS1-218ENST00000583486 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.9
GPS1-218ENST00000583486 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.89■■□□□ 1.89
GPS1-218ENST00000583486 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
GPS1-218ENST00000583486 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.8■■□□□ 1.88
GPS1-218ENST00000583486 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
GPS1-218ENST00000583486 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.77■■□□□ 1.88
GPS1-218ENST00000583486 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.76■■□□□ 1.87
GPS1-218ENST00000583486 JPH4Q96JJ6 628 aa26.75■■□□□ 1.87
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