RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583115.5

TMEM220-AS1-205, TMEM220 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TMEM220-AS1, Length 521 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.87■■■■■ 4.29
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.25■■■■□ 3.55
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 ABCC9O60706 1549 aa36.84■■■■□ 3.49
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.2■■■■□ 3.23
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 NACADO15069 1562 aa35.1■■■■□ 3.21
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.07■■■■□ 3.2
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.81■■■■□ 3.16
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.58■■■■□ 3.13
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.44■■■■□ 3.1
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.1
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.28■■■■□ 3.08
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.18■■■■□ 3.06
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 SCRIBQ14160 1630 aa34.06■■■■□ 3.04
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.73■■■□□ 2.99
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.27■■■□□ 2.92
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.1■■■□□ 2.89
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 SMARCA4P51532 1647 aa32.53■■■□□ 2.8
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 NCAPD3P42695 1498 aa32.46■■■□□ 2.79
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.46■■■□□ 2.79
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 SMARCA2P51531 1590 aa32.32■■■□□ 2.76
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.32■■■□□ 2.76
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 HMGXB3Q12766 1538 aa32.23■■■□□ 2.75
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.21■■■□□ 2.75
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 WIZO95785 1651 aa31.92■■■□□ 2.7
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 NESP48681 1621 aa31.84■■■□□ 2.69
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 ERCC6Q03468 1493 aa31.68■■■□□ 2.66
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.57■■■□□ 2.64
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.49■■■□□ 2.63
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CUX2O14529 1486 aa31.44■■■□□ 2.62
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.37■■■□□ 2.61
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.36■■■□□ 2.61
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CFTRP13569 1480 aa31.26■■■□□ 2.59
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.21■■■□□ 2.59
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.13■■■□□ 2.57
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.12■■■□□ 2.57
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.08■■■□□ 2.57
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 WDR62O43379 1518 aa31.03■■■□□ 2.56
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.87■■■□□ 2.53
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 PRDM2Q13029 1718 aa30.87■■■□□ 2.53
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 TOPBP1Q92547 1522 aa30.62■■■□□ 2.49
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.52■■■□□ 2.48
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 ABCC8Q09428 1581 aa30.48■■■□□ 2.47
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 IFT140Q96RY7 1462 aa30.45■■■□□ 2.47
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CUX1P39880 1505 aa30.32■■■□□ 2.44
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.26■■■□□ 2.44
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.23■■■□□ 2.43
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.21■■■□□ 2.43
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 SOGA1O94964 1423 aa30.19■■■□□ 2.42
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 OSCARQ8IYS5 282 aa30.1■■■□□ 2.41
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.97■■■□□ 2.39
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 SYNJ1O43426 1573 aa29.97■■■□□ 2.39
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 WDR97A6NE52 1622 aa29.96■■■□□ 2.39
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 TOP2BQ02880 1626 aa29.92■■■□□ 2.38
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.91■■■□□ 2.38
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.91■■■□□ 2.38
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.89■■■□□ 2.38
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CHD1O14646 1710 aa29.88■■■□□ 2.37
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 GRIN2BQ13224 1484 aa29.85■■■□□ 2.37
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 FBLN2P98095 1184 aa29.83■■■□□ 2.37
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.82■■■□□ 2.36
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.82■■■□□ 2.36
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 PBRM1Q86U86 1689 aa29.74■■■□□ 2.35
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 TRIM41Q8WV44 630 aa29.73■■■□□ 2.35
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 SYNJ2O15056 1496 aa29.69■■■□□ 2.34
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.69■■■□□ 2.34
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.69■■■□□ 2.34
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.69■■■□□ 2.34
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 ARHGEF11O15085 1522 aa29.66■■■□□ 2.34
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.61■■■□□ 2.33
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 ADAMTS12P58397 1594 aa29.56■■■□□ 2.32
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.5■■■□□ 2.31
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 GRIN2AQ12879 1464 aa29.49■■■□□ 2.31
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.46■■■□□ 2.31
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 ARAP1Q96P48 1450 aa29.45■■■□□ 2.31
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.4■■■□□ 2.3
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CEP170Q5SW79 1584 aa29.39■■■□□ 2.3
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 NUP160Q12769 1436 aa29.39■■■□□ 2.3
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 IGF1RP08069 1367 aa29.33■■■□□ 2.29
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 KIF27Q86VH2 1401 aa29.33■■■□□ 2.29
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.25■■■□□ 2.27
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 SHROOM2Q13796 1616 aa29.18■■■□□ 2.26
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CUL7Q14999 1698 aa29.14■■■□□ 2.26
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.14■■■□□ 2.25
TMEM220-AS1-205ENST00000583115 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms