RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583012.1

TMEM220-AS1-204, TMEM220 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM220-AS1, Length 609 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.28■■■■□ 3.24
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.46■■■□□ 2.63
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 ABCC9O60706 1549 aa30.86■■■□□ 2.53
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.65■■■□□ 2.34
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 NACADO15069 1562 aa29.56■■■□□ 2.32
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.53■■■□□ 2.32
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.17■■■□□ 2.26
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.03■■■□□ 2.24
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.74■■■□□ 2.19
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 SCRIBQ14160 1630 aa28.72■■■□□ 2.19
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.41■■■□□ 2.14
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.33■■■□□ 2.13
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.92■■■□□ 2.06
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.72■■■□□ 2.03
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 SMARCA4P51532 1647 aa27.44■■□□□ 1.98
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 SMARCA2P51531 1590 aa27.26■■□□□ 1.96
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.26■■□□□ 1.95
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 NCAPD3P42695 1498 aa27.24■■□□□ 1.95
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.2■■□□□ 1.94
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 HMGXB3Q12766 1538 aa27.15■■□□□ 1.94
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.13■■□□□ 1.93
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 WIZO95785 1651 aa26.94■■□□□ 1.9
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 NESP48681 1621 aa26.68■■□□□ 1.86
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 ERCC6Q03468 1493 aa26.63■■□□□ 1.85
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.59■■□□□ 1.85
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.46■■□□□ 1.83
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.41■■□□□ 1.82
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.39■■□□□ 1.82
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CUX2O14529 1486 aa26.35■■□□□ 1.81
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CFTRP13569 1480 aa26.29■■□□□ 1.8
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.28■■□□□ 1.8
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 PRDM2Q13029 1718 aa26.19■■□□□ 1.78
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.18■■□□□ 1.78
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.18■■□□□ 1.78
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.16■■□□□ 1.78
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 WDR62O43379 1518 aa26.07■■□□□ 1.76
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 TOPBP1Q92547 1522 aa25.76■■□□□ 1.71
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.74■■□□□ 1.71
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 ABCC8Q09428 1581 aa25.73■■□□□ 1.71
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 IFT140Q96RY7 1462 aa25.61■■□□□ 1.69
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.6■■□□□ 1.69
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CUX1P39880 1505 aa25.53■■□□□ 1.68
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.47■■□□□ 1.67
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.42■■□□□ 1.66
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 SOGA1O94964 1423 aa25.41■■□□□ 1.66
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.31■■□□□ 1.64
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 WDR97A6NE52 1622 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 TOP2BQ02880 1626 aa25.3■■□□□ 1.64
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 SYNJ1O43426 1573 aa25.29■■□□□ 1.64
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 OSCARQ8IYS5 282 aa25.2■■□□□ 1.62
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.19■■□□□ 1.62
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CHD1O14646 1710 aa25.18■■□□□ 1.62
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 PBRM1Q86U86 1689 aa25.16■■□□□ 1.62
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.15■■□□□ 1.62
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.14■■□□□ 1.61
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 GRIN2BQ13224 1484 aa25.14■■□□□ 1.61
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.13■■□□□ 1.61
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 FBLN2P98095 1184 aa25.08■■□□□ 1.61
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 SYNJ2O15056 1496 aa24.99■■□□□ 1.59
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 ADAMTS12P58397 1594 aa24.92■■□□□ 1.58
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.9■■□□□ 1.58
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.89■■□□□ 1.57
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.89■■□□□ 1.57
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.89■■□□□ 1.57
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 ARHGEF11O15085 1522 aa24.85■■□□□ 1.57
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.84■■□□□ 1.57
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.83■■□□□ 1.57
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 GRIN2AQ12879 1464 aa24.82■■□□□ 1.56
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 KIF27Q86VH2 1401 aa24.8■■□□□ 1.56
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 TRIM41Q8WV44 630 aa24.79■■□□□ 1.56
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CEP170Q5SW79 1584 aa24.71■■□□□ 1.55
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CUL7Q14999 1698 aa24.7■■□□□ 1.54
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 NUP160Q12769 1436 aa24.69■■□□□ 1.54
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 IGF1RP08069 1367 aa24.67■■□□□ 1.54
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 ARAP1Q96P48 1450 aa24.64■■□□□ 1.53
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.59■■□□□ 1.53
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.56■■□□□ 1.52
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 SHROOM2Q13796 1616 aa24.55■■□□□ 1.52
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.54■■□□□ 1.52
TMEM220-AS1-204ENST00000583012 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms