RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582955.5

SMARCE1-218, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-218ENST00000582955 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.6■■■□□ 2.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.22■■□□□ 1.95
SMARCE1-218ENST00000582955 ABCC9O60706 1549 aa26.72■■□□□ 1.87
SMARCE1-218ENST00000582955 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.66■■□□□ 1.7
SMARCE1-218ENST00000582955 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.66■■□□□ 1.7
SMARCE1-218ENST00000582955 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SMARCE1-218ENST00000582955 NACADO15069 1562 aa25.61■■□□□ 1.69
SMARCE1-218ENST00000582955 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
SMARCE1-218ENST00000582955 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.4■■□□□ 1.66
SMARCE1-218ENST00000582955 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.28■■□□□ 1.64
SMARCE1-218ENST00000582955 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.06■■□□□ 1.6
SMARCE1-218ENST00000582955 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
SMARCE1-218ENST00000582955 SCRIBQ14160 1630 aa24.88■■□□□ 1.57
SMARCE1-218ENST00000582955 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.86■■□□□ 1.57
SMARCE1-218ENST00000582955 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.58■■□□□ 1.53
SMARCE1-218ENST00000582955 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.52■■□□□ 1.52
SMARCE1-218ENST00000582955 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SMARCE1-218ENST00000582955 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.14■■□□□ 1.46
SMARCE1-218ENST00000582955 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.09■■□□□ 1.45
SMARCE1-218ENST00000582955 CECR2Q9BXF3 1484 aa24■■□□□ 1.43
SMARCE1-218ENST00000582955 SMARCA4P51532 1647 aa23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1-218ENST00000582955 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SMARCE1-218ENST00000582955 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.63■■□□□ 1.37
SMARCE1-218ENST00000582955 NCAPD3P42695 1498 aa23.62■■□□□ 1.37
SMARCE1-218ENST00000582955 SMARCA2P51531 1590 aa23.61■■□□□ 1.37
SMARCE1-218ENST00000582955 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.59■■□□□ 1.37
SMARCE1-218ENST00000582955 HMGXB3Q12766 1538 aa23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1-218ENST00000582955 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.5■■□□□ 1.35
SMARCE1-218ENST00000582955 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SMARCE1-218ENST00000582955 WIZO95785 1651 aa23.35■■□□□ 1.33
SMARCE1-218ENST00000582955 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SMARCE1-218ENST00000582955 NESP48681 1621 aa23.1■■□□□ 1.29
SMARCE1-218ENST00000582955 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SMARCE1-218ENST00000582955 ERCC6Q03468 1493 aa23.05■■□□□ 1.28
SMARCE1-218ENST00000582955 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.01■■□□□ 1.27
SMARCE1-218ENST00000582955 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.94■■□□□ 1.26
SMARCE1-218ENST00000582955 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.88■■□□□ 1.25
SMARCE1-218ENST00000582955 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.82■■□□□ 1.24
SMARCE1-218ENST00000582955 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.81■■□□□ 1.24
SMARCE1-218ENST00000582955 CFTRP13569 1480 aa22.79■■□□□ 1.24
SMARCE1-218ENST00000582955 CUX2O14529 1486 aa22.78■■□□□ 1.24
SMARCE1-218ENST00000582955 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SMARCE1-218ENST00000582955 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1-218ENST00000582955 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1-218ENST00000582955 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.68■■□□□ 1.22
SMARCE1-218ENST00000582955 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.65■■□□□ 1.22
SMARCE1-218ENST00000582955 PRDM2Q13029 1718 aa22.62■■□□□ 1.21
SMARCE1-218ENST00000582955 WDR62O43379 1518 aa22.56■■□□□ 1.2
SMARCE1-218ENST00000582955 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SMARCE1-218ENST00000582955 TOPBP1Q92547 1522 aa22.32■■□□□ 1.16
SMARCE1-218ENST00000582955 ABCC8Q09428 1581 aa22.31■■□□□ 1.16
SMARCE1-218ENST00000582955 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.29■■□□□ 1.16
SMARCE1-218ENST00000582955 IFT140Q96RY7 1462 aa22.19■■□□□ 1.14
SMARCE1-218ENST00000582955 CUX1P39880 1505 aa22.14■■□□□ 1.13
SMARCE1-218ENST00000582955 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SMARCE1-218ENST00000582955 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.12■■□□□ 1.13
SMARCE1-218ENST00000582955 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SMARCE1-218ENST00000582955 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.09■■□□□ 1.13
SMARCE1-218ENST00000582955 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SMARCE1-218ENST00000582955 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1-218ENST00000582955 SOGA1O94964 1423 aa22.05■■□□□ 1.12
SMARCE1-218ENST00000582955 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SMARCE1-218ENST00000582955 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
SMARCE1-218ENST00000582955 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
SMARCE1-218ENST00000582955 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SMARCE1-218ENST00000582955 SYNJ1O43426 1573 aa21.93■■□□□ 1.1
SMARCE1-218ENST00000582955 TOP2BQ02880 1626 aa21.93■■□□□ 1.1
SMARCE1-218ENST00000582955 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.92■■□□□ 1.1
SMARCE1-218ENST00000582955 WDR97A6NE52 1622 aa21.88■■□□□ 1.09
SMARCE1-218ENST00000582955 OSCARQ8IYS5 282 aa21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1-218ENST00000582955 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.84■■□□□ 1.09
SMARCE1-218ENST00000582955 GRIN2BQ13224 1484 aa21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1-218ENST00000582955 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.79■■□□□ 1.08
SMARCE1-218ENST00000582955 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.78■■□□□ 1.08
SMARCE1-218ENST00000582955 FBLN2P98095 1184 aa21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1-218ENST00000582955 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.77■■□□□ 1.07
SMARCE1-218ENST00000582955 PBRM1Q86U86 1689 aa21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1-218ENST00000582955 CHD1O14646 1710 aa21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1-218ENST00000582955 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1-218ENST00000582955 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SMARCE1-218ENST00000582955 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SMARCE1-218ENST00000582955 SYNJ2O15056 1496 aa21.65■■□□□ 1.06
SMARCE1-218ENST00000582955 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.58■■□□□ 1.04
SMARCE1-218ENST00000582955 ADAMTS12P58397 1594 aa21.57■■□□□ 1.04
SMARCE1-218ENST00000582955 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1-218ENST00000582955 KIF27Q86VH2 1401 aa21.54■■□□□ 1.04
SMARCE1-218ENST00000582955 GRIN2AQ12879 1464 aa21.52■■□□□ 1.03
SMARCE1-218ENST00000582955 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.5■■□□□ 1.03
SMARCE1-218ENST00000582955 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1-218ENST00000582955 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1-218ENST00000582955 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1-218ENST00000582955 ARHGEF11O15085 1522 aa21.49■■□□□ 1.03
SMARCE1-218ENST00000582955 TRIM41Q8WV44 630 aa21.47■■□□□ 1.03
SMARCE1-218ENST00000582955 IGF1RP08069 1367 aa21.43■■□□□ 1.02
SMARCE1-218ENST00000582955 CEP170Q5SW79 1584 aa21.41■■□□□ 1.02
SMARCE1-218ENST00000582955 NUP160Q12769 1436 aa21.39■■□□□ 1.02
SMARCE1-218ENST00000582955 CUL7Q14999 1698 aa21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1-218ENST00000582955 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.33■■□□□ 1
SMARCE1-218ENST00000582955 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.32■■□□□ 1
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