RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582348.1

TSPOAP1-AS1-208, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene TSPOAP1-AS1, Length 558 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.72■■■□□ 2.67
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.3■■■□□ 2.12
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ABCC9O60706 1549 aa27.98■■■□□ 2.07
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.76■■□□□ 1.87
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 NACADO15069 1562 aa26.67■■□□□ 1.86
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.61■■□□□ 1.85
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.41■■□□□ 1.82
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.2■■□□□ 1.79
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.19■■□□□ 1.78
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 BICRAQ9NZM4 1560 aa26■■□□□ 1.75
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.95■■□□□ 1.74
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SCRIBQ14160 1630 aa25.85■■□□□ 1.73
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.3■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SMARCA4P51532 1647 aa24.68■■□□□ 1.54
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 NCAPD3P42695 1498 aa24.62■■□□□ 1.53
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.6■■□□□ 1.53
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SMARCA2P51531 1590 aa24.54■■□□□ 1.52
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 HMGXB3Q12766 1538 aa24.48■■□□□ 1.51
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.46■■□□□ 1.51
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.42■■□□□ 1.5
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 WIZO95785 1651 aa24.19■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 NESP48681 1621 aa24.15■■□□□ 1.46
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ERCC6Q03468 1493 aa24.12■■□□□ 1.45
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24■■□□□ 1.43
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CUX2O14529 1486 aa23.94■■□□□ 1.42
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.89■■□□□ 1.41
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.85■■□□□ 1.41
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.84■■□□□ 1.41
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CFTRP13569 1480 aa23.69■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.64■■□□□ 1.38
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.62■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.62■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.61■■□□□ 1.37
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 WDR62O43379 1518 aa23.58■■□□□ 1.36
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.53■■□□□ 1.36
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PRDM2Q13029 1718 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 TOPBP1Q92547 1522 aa23.23■■□□□ 1.31
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.16■■□□□ 1.3
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ABCC8Q09428 1581 aa23.15■■□□□ 1.3
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 IFT140Q96RY7 1462 aa23.12■■□□□ 1.29
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CUX1P39880 1505 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 OSCARQ8IYS5 282 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SOGA1O94964 1423 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 WDR97A6NE52 1622 aa22.75■■□□□ 1.23
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CHD1O14646 1710 aa22.73■■□□□ 1.23
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.69■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SYNJ1O43426 1573 aa22.68■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 TOP2BQ02880 1626 aa22.68■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.68■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 FBLN2P98095 1184 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 TRIM41Q8WV44 630 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 GRIN2BQ13224 1484 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.63■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.62■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PBRM1Q86U86 1689 aa22.61■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.6■■□□□ 1.21
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ARHGEF11O15085 1522 aa22.56■■□□□ 1.2
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SYNJ2O15056 1496 aa22.54■■□□□ 1.2
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.47■■□□□ 1.19
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ADAMTS12P58397 1594 aa22.42■■□□□ 1.18
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.38■■□□□ 1.17
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 GRIN2AQ12879 1464 aa22.38■■□□□ 1.17
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ARAP1Q96P48 1450 aa22.38■■□□□ 1.17
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CEP170Q5SW79 1584 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 NUP160Q12769 1436 aa22.29■■□□□ 1.16
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 KIF27Q86VH2 1401 aa22.23■■□□□ 1.15
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 IGF1RP08069 1367 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.18■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 SHROOM2Q13796 1616 aa22.16■■□□□ 1.14
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 CUL7Q14999 1698 aa22.13■■□□□ 1.13
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPOAP1-AS1-208ENST00000582348 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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