RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582295.1

C1QTNF1-210, Transcript of C1q and TNF related 1, humanhuman

TSL 2

Gene C1QTNF1, Length 517 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1-210ENST00000582295 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.09■■■■■ 8.33
C1QTNF1-210ENST00000582295 ABCC9O60706 1549 aa60.33■■■■■ 7.25
C1QTNF1-210ENST00000582295 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.32■■■■■ 7.25
C1QTNF1-210ENST00000582295 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.36■■■■■ 6.77
C1QTNF1-210ENST00000582295 NACADO15069 1562 aa56.96■■■■■ 6.71
C1QTNF1-210ENST00000582295 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.74■■■■■ 6.67
C1QTNF1-210ENST00000582295 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.32■■■■■ 6.61
C1QTNF1-210ENST00000582295 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.31■■■■■ 6.6
C1QTNF1-210ENST00000582295 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.18■■■■■ 6.58
C1QTNF1-210ENST00000582295 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.05■■■■■ 6.56
C1QTNF1-210ENST00000582295 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.88■■■■■ 6.54
C1QTNF1-210ENST00000582295 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.63■■■■■ 6.5
C1QTNF1-210ENST00000582295 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.42■■■■■ 6.46
C1QTNF1-210ENST00000582295 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.97■■■■■ 6.39
C1QTNF1-210ENST00000582295 SCRIBQ14160 1630 aa54.92■■■■■ 6.38
C1QTNF1-210ENST00000582295 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.57■■■■■ 6.33
C1QTNF1-210ENST00000582295 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.42■■■■■ 6.3
C1QTNF1-210ENST00000582295 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.34■■■■■ 6.29
C1QTNF1-210ENST00000582295 NCAPD3P42695 1498 aa52.58■■■■■ 6.01
C1QTNF1-210ENST00000582295 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.43■■■■■ 5.98
C1QTNF1-210ENST00000582295 SMARCA4P51532 1647 aa52.4■■■■■ 5.98
C1QTNF1-210ENST00000582295 HMGXB3Q12766 1538 aa52.24■■■■■ 5.95
C1QTNF1-210ENST00000582295 SMARCA2P51531 1590 aa52.23■■■■■ 5.95
C1QTNF1-210ENST00000582295 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.05■■■■■ 5.92
C1QTNF1-210ENST00000582295 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.04■■■■■ 5.92
C1QTNF1-210ENST00000582295 CUX2O14529 1486 aa52.03■■■■■ 5.92
C1QTNF1-210ENST00000582295 ERCC6Q03468 1493 aa51.99■■■■■ 5.91
C1QTNF1-210ENST00000582295 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.93■■■■■ 5.9
C1QTNF1-210ENST00000582295 NESP48681 1621 aa51.86■■■■■ 5.89
C1QTNF1-210ENST00000582295 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.86■■■■■ 5.89
C1QTNF1-210ENST00000582295 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.73■■■■■ 5.87
C1QTNF1-210ENST00000582295 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.45■■■■■ 5.83
C1QTNF1-210ENST00000582295 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.43■■■■■ 5.82
C1QTNF1-210ENST00000582295 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.26■■■■■ 5.8
C1QTNF1-210ENST00000582295 WIZO95785 1651 aa51.12■■■■■ 5.77
C1QTNF1-210ENST00000582295 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.01■■■■■ 5.76
C1QTNF1-210ENST00000582295 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.91■■■■■ 5.74
C1QTNF1-210ENST00000582295 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.69■■■■■ 5.7
C1QTNF1-210ENST00000582295 WDR62O43379 1518 aa50.65■■■■■ 5.7
C1QTNF1-210ENST00000582295 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.54■■■■■ 5.68
C1QTNF1-210ENST00000582295 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.43■■■■■ 5.66
C1QTNF1-210ENST00000582295 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.43■■■■■ 5.66
C1QTNF1-210ENST00000582295 CFTRP13569 1480 aa50.39■■■■■ 5.66
C1QTNF1-210ENST00000582295 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.38■■■■■ 5.66
C1QTNF1-210ENST00000582295 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.06■■■■■ 5.6
C1QTNF1-210ENST00000582295 PRDM2Q13029 1718 aa50.01■■■■■ 5.6
C1QTNF1-210ENST00000582295 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.82■■■■■ 5.57
C1QTNF1-210ENST00000582295 TRIM41Q8WV44 630 aa49.63■■■■■ 5.54
C1QTNF1-210ENST00000582295 TOPBP1Q92547 1522 aa49.46■■■■■ 5.51
C1QTNF1-210ENST00000582295 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.46■■■■■ 5.51
C1QTNF1-210ENST00000582295 OSCARQ8IYS5 282 aa49.44■■■■■ 5.51
C1QTNF1-210ENST00000582295 IFT140Q96RY7 1462 aa49.42■■■■■ 5.5
C1QTNF1-210ENST00000582295 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.28■■■■■ 5.48
C1QTNF1-210ENST00000582295 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.23■■■■■ 5.47
C1QTNF1-210ENST00000582295 ABCC8Q09428 1581 aa49.2■■■■■ 5.47
C1QTNF1-210ENST00000582295 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.12■■■■■ 5.45
C1QTNF1-210ENST00000582295 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.1■■■■■ 5.45
C1QTNF1-210ENST00000582295 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.1■■■■■ 5.45
C1QTNF1-210ENST00000582295 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.1■■■■■ 5.45
C1QTNF1-210ENST00000582295 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.96■■■■■ 5.43
C1QTNF1-210ENST00000582295 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.92■■■■■ 5.42
C1QTNF1-210ENST00000582295 CHD1O14646 1710 aa48.89■■■■■ 5.42
C1QTNF1-210ENST00000582295 ARHGEF11O15085 1522 aa48.89■■■■■ 5.42
C1QTNF1-210ENST00000582295 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.76■■■■■ 5.4
C1QTNF1-210ENST00000582295 CUX1P39880 1505 aa48.62■■■■■ 5.37
C1QTNF1-210ENST00000582295 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.61■■■■■ 5.37
C1QTNF1-210ENST00000582295 SOGA1O94964 1423 aa48.6■■■■■ 5.37
C1QTNF1-210ENST00000582295 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.54■■■■■ 5.36
C1QTNF1-210ENST00000582295 WDR97A6NE52 1622 aa48.52■■■■■ 5.36
C1QTNF1-210ENST00000582295 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.45■■■■■ 5.35
C1QTNF1-210ENST00000582295 ARAP1Q96P48 1450 aa48.43■■■■■ 5.34
C1QTNF1-210ENST00000582295 FBLN2P98095 1184 aa48.4■■■■■ 5.34
C1QTNF1-210ENST00000582295 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.33■■■■■ 5.33
C1QTNF1-210ENST00000582295 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.33■■■■■ 5.33
C1QTNF1-210ENST00000582295 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.29■■■■■ 5.32
C1QTNF1-210ENST00000582295 GRIN2BQ13224 1484 aa48.23■■■■■ 5.31
C1QTNF1-210ENST00000582295 PBRM1Q86U86 1689 aa48.2■■■■■ 5.31
C1QTNF1-210ENST00000582295 SYNJ1O43426 1573 aa48.15■■■■■ 5.3
C1QTNF1-210ENST00000582295 SYNJ2O15056 1496 aa48.12■■■■■ 5.29
C1QTNF1-210ENST00000582295 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.1■■■■■ 5.29
C1QTNF1-210ENST00000582295 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.06■■■■■ 5.28
C1QTNF1-210ENST00000582295 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.05■■■■■ 5.28
C1QTNF1-210ENST00000582295 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.04■■■■■ 5.28
C1QTNF1-210ENST00000582295 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.99■■■■■ 5.27
C1QTNF1-210ENST00000582295 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.83■■■■■ 5.25
C1QTNF1-210ENST00000582295 TOP2BQ02880 1626 aa47.78■■■■■ 5.24
C1QTNF1-210ENST00000582295 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.74■■■■■ 5.23
C1QTNF1-210ENST00000582295 ADAMTS12P58397 1594 aa47.73■■■■■ 5.23
C1QTNF1-210ENST00000582295 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.73■■■■■ 5.23
C1QTNF1-210ENST00000582295 GRIN2AQ12879 1464 aa47.67■■■■■ 5.22
C1QTNF1-210ENST00000582295 CEP170Q5SW79 1584 aa47.61■■■■■ 5.21
C1QTNF1-210ENST00000582295 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.6■■■■■ 5.21
C1QTNF1-210ENST00000582295 NUP160Q12769 1436 aa47.55■■■■■ 5.2
C1QTNF1-210ENST00000582295 SHROOM2Q13796 1616 aa47.45■■■■■ 5.19
C1QTNF1-210ENST00000582295 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.44■■■■■ 5.18
C1QTNF1-210ENST00000582295 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.42■■■■■ 5.18
C1QTNF1-210ENST00000582295 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.09■■■■■ 5.13
C1QTNF1-210ENST00000582295 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47■■■■■ 5.11
C1QTNF1-210ENST00000582295 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.87■■■■■ 5.09
C1QTNF1-210ENST00000582295 JPH4Q96JJ6 628 aa46.86■■■■■ 5.09
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