RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581710.5

LGALS9-213, Transcript of galectin 9, humanhuman

TSL 2

Gene LGALS9, Length 754 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9-213ENST00000581710 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.01■■■■■ 7.84
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LGALS9-213ENST00000581710 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.87■■■■■ 6.21
LGALS9-213ENST00000581710 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.84■■■■■ 6.21
LGALS9-213ENST00000581710 NACADO15069 1562 aa53.71■■■■■ 6.19
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LGALS9-213ENST00000581710 SMARCA2P51531 1590 aa49.46■■■■■ 5.51
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LGALS9-213ENST00000581710 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.2■■■■■ 5.47
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LGALS9-213ENST00000581710 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.58■■■■■ 5.21
LGALS9-213ENST00000581710 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.57■■■■■ 5.21
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LGALS9-213ENST00000581710 WDR97A6NE52 1622 aa45.82■■■■■ 4.93
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LGALS9-213ENST00000581710 TOP2BQ02880 1626 aa45.77■■■■■ 4.92
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LGALS9-213ENST00000581710 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.76■■■■■ 4.92
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LGALS9-213ENST00000581710 ARHGEF11O15085 1522 aa45.31■■■■■ 4.84
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LGALS9-213ENST00000581710 CEP170Q5SW79 1584 aa44.9■■■■■ 4.78
LGALS9-213ENST00000581710 IGF1RP08069 1367 aa44.86■■■■■ 4.77
LGALS9-213ENST00000581710 CUL7Q14999 1698 aa44.64■■■■■ 4.74
LGALS9-213ENST00000581710 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.61■■■■■ 4.73
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LGALS9-213ENST00000581710 JPH4Q96JJ6 628 aa44.54■■■■■ 4.72
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