RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581598.1

CCDC42-203, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC42, Length 538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-203ENST00000581598 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.1■■■■■ 5.93
CCDC42-203ENST00000581598 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.69■■■■■ 5.07
CCDC42-203ENST00000581598 ABCC9O60706 1549 aa46.21■■■■■ 4.99
CCDC42-203ENST00000581598 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.24■■■■■ 4.67
CCDC42-203ENST00000581598 NACADO15069 1562 aa44.05■■■■■ 4.64
CCDC42-203ENST00000581598 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.64■■■■■ 4.58
CCDC42-203ENST00000581598 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.62■■■■■ 4.57
CCDC42-203ENST00000581598 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.45■■■■■ 4.55
CCDC42-203ENST00000581598 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
CCDC42-203ENST00000581598 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.24■■■■■ 4.51
CCDC42-203ENST00000581598 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.15■■■■■ 4.5
CCDC42-203ENST00000581598 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.02■■■■■ 4.48
CCDC42-203ENST00000581598 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.92■■■■■ 4.46
CCDC42-203ENST00000581598 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.49■■■■■ 4.39
CCDC42-203ENST00000581598 SCRIBQ14160 1630 aa42.42■■■■■ 4.38
CCDC42-203ENST00000581598 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
CCDC42-203ENST00000581598 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.84■■■■■ 4.29
CCDC42-203ENST00000581598 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.64■■■■■ 4.26
CCDC42-203ENST00000581598 NCAPD3P42695 1498 aa40.64■■■■■ 4.1
CCDC42-203ENST00000581598 SMARCA4P51532 1647 aa40.58■■■■■ 4.09
CCDC42-203ENST00000581598 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.53■■■■■ 4.08
CCDC42-203ENST00000581598 SMARCA2P51531 1590 aa40.47■■■■■ 4.07
CCDC42-203ENST00000581598 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
CCDC42-203ENST00000581598 HMGXB3Q12766 1538 aa40.38■■■■■ 4.06
CCDC42-203ENST00000581598 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.25■■■■■ 4.03
CCDC42-203ENST00000581598 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
CCDC42-203ENST00000581598 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.1■■■■■ 4.01
CCDC42-203ENST00000581598 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.99■■■■□ 3.99
CCDC42-203ENST00000581598 ERCC6Q03468 1493 aa39.89■■■■□ 3.98
CCDC42-203ENST00000581598 CUX2O14529 1486 aa39.81■■■■□ 3.96
CCDC42-203ENST00000581598 NESP48681 1621 aa39.8■■■■□ 3.96
CCDC42-203ENST00000581598 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.67■■■■□ 3.94
CCDC42-203ENST00000581598 WIZO95785 1651 aa39.64■■■■□ 3.94
CCDC42-203ENST00000581598 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
CCDC42-203ENST00000581598 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
CCDC42-203ENST00000581598 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.4■■■■□ 3.9
CCDC42-203ENST00000581598 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.38■■■■□ 3.89
CCDC42-203ENST00000581598 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.35■■■■□ 3.89
CCDC42-203ENST00000581598 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
CCDC42-203ENST00000581598 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.04■■■■□ 3.84
CCDC42-203ENST00000581598 CFTRP13569 1480 aa39.03■■■■□ 3.84
CCDC42-203ENST00000581598 WDR62O43379 1518 aa38.96■■■■□ 3.83
CCDC42-203ENST00000581598 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.94■■■■□ 3.82
CCDC42-203ENST00000581598 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.92■■■■□ 3.82
CCDC42-203ENST00000581598 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.73■■■■□ 3.79
CCDC42-203ENST00000581598 PRDM2Q13029 1718 aa38.72■■■■□ 3.79
CCDC42-203ENST00000581598 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.58■■■■□ 3.77
CCDC42-203ENST00000581598 ABCC8Q09428 1581 aa38.23■■■■□ 3.71
CCDC42-203ENST00000581598 TOPBP1Q92547 1522 aa38.23■■■■□ 3.71
CCDC42-203ENST00000581598 IFT140Q96RY7 1462 aa38.17■■■■□ 3.7
CCDC42-203ENST00000581598 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.14■■■■□ 3.7
CCDC42-203ENST00000581598 TRIM41Q8WV44 630 aa38.06■■■■□ 3.68
CCDC42-203ENST00000581598 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.02■■■■□ 3.68
CCDC42-203ENST00000581598 OSCARQ8IYS5 282 aa37.97■■■■□ 3.67
CCDC42-203ENST00000581598 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
CCDC42-203ENST00000581598 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
CCDC42-203ENST00000581598 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
CCDC42-203ENST00000581598 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
CCDC42-203ENST00000581598 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.7■■■■□ 3.63
CCDC42-203ENST00000581598 CUX1P39880 1505 aa37.67■■■■□ 3.62
CCDC42-203ENST00000581598 SOGA1O94964 1423 aa37.67■■■■□ 3.62
CCDC42-203ENST00000581598 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.65■■■■□ 3.62
CCDC42-203ENST00000581598 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.64■■■■□ 3.62
CCDC42-203ENST00000581598 WDR97A6NE52 1622 aa37.62■■■■□ 3.61
CCDC42-203ENST00000581598 CHD1O14646 1710 aa37.53■■■■□ 3.6
CCDC42-203ENST00000581598 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.59
CCDC42-203ENST00000581598 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.47■■■■□ 3.59
CCDC42-203ENST00000581598 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.47■■■■□ 3.59
CCDC42-203ENST00000581598 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.47■■■■□ 3.59
CCDC42-203ENST00000581598 ARHGEF11O15085 1522 aa37.39■■■■□ 3.58
CCDC42-203ENST00000581598 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.35■■■■□ 3.57
CCDC42-203ENST00000581598 GRIN2BQ13224 1484 aa37.34■■■■□ 3.57
CCDC42-203ENST00000581598 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
CCDC42-203ENST00000581598 FBLN2P98095 1184 aa37.32■■■■□ 3.56
CCDC42-203ENST00000581598 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.3■■■■□ 3.56
CCDC42-203ENST00000581598 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.23■■■■□ 3.55
CCDC42-203ENST00000581598 PBRM1Q86U86 1689 aa37.22■■■■□ 3.55
CCDC42-203ENST00000581598 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.21■■■■□ 3.55
CCDC42-203ENST00000581598 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.21■■■■□ 3.55
CCDC42-203ENST00000581598 TOP2BQ02880 1626 aa37.2■■■■□ 3.55
CCDC42-203ENST00000581598 SYNJ2O15056 1496 aa37.18■■■■□ 3.54
CCDC42-203ENST00000581598 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.17■■■■□ 3.54
CCDC42-203ENST00000581598 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
CCDC42-203ENST00000581598 SYNJ1O43426 1573 aa37.14■■■■□ 3.54
CCDC42-203ENST00000581598 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.14■■■■□ 3.54
CCDC42-203ENST00000581598 ARAP1Q96P48 1450 aa37.03■■■■□ 3.52
CCDC42-203ENST00000581598 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37■■■■□ 3.51
CCDC42-203ENST00000581598 ADAMTS12P58397 1594 aa36.89■■■■□ 3.5
CCDC42-203ENST00000581598 GRIN2AQ12879 1464 aa36.85■■■■□ 3.49
CCDC42-203ENST00000581598 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.85■■■■□ 3.49
CCDC42-203ENST00000581598 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.79■■■■□ 3.48
CCDC42-203ENST00000581598 NUP160Q12769 1436 aa36.75■■■■□ 3.47
CCDC42-203ENST00000581598 CEP170Q5SW79 1584 aa36.7■■■■□ 3.46
CCDC42-203ENST00000581598 SHROOM2Q13796 1616 aa36.57■■■■□ 3.44
CCDC42-203ENST00000581598 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
CCDC42-203ENST00000581598 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.5■■■■□ 3.43
CCDC42-203ENST00000581598 KIF27Q86VH2 1401 aa36.45■■■■□ 3.43
CCDC42-203ENST00000581598 IGF1RP08069 1367 aa36.4■■■■□ 3.42
CCDC42-203ENST00000581598 CUL7Q14999 1698 aa36.37■■■■□ 3.41
CCDC42-203ENST00000581598 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.36■■■■□ 3.41
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