RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580991.1

IFT20-211, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 4

Gene IFT20, Length 554 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-211ENST00000580991 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.6■■■■□ 3.61
IFT20-211ENST00000580991 ABCC9O60706 1549 aa34.55■■■■□ 3.12
IFT20-211ENST00000580991 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34■■■■□ 3.03
IFT20-211ENST00000580991 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.93■■■□□ 2.86
IFT20-211ENST00000580991 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.66■■■□□ 2.82
IFT20-211ENST00000580991 NACADO15069 1562 aa32.3■■■□□ 2.76
IFT20-211ENST00000580991 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.08■■■□□ 2.73
IFT20-211ENST00000580991 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32■■■□□ 2.71
IFT20-211ENST00000580991 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.88■■■□□ 2.69
IFT20-211ENST00000580991 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.7■■■□□ 2.67
IFT20-211ENST00000580991 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.67■■■□□ 2.66
IFT20-211ENST00000580991 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.27■■■□□ 2.6
IFT20-211ENST00000580991 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.21■■■□□ 2.59
IFT20-211ENST00000580991 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.18■■■□□ 2.58
IFT20-211ENST00000580991 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.03■■■□□ 2.56
IFT20-211ENST00000580991 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
IFT20-211ENST00000580991 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
IFT20-211ENST00000580991 SCRIBQ14160 1630 aa30.91■■■□□ 2.54
IFT20-211ENST00000580991 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.71■■■□□ 2.51
IFT20-211ENST00000580991 CUX2O14529 1486 aa30.06■■■□□ 2.4
IFT20-211ENST00000580991 ERCC6Q03468 1493 aa29.9■■■□□ 2.38
IFT20-211ENST00000580991 NCAPD3P42695 1498 aa29.83■■■□□ 2.37
IFT20-211ENST00000580991 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.63■■■□□ 2.33
IFT20-211ENST00000580991 SMARCA2P51531 1590 aa29.54■■■□□ 2.32
IFT20-211ENST00000580991 HMGXB3Q12766 1538 aa29.54■■■□□ 2.32
IFT20-211ENST00000580991 NESP48681 1621 aa29.5■■■□□ 2.31
IFT20-211ENST00000580991 SMARCA4P51532 1647 aa29.45■■■□□ 2.3
IFT20-211ENST00000580991 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
IFT20-211ENST00000580991 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
IFT20-211ENST00000580991 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.24■■■□□ 2.27
IFT20-211ENST00000580991 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
IFT20-211ENST00000580991 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.18■■■□□ 2.26
IFT20-211ENST00000580991 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.11■■■□□ 2.25
IFT20-211ENST00000580991 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.11■■■□□ 2.25
IFT20-211ENST00000580991 TRIM41Q8WV44 630 aa29.1■■■□□ 2.25
IFT20-211ENST00000580991 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.94■■■□□ 2.22
IFT20-211ENST00000580991 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.89■■■□□ 2.22
IFT20-211ENST00000580991 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.87■■■□□ 2.21
IFT20-211ENST00000580991 WDR62O43379 1518 aa28.81■■■□□ 2.2
IFT20-211ENST00000580991 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.64■■■□□ 2.17
IFT20-211ENST00000580991 OSCARQ8IYS5 282 aa28.6■■■□□ 2.17
IFT20-211ENST00000580991 WIZO95785 1651 aa28.56■■■□□ 2.16
IFT20-211ENST00000580991 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.55■■■□□ 2.16
IFT20-211ENST00000580991 CFTRP13569 1480 aa28.43■■■□□ 2.14
IFT20-211ENST00000580991 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
IFT20-211ENST00000580991 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.25■■■□□ 2.11
IFT20-211ENST00000580991 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.25■■■□□ 2.11
IFT20-211ENST00000580991 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.25■■■□□ 2.11
IFT20-211ENST00000580991 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
IFT20-211ENST00000580991 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
IFT20-211ENST00000580991 ARHGEF11O15085 1522 aa28.12■■■□□ 2.09
IFT20-211ENST00000580991 IFT140Q96RY7 1462 aa28.09■■■□□ 2.09
IFT20-211ENST00000580991 PRDM2Q13029 1718 aa28.08■■■□□ 2.09
IFT20-211ENST00000580991 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.08
IFT20-211ENST00000580991 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.96■■■□□ 2.07
IFT20-211ENST00000580991 TOPBP1Q92547 1522 aa27.93■■■□□ 2.06
IFT20-211ENST00000580991 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
IFT20-211ENST00000580991 ABCC8Q09428 1581 aa27.88■■■□□ 2.05
IFT20-211ENST00000580991 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.86■■■□□ 2.05
IFT20-211ENST00000580991 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
IFT20-211ENST00000580991 CHD1O14646 1710 aa27.8■■■□□ 2.04
IFT20-211ENST00000580991 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.78■■■□□ 2.04
IFT20-211ENST00000580991 ARAP1Q96P48 1450 aa27.78■■■□□ 2.04
IFT20-211ENST00000580991 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.76■■■□□ 2.04
IFT20-211ENST00000580991 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
IFT20-211ENST00000580991 FBLN2P98095 1184 aa27.72■■■□□ 2.03
IFT20-211ENST00000580991 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
IFT20-211ENST00000580991 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.51■■■□□ 2
IFT20-211ENST00000580991 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
IFT20-211ENST00000580991 SOGA1O94964 1423 aa27.5■■□□□ 1.99
IFT20-211ENST00000580991 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
IFT20-211ENST00000580991 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.47■■□□□ 1.99
IFT20-211ENST00000580991 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.45■■□□□ 1.99
IFT20-211ENST00000580991 WDR97A6NE52 1622 aa27.44■■□□□ 1.98
IFT20-211ENST00000580991 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
IFT20-211ENST00000580991 SYNJ1O43426 1573 aa27.43■■□□□ 1.98
IFT20-211ENST00000580991 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
IFT20-211ENST00000580991 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.35■■□□□ 1.97
IFT20-211ENST00000580991 GRIN2BQ13224 1484 aa27.32■■□□□ 1.96
IFT20-211ENST00000580991 SYNJ2O15056 1496 aa27.31■■□□□ 1.96
IFT20-211ENST00000580991 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.24■■□□□ 1.95
IFT20-211ENST00000580991 CUX1P39880 1505 aa27.23■■□□□ 1.95
IFT20-211ENST00000580991 PBRM1Q86U86 1689 aa27.14■■□□□ 1.94
IFT20-211ENST00000580991 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.02■■□□□ 1.92
IFT20-211ENST00000580991 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.01■■□□□ 1.92
IFT20-211ENST00000580991 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.98■■□□□ 1.91
IFT20-211ENST00000580991 GRIN2AQ12879 1464 aa26.97■■□□□ 1.91
IFT20-211ENST00000580991 CEP170Q5SW79 1584 aa26.92■■□□□ 1.9
IFT20-211ENST00000580991 NUP160Q12769 1436 aa26.9■■□□□ 1.9
IFT20-211ENST00000580991 ADAMTS12P58397 1594 aa26.85■■□□□ 1.89
IFT20-211ENST00000580991 SHROOM2Q13796 1616 aa26.84■■□□□ 1.89
IFT20-211ENST00000580991 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
IFT20-211ENST00000580991 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.8■■□□□ 1.88
IFT20-211ENST00000580991 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.78■■□□□ 1.88
IFT20-211ENST00000580991 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
IFT20-211ENST00000580991 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.68■■□□□ 1.86
IFT20-211ENST00000580991 TOP2BQ02880 1626 aa26.65■■□□□ 1.86
IFT20-211ENST00000580991 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.65■■□□□ 1.86
IFT20-211ENST00000580991 JPH4Q96JJ6 628 aa26.63■■□□□ 1.85
IFT20-211ENST00000580991 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.62■■□□□ 1.85
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