RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580741.5

LINC00271-207, long intergenic non-protein coding RNA 271, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC00271, Length 596 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271-207ENST00000580741 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.84■■■■■ 8.13
LINC00271-207ENST00000580741 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.62■■■■■ 6.97
LINC00271-207ENST00000580741 ABCC9O60706 1549 aa57.93■■■■■ 6.86
LINC00271-207ENST00000580741 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.41■■■■■ 6.46
LINC00271-207ENST00000580741 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.3■■■■■ 6.44
LINC00271-207ENST00000580741 NACADO15069 1562 aa55.23■■■■■ 6.43
LINC00271-207ENST00000580741 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.77■■■■■ 6.36
LINC00271-207ENST00000580741 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.72■■■■■ 6.35
LINC00271-207ENST00000580741 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.36■■■■■ 6.29
LINC00271-207ENST00000580741 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.16■■■■■ 6.26
LINC00271-207ENST00000580741 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.11■■■■■ 6.25
LINC00271-207ENST00000580741 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.81■■■■■ 6.2
LINC00271-207ENST00000580741 SCRIBQ14160 1630 aa53.61■■■■■ 6.17
LINC00271-207ENST00000580741 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.57■■■■■ 6.17
LINC00271-207ENST00000580741 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.07■■■■■ 6.09
LINC00271-207ENST00000580741 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.42■■■■■ 5.98
LINC00271-207ENST00000580741 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.32■■■■■ 5.97
LINC00271-207ENST00000580741 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.05■■■■■ 5.92
LINC00271-207ENST00000580741 SMARCA4P51532 1647 aa51.17■■■■■ 5.78
LINC00271-207ENST00000580741 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.02■■■■■ 5.76
LINC00271-207ENST00000580741 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.02■■■■■ 5.76
LINC00271-207ENST00000580741 NCAPD3P42695 1498 aa51■■■■■ 5.75
LINC00271-207ENST00000580741 SMARCA2P51531 1590 aa50.87■■■■■ 5.73
LINC00271-207ENST00000580741 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.79■■■■■ 5.72
LINC00271-207ENST00000580741 HMGXB3Q12766 1538 aa50.69■■■■■ 5.71
LINC00271-207ENST00000580741 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.62■■■■■ 5.69
LINC00271-207ENST00000580741 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.57■■■■■ 5.69
LINC00271-207ENST00000580741 WIZO95785 1651 aa50.22■■■■■ 5.63
LINC00271-207ENST00000580741 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.04■■■■■ 5.6
LINC00271-207ENST00000580741 NESP48681 1621 aa50.02■■■■■ 5.6
LINC00271-207ENST00000580741 ERCC6Q03468 1493 aa49.92■■■■■ 5.58
LINC00271-207ENST00000580741 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.7■■■■■ 5.55
LINC00271-207ENST00000580741 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.61■■■■■ 5.53
LINC00271-207ENST00000580741 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.53■■■■■ 5.52
LINC00271-207ENST00000580741 CUX2O14529 1486 aa49.45■■■■■ 5.51
LINC00271-207ENST00000580741 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.41■■■■■ 5.5
LINC00271-207ENST00000580741 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.34■■■■■ 5.49
LINC00271-207ENST00000580741 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.27■■■■■ 5.48
LINC00271-207ENST00000580741 CFTRP13569 1480 aa49.13■■■■■ 5.46
LINC00271-207ENST00000580741 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.07■■■■■ 5.45
LINC00271-207ENST00000580741 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.99■■■■■ 5.43
LINC00271-207ENST00000580741 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.95■■■■■ 5.43
LINC00271-207ENST00000580741 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.94■■■■■ 5.43
LINC00271-207ENST00000580741 WDR62O43379 1518 aa48.78■■■■■ 5.4
LINC00271-207ENST00000580741 PRDM2Q13029 1718 aa48.65■■■■■ 5.38
LINC00271-207ENST00000580741 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.58■■■■■ 5.37
LINC00271-207ENST00000580741 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.54■■■■■ 5.36
LINC00271-207ENST00000580741 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.46■■■■■ 5.35
LINC00271-207ENST00000580741 TOPBP1Q92547 1522 aa48.16■■■■■ 5.3
LINC00271-207ENST00000580741 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.03■■■■■ 5.28
LINC00271-207ENST00000580741 ABCC8Q09428 1581 aa48.01■■■■■ 5.28
LINC00271-207ENST00000580741 IFT140Q96RY7 1462 aa47.91■■■■■ 5.26
LINC00271-207ENST00000580741 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.82■■■■■ 5.25
LINC00271-207ENST00000580741 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.72■■■■■ 5.23
LINC00271-207ENST00000580741 CUX1P39880 1505 aa47.66■■■■■ 5.22
LINC00271-207ENST00000580741 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.63■■■■■ 5.21
LINC00271-207ENST00000580741 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.58■■■■■ 5.21
LINC00271-207ENST00000580741 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.57■■■■■ 5.21
LINC00271-207ENST00000580741 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.56■■■■■ 5.2
LINC00271-207ENST00000580741 SOGA1O94964 1423 aa47.52■■■■■ 5.2
LINC00271-207ENST00000580741 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.49■■■■■ 5.19
LINC00271-207ENST00000580741 OSCARQ8IYS5 282 aa47.37■■■■■ 5.17
LINC00271-207ENST00000580741 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.36■■■■■ 5.17
LINC00271-207ENST00000580741 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.19■■■■■ 5.14
LINC00271-207ENST00000580741 WDR97A6NE52 1622 aa47.12■■■■■ 5.13
LINC00271-207ENST00000580741 SYNJ1O43426 1573 aa47.12■■■■■ 5.13
LINC00271-207ENST00000580741 TOP2BQ02880 1626 aa47.08■■■■■ 5.13
LINC00271-207ENST00000580741 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.07■■■■■ 5.13
LINC00271-207ENST00000580741 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.04■■■■■ 5.12
LINC00271-207ENST00000580741 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.03■■■■■ 5.12
LINC00271-207ENST00000580741 FBLN2P98095 1184 aa47.03■■■■■ 5.12
LINC00271-207ENST00000580741 CHD1O14646 1710 aa47.02■■■■■ 5.12
LINC00271-207ENST00000580741 GRIN2BQ13224 1484 aa46.99■■■■■ 5.11
LINC00271-207ENST00000580741 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.95■■■■■ 5.11
LINC00271-207ENST00000580741 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.89■■■■■ 5.1
LINC00271-207ENST00000580741 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.88■■■■■ 5.09
LINC00271-207ENST00000580741 PBRM1Q86U86 1689 aa46.85■■■■■ 5.09
LINC00271-207ENST00000580741 TRIM41Q8WV44 630 aa46.82■■■■■ 5.09
LINC00271-207ENST00000580741 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.78■■■■■ 5.08
LINC00271-207ENST00000580741 SYNJ2O15056 1496 aa46.73■■■■■ 5.07
LINC00271-207ENST00000580741 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.68■■■■■ 5.06
LINC00271-207ENST00000580741 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.68■■■■■ 5.06
LINC00271-207ENST00000580741 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.68■■■■■ 5.06
LINC00271-207ENST00000580741 ARHGEF11O15085 1522 aa46.64■■■■■ 5.06
LINC00271-207ENST00000580741 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.51■■■■■ 5.04
LINC00271-207ENST00000580741 ADAMTS12P58397 1594 aa46.49■■■■■ 5.03
LINC00271-207ENST00000580741 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.44■■■■■ 5.03
LINC00271-207ENST00000580741 GRIN2AQ12879 1464 aa46.39■■■■■ 5.02
LINC00271-207ENST00000580741 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.38■■■■■ 5.02
LINC00271-207ENST00000580741 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.28■■■■■ 5
LINC00271-207ENST00000580741 ARAP1Q96P48 1450 aa46.27■■■■■ 5
LINC00271-207ENST00000580741 KIF27Q86VH2 1401 aa46.21■■■■■ 4.99
LINC00271-207ENST00000580741 CEP170Q5SW79 1584 aa46.21■■■■■ 4.99
LINC00271-207ENST00000580741 NUP160Q12769 1436 aa46.2■■■■■ 4.99
LINC00271-207ENST00000580741 IGF1RP08069 1367 aa46.1■■■■■ 4.97
LINC00271-207ENST00000580741 CUL7Q14999 1698 aa45.93■■■■■ 4.94
LINC00271-207ENST00000580741 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.92■■■■■ 4.94
LINC00271-207ENST00000580741 SHROOM2Q13796 1616 aa45.86■■■■■ 4.93
LINC00271-207ENST00000580741 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.82■■■■■ 4.93
LINC00271-207ENST00000580741 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.81■■■■■ 4.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms