RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580691.5

CYB561-211, Transcript of cytochrome b561, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CYB561, Length 1,127 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561-211ENST00000580691 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.81■■■■■ 6.52
CYB561-211ENST00000580691 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.73■■■■■ 5.55
CYB561-211ENST00000580691 ABCC9O60706 1549 aa48.71■■■■■ 5.39
CYB561-211ENST00000580691 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.93■■■■■ 5.1
CYB561-211ENST00000580691 NACADO15069 1562 aa46.86■■■■■ 5.09
CYB561-211ENST00000580691 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.66■■■■■ 5.06
CYB561-211ENST00000580691 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.59■■■■■ 5.05
CYB561-211ENST00000580691 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.03
CYB561-211ENST00000580691 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.28■■■■■ 5
CYB561-211ENST00000580691 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.61■■■■■ 4.89
CYB561-211ENST00000580691 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.47■■■■■ 4.87
CYB561-211ENST00000580691 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.35■■■■■ 4.85
CYB561-211ENST00000580691 SCRIBQ14160 1630 aa45.22■■■■■ 4.83
CYB561-211ENST00000580691 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.17■■■■■ 4.82
CYB561-211ENST00000580691 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.78■■■■■ 4.76
CYB561-211ENST00000580691 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
CYB561-211ENST00000580691 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.08■■■■■ 4.65
CYB561-211ENST00000580691 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.87■■■■■ 4.61
CYB561-211ENST00000580691 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
CYB561-211ENST00000580691 SMARCA4P51532 1647 aa43.3■■■■■ 4.52
CYB561-211ENST00000580691 NCAPD3P42695 1498 aa43.22■■■■■ 4.51
CYB561-211ENST00000580691 SMARCA2P51531 1590 aa43.18■■■■■ 4.5
CYB561-211ENST00000580691 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.16■■■■■ 4.5
CYB561-211ENST00000580691 HMGXB3Q12766 1538 aa42.99■■■■■ 4.47
CYB561-211ENST00000580691 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.96■■■■■ 4.47
CYB561-211ENST00000580691 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.91■■■■■ 4.46
CYB561-211ENST00000580691 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
CYB561-211ENST00000580691 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
CYB561-211ENST00000580691 WIZO95785 1651 aa42.39■■■■■ 4.38
CYB561-211ENST00000580691 ERCC6Q03468 1493 aa42.12■■■■■ 4.33
CYB561-211ENST00000580691 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.11■■■■■ 4.33
CYB561-211ENST00000580691 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
CYB561-211ENST00000580691 NESP48681 1621 aa42.04■■■■■ 4.32
CYB561-211ENST00000580691 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.95■■■■■ 4.31
CYB561-211ENST00000580691 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.89■■■■■ 4.3
CYB561-211ENST00000580691 CUX2O14529 1486 aa41.8■■■■■ 4.28
CYB561-211ENST00000580691 CFTRP13569 1480 aa41.65■■■■■ 4.26
CYB561-211ENST00000580691 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.54■■■■■ 4.24
CYB561-211ENST00000580691 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.53■■■■■ 4.24
CYB561-211ENST00000580691 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
CYB561-211ENST00000580691 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.42■■■■■ 4.22
CYB561-211ENST00000580691 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.42■■■■■ 4.22
CYB561-211ENST00000580691 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.39■■■■■ 4.22
CYB561-211ENST00000580691 WDR62O43379 1518 aa41.23■■■■■ 4.19
CYB561-211ENST00000580691 PRDM2Q13029 1718 aa41.22■■■■■ 4.19
CYB561-211ENST00000580691 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
CYB561-211ENST00000580691 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
CYB561-211ENST00000580691 ABCC8Q09428 1581 aa40.88■■■■■ 4.13
CYB561-211ENST00000580691 TOPBP1Q92547 1522 aa40.71■■■■■ 4.11
CYB561-211ENST00000580691 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.68■■■■■ 4.1
CYB561-211ENST00000580691 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.67■■■■■ 4.1
CYB561-211ENST00000580691 IFT140Q96RY7 1462 aa40.59■■■■■ 4.09
CYB561-211ENST00000580691 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
CYB561-211ENST00000580691 CUX1P39880 1505 aa40.29■■■■■ 4.04
CYB561-211ENST00000580691 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.03
CYB561-211ENST00000580691 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
CYB561-211ENST00000580691 SOGA1O94964 1423 aa40.23■■■■■ 4.03
CYB561-211ENST00000580691 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.21■■■■■ 4.03
CYB561-211ENST00000580691 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
CYB561-211ENST00000580691 WDR97A6NE52 1622 aa40.12■■■■■ 4.01
CYB561-211ENST00000580691 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.11■■■■■ 4.01
CYB561-211ENST00000580691 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.06■■■■■ 49e-6■■■■■ 50.1
CYB561-211ENST00000580691 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.05■■■■■ 43e-7■■■■■ 51.1
CYB561-211ENST00000580691 OSCARQ8IYS5 282 aa40.04■■■■■ 4
CYB561-211ENST00000580691 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
CYB561-211ENST00000580691 TOP2BQ02880 1626 aa39.95■■■■□ 3.99
CYB561-211ENST00000580691 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.93■■■■□ 3.98
CYB561-211ENST00000580691 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.88■■■■□ 3.97
CYB561-211ENST00000580691 SYNJ1O43426 1573 aa39.84■■■■□ 3.97
CYB561-211ENST00000580691 GRIN2BQ13224 1484 aa39.81■■■■□ 3.96
CYB561-211ENST00000580691 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.77■■■■□ 3.96
CYB561-211ENST00000580691 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
CYB561-211ENST00000580691 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.7■■■■□ 3.95
CYB561-211ENST00000580691 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.67■■■■□ 3.94
CYB561-211ENST00000580691 FBLN2P98095 1184 aa39.66■■■■□ 3.94
CYB561-211ENST00000580691 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
CYB561-211ENST00000580691 CHD1O14646 1710 aa39.6■■■■□ 3.93
CYB561-211ENST00000580691 PBRM1Q86U86 1689 aa39.58■■■■□ 3.93
CYB561-211ENST00000580691 SYNJ2O15056 1496 aa39.57■■■■□ 3.93
CYB561-211ENST00000580691 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.44■■■■□ 3.9
CYB561-211ENST00000580691 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.34■■■■□ 3.89
CYB561-211ENST00000580691 ADAMTS12P58397 1594 aa39.31■■■■□ 3.88
CYB561-211ENST00000580691 KIF27Q86VH2 1401 aa39.3■■■■□ 3.88
CYB561-211ENST00000580691 ARHGEF11O15085 1522 aa39.28■■■■□ 3.88
CYB561-211ENST00000580691 GRIN2AQ12879 1464 aa39.26■■■■□ 3.88
CYB561-211ENST00000580691 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.25■■■■□ 3.87
CYB561-211ENST00000580691 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.25■■■■□ 3.87
CYB561-211ENST00000580691 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.25■■■■□ 3.87
CYB561-211ENST00000580691 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.25■■■■□ 3.87
CYB561-211ENST00000580691 TRIM41Q8WV44 630 aa39.18■■■■□ 3.86
CYB561-211ENST00000580691 NUP160Q12769 1436 aa39.11■■■■□ 3.85
CYB561-211ENST00000580691 IGF1RP08069 1367 aa39.08■■■■□ 3.85
CYB561-211ENST00000580691 CUL7Q14999 1698 aa39.02■■■■□ 3.84
CYB561-211ENST00000580691 CEP170Q5SW79 1584 aa38.98■■■■□ 3.83
CYB561-211ENST00000580691 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.94■■■■□ 3.82
CYB561-211ENST00000580691 ARAP1Q96P48 1450 aa38.92■■■■□ 3.82
CYB561-211ENST00000580691 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.88■■■■□ 3.81
CYB561-211ENST00000580691 SHROOM2Q13796 1616 aa38.78■■■■□ 3.8
CYB561-211ENST00000580691 JPH4Q96JJ6 628 aa38.73■■■■□ 3.79
CYB561-211ENST00000580691 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.73■■■■□ 3.79
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