RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580672.5

CNDP2-211, Transcript of carnosine dipeptidase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CNDP2, Length 661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP2-211ENST00000580672 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.23■■■■■ 5.63
CNDP2-211ENST00000580672 ABCC9O60706 1549 aa45.59■■■■■ 4.89
CNDP2-211ENST00000580672 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.24■■■■■ 4.83
CNDP2-211ENST00000580672 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.24■■■■■ 4.51
CNDP2-211ENST00000580672 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.11■■■■■ 4.49
CNDP2-211ENST00000580672 NACADO15069 1562 aa42.85■■■■■ 4.45
CNDP2-211ENST00000580672 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.58■■■■■ 4.41
CNDP2-211ENST00000580672 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.39■■■■■ 4.383e-6■□□□□ 11.3
CNDP2-211ENST00000580672 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.32■■■■■ 4.37
CNDP2-211ENST00000580672 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.12■■■■■ 4.33
CNDP2-211ENST00000580672 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.01■■■■■ 4.32
CNDP2-211ENST00000580672 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
CNDP2-211ENST00000580672 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.46■■■■■ 4.23
CNDP2-211ENST00000580672 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.35■■■■■ 4.21
CNDP2-211ENST00000580672 SCRIBQ14160 1630 aa41.2■■■■■ 4.19
CNDP2-211ENST00000580672 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.18■■■■■ 4.18
CNDP2-211ENST00000580672 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.1■■■■■ 4.17
CNDP2-211ENST00000580672 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
CNDP2-211ENST00000580672 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.85■■■■□ 3.97
CNDP2-211ENST00000580672 NCAPD3P42695 1498 aa39.56■■■■□ 3.92
CNDP2-211ENST00000580672 CUX2O14529 1486 aa39.43■■■■□ 3.9
CNDP2-211ENST00000580672 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.39■■■■□ 3.9
CNDP2-211ENST00000580672 ERCC6Q03468 1493 aa39.38■■■■□ 3.9
CNDP2-211ENST00000580672 SMARCA4P51532 1647 aa39.27■■■■□ 3.88
CNDP2-211ENST00000580672 SMARCA2P51531 1590 aa39.26■■■■□ 3.88
CNDP2-211ENST00000580672 HMGXB3Q12766 1538 aa39.23■■■■□ 3.87
CNDP2-211ENST00000580672 NESP48681 1621 aa39.07■■■■□ 3.85
CNDP2-211ENST00000580672 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.84
CNDP2-211ENST00000580672 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
CNDP2-211ENST00000580672 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.88■■■■□ 3.81
CNDP2-211ENST00000580672 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.74■■■■□ 3.79
CNDP2-211ENST00000580672 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.73■■■■□ 3.79
CNDP2-211ENST00000580672 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.7■■■■□ 3.79
CNDP2-211ENST00000580672 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.58■■■■□ 3.77
CNDP2-211ENST00000580672 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.52■■■■□ 3.76
CNDP2-211ENST00000580672 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.34■■■■□ 3.73
CNDP2-211ENST00000580672 WIZO95785 1651 aa38.25■■■■□ 3.71
CNDP2-211ENST00000580672 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.2■■■■□ 3.71
CNDP2-211ENST00000580672 WDR62O43379 1518 aa38.12■■■■□ 3.69
CNDP2-211ENST00000580672 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.97■■■■□ 3.67
CNDP2-211ENST00000580672 TRIM41Q8WV44 630 aa37.95■■■■□ 3.67
CNDP2-211ENST00000580672 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.9■■■■□ 3.66
CNDP2-211ENST00000580672 CFTRP13569 1480 aa37.83■■■■□ 3.65
CNDP2-211ENST00000580672 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
CNDP2-211ENST00000580672 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
CNDP2-211ENST00000580672 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
CNDP2-211ENST00000580672 OSCARQ8IYS5 282 aa37.6■■■■□ 3.61
CNDP2-211ENST00000580672 PRDM2Q13029 1718 aa37.47■■■■□ 3.59
CNDP2-211ENST00000580672 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.3■■■■□ 3.56
CNDP2-211ENST00000580672 IFT140Q96RY7 1462 aa37.23■■■■□ 3.55
CNDP2-211ENST00000580672 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
CNDP2-211ENST00000580672 TOPBP1Q92547 1522 aa37.15■■■■□ 3.54
CNDP2-211ENST00000580672 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.15■■■■□ 3.54
CNDP2-211ENST00000580672 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.15■■■■□ 3.54
CNDP2-211ENST00000580672 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.15■■■■□ 3.54
CNDP2-211ENST00000580672 ABCC8Q09428 1581 aa37.04■■■■□ 3.52
CNDP2-211ENST00000580672 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
CNDP2-211ENST00000580672 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.99■■■■□ 3.51
CNDP2-211ENST00000580672 ARHGEF11O15085 1522 aa36.98■■■■□ 3.51
CNDP2-211ENST00000580672 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
CNDP2-211ENST00000580672 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.85■■■■□ 3.49
CNDP2-211ENST00000580672 CHD1O14646 1710 aa36.83■■■■□ 3.49
CNDP2-211ENST00000580672 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
CNDP2-211ENST00000580672 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.75■■■■□ 3.47
CNDP2-211ENST00000580672 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
CNDP2-211ENST00000580672 FBLN2P98095 1184 aa36.68■■■■□ 3.46
CNDP2-211ENST00000580672 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.63■■■■□ 3.45
CNDP2-211ENST00000580672 ARAP1Q96P48 1450 aa36.59■■■■□ 3.45
CNDP2-211ENST00000580672 SOGA1O94964 1423 aa36.58■■■■□ 3.45
CNDP2-211ENST00000580672 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
CNDP2-211ENST00000580672 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.47■■■■□ 3.43
CNDP2-211ENST00000580672 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
CNDP2-211ENST00000580672 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.44■■■■□ 3.42
CNDP2-211ENST00000580672 WDR97A6NE52 1622 aa36.44■■■■□ 3.42
CNDP2-211ENST00000580672 CUX1P39880 1505 aa36.39■■■■□ 3.42
CNDP2-211ENST00000580672 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.36■■■■□ 3.41
CNDP2-211ENST00000580672 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
CNDP2-211ENST00000580672 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
CNDP2-211ENST00000580672 SYNJ1O43426 1573 aa36.31■■■■□ 3.4
CNDP2-211ENST00000580672 GRIN2BQ13224 1484 aa36.3■■■■□ 3.4
CNDP2-211ENST00000580672 SYNJ2O15056 1496 aa36.22■■■■□ 3.39
CNDP2-211ENST00000580672 PBRM1Q86U86 1689 aa36.16■■■■□ 3.38
CNDP2-211ENST00000580672 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.13■■■■□ 3.37
CNDP2-211ENST00000580672 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.03■■■■□ 3.36
CNDP2-211ENST00000580672 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.01■■■■□ 3.36
CNDP2-211ENST00000580672 GRIN2AQ12879 1464 aa35.83■■■■□ 3.33
CNDP2-211ENST00000580672 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.82■■■■□ 3.32
CNDP2-211ENST00000580672 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.78■■■■□ 3.32
CNDP2-211ENST00000580672 ADAMTS12P58397 1594 aa35.77■■■■□ 3.32
CNDP2-211ENST00000580672 NUP160Q12769 1436 aa35.73■■■■□ 3.31
CNDP2-211ENST00000580672 CEP170Q5SW79 1584 aa35.72■■■■□ 3.31
CNDP2-211ENST00000580672 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.72■■■■□ 3.31
CNDP2-211ENST00000580672 TOP2BQ02880 1626 aa35.71■■■■□ 3.31
CNDP2-211ENST00000580672 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
CNDP2-211ENST00000580672 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.65■■■■□ 3.3
CNDP2-211ENST00000580672 SHROOM2Q13796 1616 aa35.62■■■■□ 3.29
CNDP2-211ENST00000580672 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.57■■■■□ 3.29
CNDP2-211ENST00000580672 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
CNDP2-211ENST00000580672 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.39■■■■□ 3.26
CNDP2-211ENST00000580672 JPH4Q96JJ6 628 aa35.38■■■■□ 3.25
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