RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580633.5

TSPOAP1-AS1-207, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene TSPOAP1-AS1, Length 842 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.48■■■■■ 5.99
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.76■■■■■ 5.08
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.92■■■■■ 4.62
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NACADO15069 1562 aa43.89■■■■■ 4.62
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.75■■■■■ 4.59
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.68■■■■■ 4.58
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.53■■■■■ 4.56
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.48■■■■■ 4.55
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.08■■■■■ 4.49
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.69■■■■■ 4.43
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SCRIBQ14160 1630 aa42.54■■■■■ 4.4
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.52■■■■■ 4.4
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.23■■■■■ 4.35
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.9■■■■■ 4.3
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.33■■■■■ 4.21
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.99■■■■■ 4.15
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SMARCA4P51532 1647 aa40.75■■■■■ 4.11
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NCAPD3P42695 1498 aa40.49■■■■■ 4.07
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SMARCA2P51531 1590 aa40.44■■■■■ 4.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.44■■■■■ 4.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.42■■■■■ 4.06
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 HMGXB3Q12766 1538 aa40.34■■■■■ 4.05
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 WIZO95785 1651 aa40.02■■■■■ 4
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.25■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ERCC6Q03468 1493 aa39.24■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.11■■■■□ 3.85
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.07■■■■□ 3.85
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.07■■■■□ 3.85
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CFTRP13569 1480 aa39.07■■■■□ 3.85
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.01■■■■□ 3.84
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CUX2O14529 1486 aa38.96■■■■□ 3.83
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PRDM2Q13029 1718 aa38.9■■■■□ 3.82
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.81■■■■□ 3.8
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.76■■■■□ 3.8
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.73■■■■□ 3.79
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 WDR62O43379 1518 aa38.68■■■■□ 3.78
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TOPBP1Q92547 1522 aa38.22■■■■□ 3.71
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.19■■■■□ 3.7
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ABCC8Q09428 1581 aa38.18■■■■□ 3.7
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 IFT140Q96RY7 1462 aa37.96■■■■□ 3.67
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CUX1P39880 1505 aa37.95■■■■□ 3.67
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.66■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SOGA1O94964 1423 aa37.65■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TOP2BQ02880 1626 aa37.62■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.61■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 WDR97A6NE52 1622 aa37.61■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SYNJ1O43426 1573 aa37.61■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.54■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.45■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.36■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 PBRM1Q86U86 1689 aa37.29■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 GRIN2BQ13224 1484 aa37.26■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CHD1O14646 1710 aa37.26■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.26■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.22■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 OSCARQ8IYS5 282 aa37.2■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.54
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SYNJ2O15056 1496 aa37.04■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37■■■■□ 3.51
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ADAMTS12P58397 1594 aa36.98■■■■□ 3.51
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 FBLN2P98095 1184 aa36.92■■■■□ 3.5
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.86■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.83■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 GRIN2AQ12879 1464 aa36.82■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 KIF27Q86VH2 1401 aa36.81■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.77■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.77■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.77■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ARHGEF11O15085 1522 aa36.75■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 IGF1RP08069 1367 aa36.69■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 NUP160Q12769 1436 aa36.68■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CUL7Q14999 1698 aa36.67■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CEP170Q5SW79 1584 aa36.67■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 TRIM41Q8WV44 630 aa36.55■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.52■■■■□ 3.44
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 SHROOM2Q13796 1616 aa36.48■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 ARAP1Q96P48 1450 aa36.46■■■■□ 3.43
TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.43■■■■□ 3.42
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TSPOAP1-AS1-207ENST00000580633 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.28■■■■□ 3.4
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